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基于网络药理学和分子对接技术探讨七味白术散治疗糖尿病肾病的作用机制
被引量:
1
1
作者
徐纯依
周东旭
+4 位作者
梁浩威
胡琼澳
徐智星
王辉
寿旗扬
《浙江临床医学》
2023年第5期635-639,共5页
目的应用网络药理学方法探讨七味白术散治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取七味白术散化合物及其靶标,将靶标导入Uniprot数据库获取靶标对应的基因Symbol,并用Cytoscape软件绘制“中药-...
目的应用网络药理学方法探讨七味白术散治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取七味白术散化合物及其靶标,将靶标导入Uniprot数据库获取靶标对应的基因Symbol,并用Cytoscape软件绘制“中药-活性成分-靶点”网络图;从GeneCards、OMIM和DrugBank数据库中收集DN作用靶点并剔除重复基因,与筛选得到的七味白术散靶标取交集基因。应用STRING网站和Cytoscape软件分析构建蛋白互作(PPI)网络图,并用CytoNCA插件进行拓扑学分析筛选得到核心靶点。将核心靶点导入Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。应用AutoDock软件进行分子对接以验证活性成分和核心靶点间的亲和力并通过PyMol软件输出可视化图片。结果共筛选得到七味白术散活性成分149种,成分靶点与疾病靶点的交集基因150个。PPI拓扑学分析得到核心靶点48个,其中JUN、MAPK3、TP53、STAT3、MAPK1为度值排名前5的基因。“中药-活性成分-靶点”网络图筛选出关键成分槲皮素、山柰酚、芒柄花素、豆甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮。分子对接验证了5个关键基因和10种关键成分良好的对接活性。GO富集分析和KEGG通路富集分析发现,药物有效成分主要通过癌症相关通路、脂质和动脉粥样硬化通路、AGERAGE信号通路等发挥作用,涉及细胞对激素的反应、细胞对脂质的反应等生物过程。结论七味白术散通过多成分、多靶点治疗糖尿病肾病,为进一步研究其药理机制提供新思路。
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关键词
网络药理学
分子对接
七味白术散
糖尿病肾病
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接技术探讨七味白术散治疗糖尿病肾病的作用机制
被引量:
1
1
作者
徐纯依
周东旭
梁浩威
胡琼澳
徐智星
王辉
寿旗扬
机构
浙江中医药大学
出处
《浙江临床医学》
2023年第5期635-639,共5页
基金
国家自然科学基金面上项目(81973767)
浙江省大学生科技创新活动计划项目(新苗人才计划)(2022R410A010)。
文摘
目的应用网络药理学方法探讨七味白术散治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取七味白术散化合物及其靶标,将靶标导入Uniprot数据库获取靶标对应的基因Symbol,并用Cytoscape软件绘制“中药-活性成分-靶点”网络图;从GeneCards、OMIM和DrugBank数据库中收集DN作用靶点并剔除重复基因,与筛选得到的七味白术散靶标取交集基因。应用STRING网站和Cytoscape软件分析构建蛋白互作(PPI)网络图,并用CytoNCA插件进行拓扑学分析筛选得到核心靶点。将核心靶点导入Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。应用AutoDock软件进行分子对接以验证活性成分和核心靶点间的亲和力并通过PyMol软件输出可视化图片。结果共筛选得到七味白术散活性成分149种,成分靶点与疾病靶点的交集基因150个。PPI拓扑学分析得到核心靶点48个,其中JUN、MAPK3、TP53、STAT3、MAPK1为度值排名前5的基因。“中药-活性成分-靶点”网络图筛选出关键成分槲皮素、山柰酚、芒柄花素、豆甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮。分子对接验证了5个关键基因和10种关键成分良好的对接活性。GO富集分析和KEGG通路富集分析发现,药物有效成分主要通过癌症相关通路、脂质和动脉粥样硬化通路、AGERAGE信号通路等发挥作用,涉及细胞对激素的反应、细胞对脂质的反应等生物过程。结论七味白术散通过多成分、多靶点治疗糖尿病肾病,为进一步研究其药理机制提供新思路。
关键词
网络药理学
分子对接
七味白术散
糖尿病肾病
Keywords
Network pharmacology
Molecular docking
Qiwei Baizhu powder
Diabetes nephropathy
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接技术探讨七味白术散治疗糖尿病肾病的作用机制
徐纯依
周东旭
梁浩威
胡琼澳
徐智星
王辉
寿旗扬
《浙江临床医学》
2023
1
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职称材料
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