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非血液来源液体活检在胃癌早期诊断中的研究进展
被引量:
2
1
作者
徐亦天
黄陈
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期936-943,共8页
胃癌是一种高度恶性的消化道肿瘤,早期胃癌若能及时接受手术治疗,治愈率可达90%,鉴于早期胃癌缺乏明显症状与敏感的肿瘤标志物,近80%的胃癌患者首次确诊时即处于进展期。液体活检作为一种新兴的分子检测技术,其无创、快速、经济、重复性...
胃癌是一种高度恶性的消化道肿瘤,早期胃癌若能及时接受手术治疗,治愈率可达90%,鉴于早期胃癌缺乏明显症状与敏感的肿瘤标志物,近80%的胃癌患者首次确诊时即处于进展期。液体活检作为一种新兴的分子检测技术,其无创、快速、经济、重复性好,具有比血清学肿瘤标志物更佳的敏感性与特异性,并能早于病理活检来诊断肿瘤,为胃癌的早期检测与风险评估带来了曙光。然而液体活检受限于诸多因素,始终未能在临床上广泛应用。其中一个主要原因是传统液体活检的绝大部分样本来自患者血液(包括血浆和血清),血液样本中低浓度的癌症衍生成分限制了液体活检在癌症发生或复发早期发现并预警的能力。最近的研究进一步扩展了液体活检的概念,发现来自血液以外体液的活检,即非血液来源液体活检,可以更好地筛查、诊断和监测肿瘤,有希望推进液体活检在胃癌早期诊断中的应用。我们通过检索近年来的相关文献,分析了非血液来源液体活检相比传统液体活检的优势与挑战,并对唾液、胃液、胃洗液和尿液四种体液来源的液体活检在胃癌早期诊断中的研究进展进行综述。
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关键词
液体活检
胃癌
早期诊断
体液
下载PDF
职称材料
血清CA72-4升高,一定是患了胃癌吗
2
作者
黄陈
徐亦天
《大众医学》
2021年第9期27-28,共2页
近年来,血肿瘤标志物检测已经成为健康体检的“标配”,人们对肿瘤标志物的了解也越来越多。很多人都知道,甲胎蛋白(AFP)是肝癌的标志物,癌胚抗原(CEA)是肠道肿瘤的标志物,等等。在胃肠外科门诊,我们经常会遇到拿着肿瘤标志物CA72-4升高...
近年来,血肿瘤标志物检测已经成为健康体检的“标配”,人们对肿瘤标志物的了解也越来越多。很多人都知道,甲胎蛋白(AFP)是肝癌的标志物,癌胚抗原(CEA)是肠道肿瘤的标志物,等等。在胃肠外科门诊,我们经常会遇到拿着肿瘤标志物CA72-4升高的检查报告来就诊的患者,他们的问题几乎都一样:“医生,听说CA72-4升高可能是胃癌,我真的患了胃癌吗?我该怎么办?”今天,我们就来讲一讲肿瘤标志物CA72-4,希望大家能正确认识它,不要恐慌,也不要忽视。
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关键词
肠道肿瘤
检查报告
肿瘤标志物检测
胃肠外科
健康体检
标志物
胃癌
原文传递
基于机器学习的胃黏液分泌性腺癌特征基因筛选及免疫浸润分析
被引量:
1
3
作者
张原
张鹏善
+3 位作者
罗再
徐亦天
蔡谦谦
黄陈
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2023年第5期939-942,共4页
目的通过机器学习结合生物信息学方法分析胃黏液分泌性腺癌(GMA)的特征基因及特征通路,探索GMA的诊断标志物及其与免疫细胞浸润的关联。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载胃癌(GC)测序数据,以P<0.05为标准筛选99例GMA与311例...
目的通过机器学习结合生物信息学方法分析胃黏液分泌性腺癌(GMA)的特征基因及特征通路,探索GMA的诊断标志物及其与免疫细胞浸润的关联。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载胃癌(GC)测序数据,以P<0.05为标准筛选99例GMA与311例胃普通型腺癌(GTA)样本差异表达基因(DEGs)。通过功能富集方法分析GMA特征通路和功能途径,进一步通过机器学习算法,使用套索回归(LASSO)结合支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)获取23个特征基因,并通过绘制受试者工作特征曲线(ROC)分析DEGs的诊断效能,及其与免疫细胞浸润的相关性。在基因表达谱数据库(GEO)数据集GSE113255中对DEGs的表达和诊断效能进行验证。结果在TCGA数据库中检测到1769个DEGs(P<0.05),其中759个在GMA中上调,而1010个在GTA中上调。这些基因与磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、细胞黏附、细胞外基质、细胞骨架调节等途径显著相关(P<0.01)。GMA组中CMTM8(11.416比17.845,P<0.001)、RTKN(8.456比13.845,P<0.001)、TOMM34(23.219比36.991,P<0.001)平均表达量均低于GTA组,是GMA的诊断标志物。GMA组中M2巨噬细胞(P<0.01)、静息肥大细胞(P<0.001)浸润水平高于GTA组,而激活CD4+T细胞(P<0.01)浸润水平低于GTA组。结论CMTM8、RTKN和TOMM34是GMA的特征基因,与M2巨噬细胞和静息肥大细胞浸润等显著相关。
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关键词
胃癌
黏液分泌性腺癌
机器学习
免疫浸润
生物标志物
原文传递
题名
非血液来源液体活检在胃癌早期诊断中的研究进展
被引量:
2
1
作者
徐亦天
黄陈
机构
上海交通大学附属第一人民医院胃肠外科
出处
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期936-943,共8页
基金
国家自然科学基金(82072662、81772526)
上海交通大学医学院高峰高原计划-“研究型医师”项目(20161425)
