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基于双层BiGRU网络的哺乳动物组织m^(6)A甲基化位点预测
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作者 李慧敏 陈鹏辉 +3 位作者 唐轶 徐权峰 胡梦 王煜 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CSCD 北大核心 2023年第12期3032-3044,共13页
目的N6-甲基化腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是RNA中最常见、最丰富的化学修饰,在很多生物过程中发挥着重要作用。目前已经发展了一些预测m^(6)A甲基化位点的计算方法。然而,这些方法在针对不同物种或不同组织时,缺乏稳健性。为了提... 目的N6-甲基化腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)是RNA中最常见、最丰富的化学修饰,在很多生物过程中发挥着重要作用。目前已经发展了一些预测m^(6)A甲基化位点的计算方法。然而,这些方法在针对不同物种或不同组织时,缺乏稳健性。为了提升对不同组织中m^(6)A甲基化位点预测的稳健性,本文提出一种能结合序列反向信息来提取数据更高级特征的双层双向门控循环单元(bidirectional gated recurrent unit,Bi GRU)网络模型。方法本文选取具有代表性的哺乳动物组织m^(6)A甲基化位点数据集作为训练数据,通过对模型网络、网络结构、层数和优化器等进行搭配,构建双层Bi GRU网络。结果将模型应用于人类、小鼠和大鼠共11个组织的m^(6)A甲基化位点预测上,并与其他方法在这11个组织上的预测能力进行了全面的比较。结果表明,本文构建的模型平均预测接受者操作特征曲线下面积(area under the receiver operating characteristiccurve,AUC)达到93.72%,与目前最好的预测方法持平,而预测准确率(accuracy,ACC)、敏感性(sensitivity,SN)、特异性(specificity,SP)和马修斯相关系数(Matthews correlation coefficient,MCC)分别为90.07%、90.30%、89.84%和80.17%,均高于目前的m^(6)A甲基化位点预测方法。结论和已有研究方法相比,本文方法对11个哺乳动物组织的m^(6)A甲基化位点的预测准确性均达到最高,说明本文方法具有较好的泛化能力。 展开更多
关键词 N6-甲基化腺苷位点 双向门控循环单元 碱基序列 深度学习
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浅论我国环境行政中公众参与制度的现状及不足
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作者 徐权峰 《商情》 2013年第31期130-130,共1页
公众参与是完善环境行政执法,改善以“政府主导”为特征的环境保护现状的根本动力。在我国,环境保护一直强调政府的主导、核心作用,公众只是作为环境执法的客体。虽然在环境治理方面取得了一些进步,但由于公众没有充分参与环境政策... 公众参与是完善环境行政执法,改善以“政府主导”为特征的环境保护现状的根本动力。在我国,环境保护一直强调政府的主导、核心作用,公众只是作为环境执法的客体。虽然在环境治理方面取得了一些进步,但由于公众没有充分参与环境政策的规划和制定,忽视了其对环境保护和环境法治的积极作用。 展开更多
关键词 公众参与 环境行政
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浅论中国劳动法理念的发展路径
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作者 徐权峰 《知识经济》 2013年第11期37-37,共1页
我国现代劳动法理念的形成,经历了若干个阶段:一是在新中国成立前,旧军阀为镇压劳工运动,维护军阀利益,剥削劳动者,使劳动者失去法律保护阶段;二是新中国成立初期,以保障劳动者,忽视资本合理利益和单一行政干预阶段;三是改革开放后以保... 我国现代劳动法理念的形成,经历了若干个阶段:一是在新中国成立前,旧军阀为镇压劳工运动,维护军阀利益,剥削劳动者,使劳动者失去法律保护阶段;二是新中国成立初期,以保障劳动者,忽视资本合理利益和单一行政干预阶段;三是改革开放后以保护劳动者,承认资本合理利益和限制行政干预阶段。 展开更多
关键词 劳动法理念劳动者资本
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一类SEIQR模型的稳定性分析以及模型仿真 被引量:1
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作者 胡瑞 黄立冬 +2 位作者 谭学文 李荣庭 徐权峰 《云南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第6期701-709,共9页
