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甘蓝型油菜SERK基因家族的鉴定与系统进化分析
被引量:
2
1
作者
顾巧美
赵云燕
+6 位作者
彭澳怡
程风杰
罗丁钒
汤建涛
吴伟娇
徐兆师
危文亮
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期783-794,共12页
体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinase,SERK)与植物体细胞胚发生,尤其是与植物非生物逆境胁迫响应有关。为鉴定甘蓝型油菜中BnaSERK基因家族成员、揭示其进化关系及其与油菜盐/旱胁迫的响应,利用生物...
体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinase,SERK)与植物体细胞胚发生,尤其是与植物非生物逆境胁迫响应有关。为鉴定甘蓝型油菜中BnaSERK基因家族成员、揭示其进化关系及其与油菜盐/旱胁迫的响应,利用生物信息学方法对甘蓝型油菜品种中双11的SERK家族成员、基因结构、进化关系、选择压力等进行系统分析,并初步分析了部分BnaSERK基因在盐/旱胁迫下的表达响应模式。结果表明:在甘蓝型油菜基因组共鉴定到24个BnaSERK基因,它们不均等地分布在15条染色体上,可分为3个亚族,具有相对保守的基因结构和保守基序,且含多种与激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件。共线性分析表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝分别有14对、44对和32对基因表现出共线性。基于比较基因组学研究,甘蓝型油菜BnaSERK基因在经历多倍体化之后,出现了不同程度的丢失现象。分析表明,BnaSERK基因家族在芸薹属物种间的进化相对保守。盐/旱胁迫下的5个BnaSERK基因在叶片中的表达模式分析结果显示,BnaA07g29610D、BnaC01g43240D、BnaCnng07810D基因在盐胁迫下表达量上调,而BnaA01g23070D、BnaA07g23390D基因则表现为下调;Bn⁃aA07g23390D、BnaA07g29610D基因在干旱胁迫下表现为上调表达,而BnaC01g43240D、BnaCnng07810D、Bn⁃aA01g23070D基因呈下调趋势。表明BnaSERK基因可能在油菜响应盐/旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用。
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关键词
甘蓝型油菜
SERK基因家族
系统进化
非生物逆境胁迫
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题名
甘蓝型油菜SERK基因家族的鉴定与系统进化分析
被引量:
2
1
作者
顾巧美
赵云燕
彭澳怡
程风杰
罗丁钒
汤建涛
吴伟娇
徐兆师
危文亮
机构
长江大学农学院/湿地生态与农业利用教育部工程研究中心/主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期783-794,共12页
基金
国家自然科学基金(31871661)。
文摘
体细胞胚胎发生类受体激酶(somatic embryogenesis receptor-like kinase,SERK)与植物体细胞胚发生,尤其是与植物非生物逆境胁迫响应有关。为鉴定甘蓝型油菜中BnaSERK基因家族成员、揭示其进化关系及其与油菜盐/旱胁迫的响应,利用生物信息学方法对甘蓝型油菜品种中双11的SERK家族成员、基因结构、进化关系、选择压力等进行系统分析,并初步分析了部分BnaSERK基因在盐/旱胁迫下的表达响应模式。结果表明:在甘蓝型油菜基因组共鉴定到24个BnaSERK基因,它们不均等地分布在15条染色体上,可分为3个亚族,具有相对保守的基因结构和保守基序,且含多种与激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件。共线性分析表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝分别有14对、44对和32对基因表现出共线性。基于比较基因组学研究,甘蓝型油菜BnaSERK基因在经历多倍体化之后,出现了不同程度的丢失现象。分析表明,BnaSERK基因家族在芸薹属物种间的进化相对保守。盐/旱胁迫下的5个BnaSERK基因在叶片中的表达模式分析结果显示,BnaA07g29610D、BnaC01g43240D、BnaCnng07810D基因在盐胁迫下表达量上调,而BnaA01g23070D、BnaA07g23390D基因则表现为下调;Bn⁃aA07g23390D、BnaA07g29610D基因在干旱胁迫下表现为上调表达,而BnaC01g43240D、BnaCnng07810D、Bn⁃aA01g23070D基因呈下调趋势。表明BnaSERK基因可能在油菜响应盐/旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用。
关键词
甘蓝型油菜
SERK基因家族
系统进化
非生物逆境胁迫
Keywords
Brassica napus L.
SERK gene family
systematic evolution
abiotic stress
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
甘蓝型油菜SERK基因家族的鉴定与系统进化分析
顾巧美
赵云燕
彭澳怡
程风杰
罗丁钒
汤建涛
吴伟娇
徐兆师
危文亮
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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