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基于DNA条形码和微卫星标记分析矮岩羊的进化地位 被引量:4
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作者 谭帅 彭锐 +1 位作者 彭确昆 邹方东 《四川动物》 北大核心 2016年第5期654-659,共6页
岩羊Pseudois nayaur是目前岩羊属Pseudois中承认的唯一物种,主要分布在青藏高原及其周边山脉地区,是该地区代表性的大型有蹄类动物。岩羊种内存在矮岩羊这一个形态特异的种群,其分类地位一直处在争议当中。本次研究从岩羊分布区域内搜... 岩羊Pseudois nayaur是目前岩羊属Pseudois中承认的唯一物种,主要分布在青藏高原及其周边山脉地区,是该地区代表性的大型有蹄类动物。岩羊种内存在矮岩羊这一个形态特异的种群,其分类地位一直处在争议当中。本次研究从岩羊分布区域内搜集到26个岩羊样品,其中包括5个矮岩羊样品,选取了COⅠ基因DNA条形码标准区域和8个微卫星标记位点探讨了矮岩羊与岩羊不同地理种群的系统进化关系,同时分析了矮岩羊的进化地位。结果表明矮岩羊和岩羊间目前处于基因交流半隔离状态,不应该被分为2个不同的物种或者亚种,而矮岩羊应该被作为岩羊四川亚种P.n.szechuanensis中一个形态变异的特殊分类群。另外,结合生境选择和生态观察的结果推测矮岩羊目前可能已经处于单独进化的早期阶段。 展开更多
关键词 岩羊 矮岩羊 遗传分化 DNA条形码 微卫星分子标记
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基于表达谱分析筛选肾母细胞瘤关键基因 被引量:1
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作者 许接天 胡兰琳 +2 位作者 彭确昆 彭锐 邹方东 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期414-418,共5页
为探究肾母细胞瘤(Nephroblastoma)发生的关键基因,并筛选出潜在的治疗靶点及生物标志,采用由GEO数据库获取的基因芯片GSE11151和GSE53224,经归一化处理后,通过GO和KEGG分析筛选出差异基因,并通过构建蛋白互作网络获得其中的关键基因.... 为探究肾母细胞瘤(Nephroblastoma)发生的关键基因,并筛选出潜在的治疗靶点及生物标志,采用由GEO数据库获取的基因芯片GSE11151和GSE53224,经归一化处理后,通过GO和KEGG分析筛选出差异基因,并通过构建蛋白互作网络获得其中的关键基因.总计获得差异基因404个,其中上调基因385个,下调基因19个.PMCH、CCR5、CCR7、RGS1和KNG1作为关键基因,涉及趋化因子信号通路、G蛋白偶联信号通路,参与肿瘤微环境的形成.这5个关键基因在肾母细胞瘤的发生中有着重要作用,并可能作为潜在治疗靶点及生物标志. 展开更多
关键词 肾母细胞瘤 差异基因 芯片分析 肿瘤微环境
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基于低氧-免疫DNA甲基化标记在肺癌中的开发 被引量:1
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作者 熊曙光 周晴 +3 位作者 熊沿 高英杰 屈小敏 彭确昆 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期144-158,共15页
为了探究缺氧和免疫联合分析DNA甲基化位点在肺癌预后中的作用,提高肺癌免疫治疗的有效性,本研究基于甲基化和转录组二维数据,构建了一个用于预后评估的风险评分模型.从TCGA数据库中下载了247个与缺氧、免疫状态相关的去冗余肺癌样本作... 为了探究缺氧和免疫联合分析DNA甲基化位点在肺癌预后中的作用,提高肺癌免疫治疗的有效性,本研究基于甲基化和转录组二维数据,构建了一个用于预后评估的风险评分模型.从TCGA数据库中下载了247个与缺氧、免疫状态相关的去冗余肺癌样本作为训练集.然后对低缺氧-强免疫状态的样本、高缺氧-弱免疫状态的样本进行了差异基因表达、甲基化位点和临床生存率分析.生存曲线分析显示,低缺氧状态-强免疫状态组中的肺腺癌患者的1、3、5年生存率均优于高缺氧状态-弱免疫状态组(log-rank检验,P<0.05、P<0.001、P<0.001).使用LASSO回归构建的多基因预后模型包含9个甲基化位点,在肺腺癌测试数据集和验证数据集中均显示出良好的预后预测能力(AUC=0.83,0.80,0.82).这9个甲基化位点分别分布在PEBP4、FLI1、HLA-DMB、MYO1F、ABCC2、AKNA、ETS1、CCR7和TXNRD1基因上.此外,我们从5年生存曲线中发现,在低缺氧-强免疫状态组中高表达的PEBP4、CCR7、FLI1、AKNA、HLA-DMB、MYO1F和低表达的ABCC2基因也可作为预后因子(P<0.05).结果表明这9个新筛选的生物标记物可以作为肺腺癌免疫治疗的潜在靶点. 展开更多
关键词 肺腺癌 低氧 免疫 DNA甲基化 生存率
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“分子与细胞”翻转课堂教学模式在临床专业教学中的探究 被引量:6
