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百香果JAZ基因家族的鉴定及表达模式分析
1
作者
龚凤鲜
欧阳浩
+5 位作者
彭昌杨
姜雨欣
詹爱萍
胡小京
刘增亮
陈孝玉龙
《贵州大学学报(自然科学版)》
2024年第6期106-117,共12页
JAZ(jasmonate ZIM-domain,JAZ)蛋白是一类茉莉酸途径的调节因子,通过与其他信号通路相关成员互相作用,共同调节植物各类重要生命活动。为更好地了解JAZ基因家族在百香果(Passiflora edulis Sims)中系统表征并预测基因功能,本研究通过...
JAZ(jasmonate ZIM-domain,JAZ)蛋白是一类茉莉酸途径的调节因子,通过与其他信号通路相关成员互相作用,共同调节植物各类重要生命活动。为更好地了解JAZ基因家族在百香果(Passiflora edulis Sims)中系统表征并预测基因功能,本研究通过生物信息学方法对百香果JAZ基因鉴定并对其基因特征、系统进化、表达模式等进行了系统分析。结果表明:百香果全基因组编码12个JAZ基因不均匀地分布在4条染色体上,隶属6个亚家族(Group I—VI);进化分析表明,PeJAZ基因的扩增主要归因于片段复制事件;蛋白互作预测分析表明,PeJAZs蛋白具有功能多样性;转录组测序技术分析揭示了PeJAZ基因不同组织和不同胁迫下具显著的表达差异;值得关注的是,PeJAZ3可能是协助百香果抗病毒的一个潜在基因。上述发现可为进一步研究PeJAZs功能和调控机制提供了基础。
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关键词
百香果
JAZ基因家族
生物信息学分析
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职称材料
题名
百香果JAZ基因家族的鉴定及表达模式分析
1
作者
龚凤鲜
欧阳浩
彭昌杨
姜雨欣
詹爱萍
胡小京
刘增亮
陈孝玉龙
机构
贵州大学农学院
贵州大学生命科学学院
广西自治区农业科学研究院微生物研究所
出处
《贵州大学学报(自然科学版)》
2024年第6期106-117,共12页
基金
国家自然科学基金资助项目(32360705)
广西科技基地和人才专项资助项目(桂科AA21196003)
+2 种基金
贵州省科技厅(一般项目)资助项目(2019-1410)
贵州省“百层次”创新性人才支持计划资助项目(GCC[2023]070)
贵州大学大学生创新创业训练计划资助项目(2022(088)号)。
文摘
JAZ(jasmonate ZIM-domain,JAZ)蛋白是一类茉莉酸途径的调节因子,通过与其他信号通路相关成员互相作用,共同调节植物各类重要生命活动。为更好地了解JAZ基因家族在百香果(Passiflora edulis Sims)中系统表征并预测基因功能,本研究通过生物信息学方法对百香果JAZ基因鉴定并对其基因特征、系统进化、表达模式等进行了系统分析。结果表明:百香果全基因组编码12个JAZ基因不均匀地分布在4条染色体上,隶属6个亚家族(Group I—VI);进化分析表明,PeJAZ基因的扩增主要归因于片段复制事件;蛋白互作预测分析表明,PeJAZs蛋白具有功能多样性;转录组测序技术分析揭示了PeJAZ基因不同组织和不同胁迫下具显著的表达差异;值得关注的是,PeJAZ3可能是协助百香果抗病毒的一个潜在基因。上述发现可为进一步研究PeJAZs功能和调控机制提供了基础。
关键词
百香果
JAZ基因家族
生物信息学分析
Keywords
passion fruit
JAZ gene family
bioinformatics analysis
分类号
S667.9 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
百香果JAZ基因家族的鉴定及表达模式分析
龚凤鲜
欧阳浩
彭昌杨
姜雨欣
詹爱萍
胡小京
刘增亮
陈孝玉龙
《贵州大学学报(自然科学版)》
2024
0
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职称材料
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参考文献
引证文献
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