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犬瘟热病毒Guizhou株血凝素基因的克隆及序列分析
被引量:
8
1
作者
朱军莉
余旭平
+5 位作者
张登祥
沈琴芳
徐在平
李永明
周碧君
吴彤
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期17-20,共4页
参照已发表的文献合成1对引物,以犬瘟热病毒Guizhou分离株感染Vero细胞收获病毒提取的RNA为模板,RT-PCR扩增获得血凝素蛋白基因(H)901~1661位大小为761bp的片段,并将PCR扩增产物进行克隆和测序。将Guizhou株与GenBank数据库中的31...
参照已发表的文献合成1对引物,以犬瘟热病毒Guizhou分离株感染Vero细胞收获病毒提取的RNA为模板,RT-PCR扩增获得血凝素蛋白基因(H)901~1661位大小为761bp的片段,并将PCR扩增产物进行克隆和测序。将Guizhou株与GenBank数据库中的31株CDV及国内NanjingOP株的H基因序列进行同源性和系统发生树分析,发现Guizhou株的H基因部分序列与疫苗毒株Convac和Onderstpoort的同源性最低,只有90%;与日本野毒株Tanu96、KDK-1、Hmanatsu、Yanaka、UENO的同源性较高,为96%~98%;且与国内从大熊猫和小熊猫分离的野毒株GP和LP的同源性也较高,为98%和96%。系统发生树分析显示,Guizhou株与国内野毒株GP和LP,及日本的5个野毒株应属同一类,其中和GP株基因型最近,推测这些毒株间有更近的共同祖先。因此怀疑该病毒较适应于野生动物,且在我国某些地区的野生动物中可能存在自然疫源性传播。
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关键词
犬瘟热病毒
H基因
序列分析
同源性
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职称材料
题名
犬瘟热病毒Guizhou株血凝素基因的克隆及序列分析
被引量:
8
1
作者
朱军莉
余旭平
张登祥
沈琴芳
徐在平
李永明
周碧君
吴彤
机构
浙江大学动物科学学院
贵州大学动物科学学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期17-20,共4页
基金
贵州省科技攻关资助项目[(2000)111]
文摘
参照已发表的文献合成1对引物,以犬瘟热病毒Guizhou分离株感染Vero细胞收获病毒提取的RNA为模板,RT-PCR扩增获得血凝素蛋白基因(H)901~1661位大小为761bp的片段,并将PCR扩增产物进行克隆和测序。将Guizhou株与GenBank数据库中的31株CDV及国内NanjingOP株的H基因序列进行同源性和系统发生树分析,发现Guizhou株的H基因部分序列与疫苗毒株Convac和Onderstpoort的同源性最低,只有90%;与日本野毒株Tanu96、KDK-1、Hmanatsu、Yanaka、UENO的同源性较高,为96%~98%;且与国内从大熊猫和小熊猫分离的野毒株GP和LP的同源性也较高,为98%和96%。系统发生树分析显示,Guizhou株与国内野毒株GP和LP,及日本的5个野毒株应属同一类,其中和GP株基因型最近,推测这些毒株间有更近的共同祖先。因此怀疑该病毒较适应于野生动物,且在我国某些地区的野生动物中可能存在自然疫源性传播。
关键词
犬瘟热病毒
H基因
序列分析
同源性
Keywords
canine distemper virus t haemagglutinin gene
sequence comparison
homology
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
犬瘟热病毒Guizhou株血凝素基因的克隆及序列分析
朱军莉
余旭平
张登祥
沈琴芳
徐在平
李永明
周碧君
吴彤
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
8
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