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作者 彭确昆 王建东 +4 位作者 何浪 韦鹤 蒋欣妮 王兰 杨雨晗 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2021年第3期586-591,共6页
提高医学创新人才培养手段是医学教育改革的重点内容之一。"分子与细胞"是临床医学教育改革的重点专业基础课,也是一门全新的整合课程,具有学时多、难度大且要求和临床专业紧密结合的特点。如何转变临床专业课程的传统教学模... 提高医学创新人才培养手段是医学教育改革的重点内容之一。"分子与细胞"是临床医学教育改革的重点专业基础课,也是一门全新的整合课程,具有学时多、难度大且要求和临床专业紧密结合的特点。如何转变临床专业课程的传统教学模式,是临床专业课程改革创新的焦点。该研究通过基于嵌入式文献阅读和临床案例式的翻转课堂教学模式,将传统的面对面授课转化为以学生为中心的授课方式,将课堂主阵地由线下转移至线上,为线下课堂提供了更多创新融合的方式,同时增强了医学生对于生命学基本原理的理解,为培养具有精准医学专业背景的医学生提供了理论基础。通过三年的翻转课堂实施,临床专业卓越医生试点班学生对教学满意度以及学生成绩显著提升,说明在临床专业整合课程开展翻转课堂教学具有积极意义。 展开更多
关键词 临床专业 翻转课堂 JBL CBL 整合课程
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基于前沿文献的融合式教学模式在分子与细胞中的创新与实践——以酶学为例 被引量:1
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作者 彭确昆 潘克俭 +4 位作者 王兰 邓峰美 杨平 黄坪 张薇薇 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2022年第9期1779-1785,共7页
分子与细胞课程融合了临床医学专业的生物化学、分子生物学以及细胞生物学等基础课程,其教学改革主要目标是紧扣时代需求、将生物医学前沿理论植入授课体系,引导学生利用所学知识对新型疾病诊断和治疗技术原理进行剖析,培养学生的高阶... 分子与细胞课程融合了临床医学专业的生物化学、分子生物学以及细胞生物学等基础课程,其教学改革主要目标是紧扣时代需求、将生物医学前沿理论植入授课体系,引导学生利用所学知识对新型疾病诊断和治疗技术原理进行剖析,培养学生的高阶思维能力。该研究以酶学章节内容为例,探讨如何以前沿文献为载体,疾病案例为导向,按“分子结构-生物功能-物质代谢-细胞命运”逻辑轴线重构跨章节(蛋白质、酶和转录)知识点,建立融合式教学内容体系。一方面,该模式可通过综合文献案例挖掘文献中知识点,帮助学生建立整体性知识逻辑联系,强化基础知识的运用,去解决整合课程内容章节间“散”的问题;另一方面,该模式搭建了分子细胞知识与临床疾病治疗之间的桥梁,拓展了学生生物医学领域的科学视野,使其建立从理论到运用的思维模式,训练了医学生的临床问题分析能力,从而解决分子细胞与临床融合“难”的问题。数年教学实践与总结表明,该教学模式能够很好地提升学生综合素养,具有良好的教学反馈,可在更多的临床医学专业的生物学基础教学中进行推广。 展开更多
关键词 临床医学 整合课程 文献案例 教学创新
原文传递
“分子与细胞”课程思政的创新实践——以“坚持‘四个自信’”为目标的融实策略 被引量:1
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作者 张薇薇 潘克俭 +4 位作者 杨平 韦佼君 邹清亮 任小林 彭确昆 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2023年第8期1193-1200,共8页
“分子与细胞”是一门顺应医学教育改革的创新整合课程,教学内容不仅要体现“两性一度”,还要赋予教学内容“培根铸魂”的育人功能。该课程以坚持“四个自信”为思想政治教育目标,团队深挖课程中的经典和热点案例,一方面将我国优越体制... “分子与细胞”是一门顺应医学教育改革的创新整合课程,教学内容不仅要体现“两性一度”,还要赋予教学内容“培根铸魂”的育人功能。该课程以坚持“四个自信”为思想政治教育目标,团队深挖课程中的经典和热点案例,一方面将我国优越体制制度同我国生物化学发展紧密相连,增强学生的“道路自信、制度自信”,另一方面将我国自主科研成果融入案例教学,引导学生使用马克思主义自然辩证法来阐述生命现象,增强学生的“理论自信、文化自信”。该课程除了融入传统经典案例外,还将生命科学前沿热点知识和临床案例融入其中,构筑了基础与前沿、基础与临床医学的教学连续性。对卓医班不同年级学生在“基础知识理解、对我国前沿技术的了解程度、创新科研热情”等不同维度的满意度调查分析,结果显示课程思政教学实施后,学生对于这几个维度的满意度得分均显著高于8分,且对于创新精神培养的满意度得分均高于9分。另外,学生的案例分析题和课终考核分数都显著提升。综上所述,该创新课程思政教学模式,可以显著提升临床专业教学效果。 展开更多
关键词 课程思政 四个自信 卓越医生 案例式教学 临床医学
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