TaqMan-探针实时荧光定量PCR同时检测立克次体目中7种重要病原菌

目的建立及优化检测立克次体目中7种重要病原菌的TaqMan-探针实时荧光定量PCR(qPCR)方法,可同步检测并明确感染类型。方法根据普氏立克次体、莫氏立克次体和斑点热群立克次体ompB基因、恙虫病东方体groEL基因、查菲埃立克体16S rRNA基因、嗜吞噬细胞无形体gltA基因和贝氏柯克斯体com1基因序列合成引物和探针,优化反应体系及反应程序至同一方案,对该方法灵敏度、特异性和重复性等进行评价,并使用该方法对模拟样本和实际样本进行检测。结果7种病原菌标准曲线的Ct值与模板拷贝数均呈良好的线性关系(均R^(2)>0.9900),所建立方法最低检测限均为1×10拷贝数/μl且具有良好的特异性。96份蜱虫核酸提取物样本中,1份样本检出贝氏柯克斯体,3份样本检出斑点热群立克次体;80份不明原因发热患者血标本DNA中,1份样本检出恙虫病东方体,2份样本检出斑点热群立克次体。结论本研究基于TaqMan-探针qPCR方法,将7种病原菌反应体系及反应程序优化至同一方案,克服目前不同立克次体目病原菌采用不同的反应体系和反应程序的缺点,可将临床样本中立克次体目的7种重要病原菌精确定位检测至种,明确感染病原菌类型并缩短检测时间,有助于对患者的精准诊治。