+2 种基金
上海交通大学医工交叉项目(YG2017MS28)
上海促进市级医院临床技能与临床创新三年行动计划(SHDC2020CR4022)
2021上海市“医苑新星”青年医学人才培养资助计划(杰出青年医学人才)。
文摘
胃癌是一种高度恶性的消化道肿瘤,早期胃癌若能及时接受手术治疗,治愈率可达90%,鉴于早期胃癌缺乏明显症状与敏感的肿瘤标志物,近80%的胃癌患者首次确诊时即处于进展期。液体活检作为一种新兴的分子检测技术,其无创、快速、经济、重复性好,具有比血清学肿瘤标志物更佳的敏感性与特异性,并能早于病理活检来诊断肿瘤,为胃癌的早期检测与风险评估带来了曙光。然而液体活检受限于诸多因素,始终未能在临床上广泛应用。其中一个主要原因是传统液体活检的绝大部分样本来自患者血液(包括血浆和血清),血液样本中低浓度的癌症衍生成分限制了液体活检在癌症发生或复发早期发现并预警的能力。最近的研究进一步扩展了液体活检的概念,发现来自血液以外体液的活检,即非血液来源液体活检,可以更好地筛查、诊断和监测肿瘤,有希望推进液体活检在胃癌早期诊断中的应用。我们通过检索近年来的相关文献,分析了非血液来源液体活检相比传统液体活检的优势与挑战,并对唾液、胃液、胃洗液和尿液四种体液来源的液体活检在胃癌早期诊断中的研究进展进行综述。
关键词
液体活检
胃癌
早期诊断
体液
Keywords
Liquid biopsy
Gastric cancer
Early diagnosis
Body fluids
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
血清CA72-4升高,一定是患了胃癌吗
2
作者
黄陈
徐亦天
机构
上海交通大学附属第一人民医院胃肠外科
出处
《大众医学》
2021年第9期27-28,共2页
文摘
近年来,血肿瘤标志物检测已经成为健康体检的“标配”,人们对肿瘤标志物的了解也越来越多。很多人都知道,甲胎蛋白(AFP)是肝癌的标志物,癌胚抗原(CEA)是肠道肿瘤的标志物,等等。在胃肠外科门诊,我们经常会遇到拿着肿瘤标志物CA72-4升高的检查报告来就诊的患者,他们的问题几乎都一样:“医生,听说CA72-4升高可能是胃癌,我真的患了胃癌吗?我该怎么办?”今天,我们就来讲一讲肿瘤标志物CA72-4,希望大家能正确认识它,不要恐慌,也不要忽视。
关键词
肠道肿瘤
检查报告
肿瘤标志物检测
胃肠外科
健康体检
标志物
胃癌
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
基于机器学习的胃黏液分泌性腺癌特征基因筛选及免疫浸润分析
被引量:
1
3
作者
张原
张鹏善
罗再
徐亦天
蔡谦谦
黄陈
机构
上海交通大学医学院附属第一人民医院胃肠外科
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2023年第5期939-942,共4页
基金
国家自然科学基金(82072662、82203751)
上海市申康三年行动计划项目(SHDC2020CR4022)
+1 种基金
上海交通大学医院高峰高原计划-"研究型医师"(第二轮,20191425)
上海市抗癌协会"雏鹰"计划(SACA-CY21C08)。
文摘
目的通过机器学习结合生物信息学方法分析胃黏液分泌性腺癌(GMA)的特征基因及特征通路,探索GMA的诊断标志物及其与免疫细胞浸润的关联。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载胃癌(GC)测序数据,以P<0.05为标准筛选99例GMA与311例胃普通型腺癌(GTA)样本差异表达基因(DEGs)。通过功能富集方法分析GMA特征通路和功能途径,进一步通过机器学习算法,使用套索回归(LASSO)结合支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)获取23个特征基因,并通过绘制受试者工作特征曲线(ROC)分析DEGs的诊断效能,及其与免疫细胞浸润的相关性。在基因表达谱数据库(GEO)数据集GSE113255中对DEGs的表达和诊断效能进行验证。结果在TCGA数据库中检测到1769个DEGs(P<0.05),其中759个在GMA中上调,而1010个在GTA中上调。这些基因与磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、细胞黏附、细胞外基质、细胞骨架调节等途径显著相关(P<0.01)。GMA组中CMTM8(11.416比17.845,P<0.001)、RTKN(8.456比13.845,P<0.001)、TOMM34(23.219比36.991,P<0.001)平均表达量均低于GTA组,是GMA的诊断标志物。GMA组中M2巨噬细胞(P<0.01)、静息肥大细胞(P<0.001)浸润水平高于GTA组,而激活CD4+T细胞(P<0.01)浸润水平低于GTA组。结论CMTM8、RTKN和TOMM34是GMA的特征基因,与M2巨噬细胞和静息肥大细胞浸润等显著相关。
关键词
胃癌
黏液分泌性腺癌
机器学习
免疫浸润
生物标志物
Keywords
Stomach Neoplasms
Adenocarcinoma,Mucinous
Machine Learning
Immune Infiltration
Biomarkers
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
非血液来源液体活检在胃癌早期诊断中的研究进展
徐亦天
黄陈
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
下载PDF
职称材料
2
血清CA72-4升高,一定是患了胃癌吗
黄陈
徐亦天
《大众医学》
2021
0
原文传递
3
基于机器学习的胃黏液分泌性腺癌特征基因筛选及免疫浸润分析
张原
张鹏善
罗再
徐亦天
蔡谦谦
黄陈
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2023
1
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