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结直肠癌细胞IL-4/Stat6信号传导活性与调节基因差异性表达相关性研究 被引量:4
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作者 李品东 袁琴 +7 位作者 杨贤子 李本辉 刘晓洪 张燕 徐双兵 袁佳 陈婷 张文杰 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2007年第24期1841-1845,共5页
目的:IL-4介导的Stat6信号传导活性在人细胞之间有差异,称为Stat6活化表型。旨在探讨Stat6活化表型及其产生的分子学基础。方法:结直肠癌细胞株HT-29与Caco-2的Stat6活化表型用EMSA半定量法测定。Stat6通路调节因子基因水平的表达用RT-... 目的:IL-4介导的Stat6信号传导活性在人细胞之间有差异,称为Stat6活化表型。旨在探讨Stat6活化表型及其产生的分子学基础。方法:结直肠癌细胞株HT-29与Caco-2的Stat6活化表型用EMSA半定量法测定。Stat6通路调节因子基因水平的表达用RT-PCR法检测。蛋白水平的表达用Western blotting法检测。结果:EMSA分析表明,HT-29为高活化表型(Stat6high)而Caco-2为零活化表型(Stat6null)。RT-PCR分析显示,与Stat6highHT-29比较,Stat6nullCaco-2癌细胞高表达负调节基因SOCS1和SHP1,而低表达正调节因子PP2A催化亚单位编码基因PP2CA和PP2CB。Westernblotting分析法证实Caco-2癌细胞高表达SOCS1和SHP1蛋白。结论:Stat6通路正、负调节基因的表达失衡可能是产生不同Stat6活化表型的分子机制之一。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 基因表达 信号传导
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新基因hSSB1逆转录病毒载体的构建、鉴定和稳定株的筛选 被引量:1
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作者 张如华 徐双兵 +1 位作者 武远众 康铁邦 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期73-76,85,共5页
hSSB1(Human Single-strand DNA-binding protein)是参与细胞DNA损伤应答的一个重要信号分子。根据GenBank提供的hSSB1基因序列扩增其cDNA序列,插入到pBABE逆转录病毒载体中,连接后的质粒转化后经过双酶切,PCR扩增及测序来鉴定pBABE-hS... hSSB1(Human Single-strand DNA-binding protein)是参与细胞DNA损伤应答的一个重要信号分子。根据GenBank提供的hSSB1基因序列扩增其cDNA序列,插入到pBABE逆转录病毒载体中,连接后的质粒转化后经过双酶切,PCR扩增及测序来鉴定pBABE-hSSB1阳性克隆。将阳性表达的pBABE-hSSB1和包装质粒转染到HEK293T细胞中,产生病毒液。将包装好的病毒感染细胞并用嘌呤霉素(puromycin)筛选稳定表达hSSB1的细胞株。重组pBABE-hSSB1质粒经双酶切,PCR扩增鉴定及DNA测序分析等方法证实克隆成功。Western blotting检测发现转染重组质粒pBABE-hSSB1的细胞株中hSSB1蛋白的表达水平高于对照组。该研究成功构建了针对hSSB1基因的逆转录病毒载体(pBABE-hSSB1),并得到了稳定高表达hSSB1的细胞株,为深入研究其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 hSSB1 病毒载体 稳定株
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幽门螺杆菌尿素酶基因的克隆及表达 被引量:3
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作者 张如华 徐双兵 +1 位作者 胡开顺 康铁邦 《分子诊断与治疗杂志》 2010年第6期387-389,共3页
目的构建幽门螺杆菌尿素酶基因B亚单位(ureB)的原核表达质粒,诱导重组蛋白表达。方法以幽门螺杆菌基因组DNA为模板,PCR扩增尿素酶基因B亚单位,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分离后连接克隆载体并测序,构建重组原核表达载体。结果成功扩增出1... 目的构建幽门螺杆菌尿素酶基因B亚单位(ureB)的原核表达质粒,诱导重组蛋白表达。方法以幽门螺杆菌基因组DNA为模板,PCR扩增尿素酶基因B亚单位,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳分离后连接克隆载体并测序,构建重组原核表达载体。结果成功扩增出1710bp的目的基因,测序结果证实与预期一致,该基因在大肠杆菌表达系统中得到表达。结论在大肠杆菌中成功表达幽门螺杆菌尿素酶基因B亚单位蛋白,为幽门螺杆菌疫苗的研发奠定了基础。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 尿素酶 基因克隆
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IL-4/Stat6活性与细胞周期调控和癌转移相关基因的差异性表达
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作者 马志萍 袁佳 +5 位作者 张燕 李本辉 徐双兵 刘晓洪 李锋 张文杰 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2012年第4期466-471,共6页