考虑一类潜伏期和染病期均具有传染性的SEIQR模型,且模型带有常规预防和医学隔离措施,利用再生矩阵方法计算模型的基本再生数R 0.运用Routh-Hurwitz判据,Lyapunov函数以及LaSalle不变集原理证明,当R 0<1时,模型存在唯一的无病平衡点... 考虑一类潜伏期和染病期均具有传染性的SEIQR模型,且模型带有常规预防和医学隔离措施,利用再生矩阵方法计算模型的基本再生数R 0.运用Routh-Hurwitz判据,Lyapunov函数以及LaSalle不变集原理证明,当R 0<1时,模型存在唯一的无病平衡点P 0且P 0全局渐近稳定;当R 0>1时,模型存在2个平衡点,无病平衡点P 0不稳定,地方病平衡点P*全局渐近稳定.通过对模型基本再生数的敏感性分析,得出各个参数对传染病传播的影响,并考虑模型中常规预防和医学隔离措施,对模型进行数值模拟,解释和说明措施的必要性和有效性. 展开更多
关键词 SEIQR模型 基本再生数 敏感性分析 防疫措施
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基于EfficientNet的星系形态分类研究 被引量:3
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作者 艾霖嫔 徐权峰 +4 位作者 杜利婷 许婷婷 高献军 李广平 周卫红 《天文学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期42-49,共8页
星系的结构和形态能够反映星系自身的物理性质,其形态的分类是后续分析研究的一个重要环节.EfficientNet模型使用复合系数对深度网络模型的深度、宽度、输入图像分辨率进行更加结构化的统一缩放,是一种新的深度网络优化扩展方法.将该模... 星系的结构和形态能够反映星系自身的物理性质,其形态的分类是后续分析研究的一个重要环节.EfficientNet模型使用复合系数对深度网络模型的深度、宽度、输入图像分辨率进行更加结构化的统一缩放,是一种新的深度网络优化扩展方法.将该模型应用于星系数据形态的分类研究中,结果表明基于EfficientNet-B5模型的平均准确率、精确率、召回率以及F1分数(精确率与召回率的调和平均数)都在96.6%以上,与残差网络(Residual network,ResNet)中ResNet-26模型的分类结果相比有较大的提升.实验结果证明EfficientNet的深度网络优化扩展方法可行且有效,可应用于星系的形态分类. 展开更多
关键词 方法:数据分析 技术:图像处理 星系:普通
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一类潜伏期与染病期均具有传染性的随机传染病模型 被引量:2
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作者 胡瑞 黄立冬 +1 位作者 李荣庭 徐权峰 《云南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第2期213-220,234,共9页
考虑在环境白噪音扰动下建立一类潜伏期和染病期均具有传染性的随机SEIQR模型.首先利用Lyapunov函数和Ito公式证明随机SEIQR传染病模型存在唯一的全局正解.其次讨论当基本再生数不大于1时,给出相应确定性模型的无病平衡点渐近稳定的充... 考虑在环境白噪音扰动下建立一类潜伏期和染病期均具有传染性的随机SEIQR模型.首先利用Lyapunov函数和Ito公式证明随机SEIQR传染病模型存在唯一的全局正解.其次讨论当基本再生数不大于1时,给出相应确定性模型的无病平衡点渐近稳定的充分条件,当白噪声较小时,疾病将灭绝;当基本再生数大于1时,给出相应确定性模型的地方病平衡点渐近稳定的充分条件,反应了在一定条件下,疾病将流行. 展开更多
关键词 传染病模型 随机微分方程 LYAPUNOV函数 ITO公式 渐近稳定性
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基于一维卷积神经网络的恒星光谱分类研究 被引量:2
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作者 艾霖嫔 杨锦涛 +3 位作者 徐权峰 张静敏 杜利婷 周卫红 《云南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第3期258-263,共6页
对天体光谱数据进行分类,是天文研究的重要步骤.鉴于一维卷积神经网络可以很好地分析具有固定长度周期的信号数据,为了更进一步提高F5、G5、K5型恒星光谱数据的分类精确度,在LAMOST数据库中选取这3种恒星光谱应用于一维卷积神经网络,进... 对天体光谱数据进行分类,是天文研究的重要步骤.鉴于一维卷积神经网络可以很好地分析具有固定长度周期的信号数据,为了更进一步提高F5、G5、K5型恒星光谱数据的分类精确度,在LAMOST数据库中选取这3种恒星光谱应用于一维卷积神经网络,进行分类研究,并与DBN、Inception v3等实验进行对比,验证了一维卷积神经网络对于天体光谱分类的有效性. 展开更多
关键词 LAMOST 一维卷积神经网络 光谱 分类识别
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舰船遥感图像数据集DSTD的构建研究 被引量:2
