2022年浙江省嘉兴市湖北钉螺的群体遗传学分析

【目的】基于微卫星遗传标记法对浙江省嘉兴市不同有螺环境的湖北钉螺进行基因分型,开展群体遗传学分析,探讨钉螺存在或扩散的原因及其影响因素,为有效监测和控制钉螺提供依据。【方法】选取嘉兴市2022年重点有螺环境的平湖市姚浜(YB)村和三兴(SX)村,以及秀洲区的运河(YH)农场3个种群共90只钉螺样本,采用9个微卫星位点对钉螺进行基因分型和群体遗传学分析。【结果】共观察到84个等位基因,YB、SX和YH种群平均等位基因数分别为7.889、5.667、3.778;有效等位基因数分别为4.807、3.329和2.294;近交系数分别为0.400、0.377、0.493。在无限等位基因模型下,SX和YH近期可能出现瓶颈效应。NeEstimator和LDNe软件计算的有效种群均>31.9。分子方差分析显示3个种群钉螺的变异主要存在于个体间,占总变异的41.44%,群体间遗传分化指数为0.286,表示遗传分化程度很大。主坐标分析与系统发生树结果一致,3个种群分为2个谱系,YB和SX为1个谱系,YH分属另一个独立谱系。种群历史及动态分析显示3个种群基因流不充分。溯源分析表示可能为YH首先从SX分化,YB由SX和YH接触融合形成。【结论】嘉兴市钉螺种群遗传多样性总体较低,钉螺种群较不稳定,遗传分化程度很大,各种群之间基因流不充分。

“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组特征与系统进化的关系

目的测定具有“夜逸蚴”特征的日本血吸虫线粒体全基因组序列,并探讨其与大陆其他日本血吸虫地域株的系统进化关系,为后续进行种群遗传结构与遗传多样性研究提供新的数据。方法2020年于安徽省石台县现场采集钉螺,实验室内分离感染性钉螺,逸出的尾蚴以腹部贴片法感染ICR小鼠,灌注法获取肝门静脉和肠系膜静脉处虫体,随机抽样进行测序。使用血液/组织基因组DNA提取试剂盒提取血吸虫DNA,采用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行双末端测序,采用GetOrganelle软件组装线粒体基因组,使用MEGA 11软件分析线粒体基因组结构特征与碱基组成。选择已发表的中国地区17个日本血吸虫线粒体基因组序列,采用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统进化树。结果安徽省石台县分离的“夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组全长14085 bp(GenBank登录号:ON637109),编码36个基因,由12个蛋白编码基因(PCG),22个tRNA基因和2个rRNA基因组成。线粒体基因组A+T含量为71.35%,存在基因重叠区2处、基因间隔区29处;在22个tRNA基因中,除trnaC和trnaS1基因缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂外,其余均能形成典型三叶草二级结构。蛋白编码基因中,cytb、nad4、nad2和nad6基因的终止密码子为TAA,不同于以TAG为终止密码子的中国其他地域株。基于NJ法和ML法构建的系统进化树具有相似的拓扑结构,石台县“夜逸蚴”日本血吸虫分离株单独成一支;中国台湾血吸虫株与中国大陆其他地域株分离,形成一支。结论安徽省石台地区的日本血吸虫分离株其终止密码子与中国其他地域株存在差异,线粒体基因组的系统进化地位分析,与其他地域株亲缘关系较远,遗传差异较大。