IL-4诱导的Stat6活化水平在细胞之间差异很大,已发现这种差异与肿瘤细胞增殖、凋亡和侵袭转移力相关。本课题旨在探讨Stat6活化水平与细胞周期调控基因以及癌转移相关基因表达水平之间的相关性并试图解释这种相关性与癌细胞行为的关联... IL-4诱导的Stat6活化水平在细胞之间差异很大,已发现这种差异与肿瘤细胞增殖、凋亡和侵袭转移力相关。本课题旨在探讨Stat6活化水平与细胞周期调控基因以及癌转移相关基因表达水平之间的相关性并试图解释这种相关性与癌细胞行为的关联。运用半定量RT-PCR法检测细胞周期调控基因CDK4、CDKN2A、CDKN1B、CD-KN1A的方法,以及转移相关基因CD44v6、S100A4、CXCR4、NM23分别在结肠癌细胞系Caco-2(Stat6null表型)、HT-29(Stat6high表型)中的表达水平。显示,结果细胞周期依赖性激酶CDK4,促转移基因CD44v6、S100A4在Stat6high表型的HT-29细胞表达较高的mRNA;而周期抑制基因CDKN2A、CDKN1B、CDKN1A,以及转移抑制基因NM23则在Caco-2(Stat6null表型)细胞表达较高的mRNA,上述差异均有统计学意义(P<0.05)。CXCR4mR-NA表达水平在两株细胞间无统计学差异。由此可知,携带高活化表型Stat6high的癌细胞(HT-29),其细胞周期抑制基因、转移抑制基因表达降低;而细胞周期正向调节基因、促转移基因表达增高。这种基因表达的变化可能对癌细胞的生长、侵袭和转移有利,提示Stat6的活化状态在癌症的发展和预后上可能具有标志物意义。 展开更多
关键词 人类结直肠癌 STAT6 细胞周期 侵袭转移
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生物信息学一致性相关系数法预测非小细胞肺癌的NP化疗方案药物敏感性基因 被引量:1
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作者 王卓智 陈秋月 +10 位作者 韩勇 陈永孜 黄怡菲 龚卫静 徐双兵 李居怡 邓艾平 刘亚妮 曾芳 吕永宁 张玉 《医药导报》 CAS 北大核心 2021年第2期153-157,共5页
目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数... 目的用生物信息学一致性相关系数(CCC)法预测非小细胞肺癌一线化疗方案NP方案(长春瑞滨+顺铂)药物敏感性基因。方法使用5种统计学方法:Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA,从NCI 60数据库筛选药物敏感性基因,通过CCC筛选非小细胞肺癌患者化疗药物敏感性基因。利用在线数据库DAVID进行KEGG通路富集分析。结果筛选出可能应用于预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性基因:顺铂的药物敏感性基因主要富集在蛋白聚糖、细菌侵袭上皮细胞通路中;长春瑞滨的药物敏感性基因主要与癌症信号通路、蛋白聚糖有关。结论生物信息学CCC法可应用于筛选出预测非小细胞肺癌化疗药物敏感性的基因,可能为将来构建NP方案精准化疗模型提供研究基础。 展开更多
关键词 药物敏感性基因 NP方案 非小细胞肺癌 生物信息学 一致性相关系数(CCC)
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项目教学法在中职化学课程中的应用 被引量:3
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作者 徐双兵 《职业》 2019年第29期64-65,共2页
目前,随着科学技术的迅速发展,电子技术、信息技术在不同行业中的快速普及,企业对用人的职业标准提出了更高要求。然而中职院校教学仍然以书本教学为基础,在培养学生的知识应用能力方面缺乏有效方式。以生物化学这门课程为例,实际的应... 目前,随着科学技术的迅速发展,电子技术、信息技术在不同行业中的快速普及,企业对用人的职业标准提出了更高要求。然而中职院校教学仍然以书本教学为基础,在培养学生的知识应用能力方面缺乏有效方式。以生物化学这门课程为例,实际的应用中所需要的知识大多数为偏向微生物方向的实践能力。因此,本课题研究基于当前我国中职化学课程中存在的实际问题,尝试在教学中应用“项目教学法”,以提高课堂教学效率。 展开更多
关键词 中职化学 项目教学法 教学实践
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Synthesis and Characterization of Surface-modified Fe_3O_4 Super-paramagnetic Nanoparticles
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作者 张占洁 马佳 +6 位作者 徐双兵 任精华 秦铀 黄晶 杨坤禹 张志平 伍钢 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2014年第2期270-275,共6页