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作者 何维娟 江涛 +2 位作者 王林飞 徐权峰 王欣 《计算机技术与发展》 2022年第7期82-86,92,共6页
目标检测算法在PASCAL VOC、COCO等一系列数据集中都取得了一定的效果,但是都是面向自然场景下的多目标检测任务,而这些数据集中的单类目标场景往往很单一,相应目标数量也很少,针对特定场景和特定目标的数据集并不多见。而对于此类任务... 目标检测算法在PASCAL VOC、COCO等一系列数据集中都取得了一定的效果,但是都是面向自然场景下的多目标检测任务,而这些数据集中的单类目标场景往往很单一,相应目标数量也很少,针对特定场景和特定目标的数据集并不多见。而对于此类任务的数据集往往也是很有价值的,例如遥感场景下的舰船检测或者飞机检测。针对此问题,构建一种面向遥感场景的大规模水面舰船目标检测数据集,其数据集的主要来源为DIOR、DOTA、NWPU-VHRdataset、TGRS-HRRSD-Dataset-master等几个开源数据集,将其命名为DSTD(dataset for ship target detection),数据集中包含4854张舰船图片,87076个舰船实例。DSTD数据集具有数量多、多尺度和成像差异大以及较高的类内多样性等特点。在构建数据集的基础上,进一步分析了遥感舰船图像的细节特征,评估了一些经典目标检测方法的性能,并进行了实验对比,验证了该数据集的可行性,同时发现了当前较适合舰船的检测方法:即YOLOV5。使用YOLOV5算法进行舰船图像目标检测,在保证高检测精度的同时,能保持极快的检测速度。 展开更多
关键词 目标检测 遥感 数据集 舰船 YOLOV5
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基于迁移学习和集成学习的医疗文本分类 被引量:1
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作者 郑承宇 王新 +1 位作者 王婷 徐权峰 《计算机技术与发展》 2022年第4期28-33,共6页
针对医疗文本语义稀疏、维度过高的问题,提出一种基于迁移学习和集成学习的多标签医疗文本分类算法(Trans-LSTM-CNN-Multi,TLCM)。该算法采用ALBERT(A Lite BERT)模型内部的多层双向Transfomer结构对大型语料库展开训练,获取通用领域的... 针对医疗文本语义稀疏、维度过高的问题,提出一种基于迁移学习和集成学习的多标签医疗文本分类算法(Trans-LSTM-CNN-Multi,TLCM)。该算法采用ALBERT(A Lite BERT)模型内部的多层双向Transfomer结构对大型语料库展开训练,获取通用领域的文本动态字向量表示。然后,利用医学领域目标数据集通过迁移学习和模型微调技术实现ALBERT预训练语言模型在医学领域的文本语义增强。在此基础上,将上述通过迁移学习得到的文本语义增强模型输入到Bi-LSTM-CNN集成学习模块,进一步提取医学文本内容的重要信息特征。最后,基于二元交叉熵损失函数构造文本多标签分类器实现医疗文本分类。实验结果表明,通过迁移学习和集成学习的TLCM文本分类算法能有效提升医疗文本的分类性能,在中文健康问句数据集上整体F1值达到了91.8%。 展开更多
关键词 迁移学习 集成学习 ALBERT Bi-LSTM-CNN 医疗文本 健康问句
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基于双层卷积神经网络的DNA N4-胞嘧啶甲基化位点预测
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作者 陈鹏辉 徐权峰 +5 位作者 李荣庭 王煜 胡梦 喻文霞 李慧敏 唐轶 《云南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第4期450-457,472,共9页
DNA N4-胞嘧啶甲基化(N4-methylcytosine,4mC)是一种重要的表观遗传修饰,能在基因表达、细胞修复、DNA复制及保护等方面发挥作用.机器学习算法在预测4mC位点时,一个重要的环节是特征提取,为更充分地提取数据特征,进一步提高4mC位点的预... DNA N4-胞嘧啶甲基化(N4-methylcytosine,4mC)是一种重要的表观遗传修饰,能在基因表达、细胞修复、DNA复制及保护等方面发挥作用.机器学习算法在预测4mC位点时,一个重要的环节是特征提取,为更充分地提取数据特征,进一步提高4mC位点的预测准确率,提出了一种基于双层卷积神经网络的4mC位点预测模型.首先,将序列数据进行特征编码,搭建具有双卷积层和双池化层的卷积神经网络模型,采用L2范式正则化避免模型过拟合,并采用10折交叉验证保证模型预测的稳定性;其次,对模型参数进行调试,选取预测能力较高的参数组合进行模型训练;最后,将模型的4mC位点预测能力与几种已有算法进行比较.结果表明,双层卷积神经网络模型具有较好的预测性能和鲁棒性,优于基于一般机器学习和单层卷积神经网络的4mC位点预测算法,有效提高了4mC位点的预测能力. 展开更多
关键词 N4-胞嘧啶甲基化位点 双层卷积神经网络 碱基序列 深度学习
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