Aqueous dispersion and stability of Fe304 nanoparticles remain an issue unresolved since aggregation of naked iron nanoparticles in water. In this study, we successfully synthesized different Fe304 super-paramagnetic ... Aqueous dispersion and stability of Fe304 nanoparticles remain an issue unresolved since aggregation of naked iron nanoparticles in water. In this study, we successfully synthesized different Fe304 super-paramagnetic nanoparticles which were modified by three kinds of materials [DSPE-MPEG2000, TiO2 and poly acrylic acid (PAA)] and further detected their characteristics. Trans- mission electron microscopy (TEM) clearly showed sizes and morphology of the four kinds of nanopar- ticles. X-ray diffraction (XRD) proved successfully coating of the three kinds of nanoparticles and their structures were maintained. Vibrating sample magnetometer (VSM) verified that their magnetic proper- ties fitted for the super-paramagnetic function. More importantly, the particle size analysis indicated that Fe304@PAA had a better size distribution, biocompatibility, stability and dispersion than the other two kinds of nanoparticles. In addition, using CNE2 cells as a model, we found that all nanoparticles were nontoxic. Taken together, our data suggest that Fe304@PAA nanoaparticles are superior in the applica- tion of biomedical field among the four kinds ofFe304 nanoparticles in the future. 展开更多
关键词 Fe304 super-paramagnetic nanoparticles surface modification BIOCOMPATIBILITY
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生物信息学共表达外推法初构食管癌精准化疗生物标志物模型 被引量:1
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作者 陈秋月 王卓智 +6 位作者 韩勇 陈永孜 张琪琳 徐双兵 刘亚妮 吕永宁 张玉 《中国医院药学杂志》 CAS 北大核心 2020年第23期2440-2444,共5页
目的:用生物信息学共表达外推(以下简称生信COXEN)法初步构建食管癌精准化疗药物(5-氟尿嘧啶、紫杉醇和顺铂)生物标志物模型。方法:本研究使用5种统计学方法(Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch’s t-test、ANCOVA和rank-based A... 目的:用生物信息学共表达外推(以下简称生信COXEN)法初步构建食管癌精准化疗药物(5-氟尿嘧啶、紫杉醇和顺铂)生物标志物模型。方法:本研究使用5种统计学方法(Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch’s t-test、ANCOVA和rank-based ANCOVA)从NCI-60数据库筛选药物敏感性基因,通过COXEN筛选食管鳞状细胞癌患者化疗药物敏感性的生物标志物。利用在线数据库DAVID进行KEGG通路富集分析。结果:筛选出可应用于预测人类食管鳞状细胞癌化疗药物敏感性的生物标志物:5-氟尿嘧啶的生物标志物主要富集在细胞周期G1期和S期(RNA和核糖体的合成、DNA复制)中;顺铂的生物标志物主要与蛋白聚糖、细菌侵袭上皮细胞和白细胞跨内皮迁移有关;紫杉醇的生物标志物主要与局部黏附、小细胞肺癌和HTLV-I感染通路有关。结论:生信COXEN法筛选出可应用于预测人类食管鳞状细胞癌单个化疗药物敏感性的基因,能为将来构建更有转化应用价值的多组合化疗方案预测模型提供研究基础。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 生物标志物 化疗药物 生物信息学 共表达外推法
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表观遗传学在肿瘤放射性DNA损伤修复中的研究进展
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作者 揭小华 徐双兵 伍钢 《中华放射肿瘤学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第12期1335-1339,共5页
放疗通过放射线诱导肿瘤细胞DNA双链断裂来治疗癌症,但肿瘤细胞中异常的DNA双链断裂修复往往会导致放疗抵抗,而表观遗传学在其中发挥至关重要作用。靶向表观遗传学相关的重要分子可能是潜在的肿瘤放射增敏手段,但将表观遗传学药物与放... 放疗通过放射线诱导肿瘤细胞DNA双链断裂来治疗癌症,但肿瘤细胞中异常的DNA双链断裂修复往往会导致放疗抵抗,而表观遗传学在其中发挥至关重要作用。靶向表观遗传学相关的重要分子可能是潜在的肿瘤放射增敏手段,但将表观遗传学药物与放疗联合的临床应用还需要进一步的机制研究。本文将对表观遗传学在肿瘤放射性DNA损伤修复中的作用最新进展进行综述。 展开更多
关键词 表观遗传学 放射性DNA损伤修复 肿瘤/放射疗法
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