野生罗非鱼响应低温胁迫的脑组织转录组测序分析

【目的】比较低温胁迫下野生罗非鱼和养殖吉富罗非鱼的基因表达模式,揭示野生罗非鱼低温应答的特有分子调控机制,为后续开展野生罗非鱼耐冷亲本大范围筛选打下基础。【方法】挑选规格相近的野生罗非鱼和养殖吉富罗非鱼进行梯度降温试验,水温先以1℃/12 h的速度从26℃降至14℃,并保持288 h(12 d),于26℃、20℃及14℃保持0、120和288 h等5个时间点分别解剖罗非鱼采集脑组织样品,构建cDNA文库后以Illumina HiSeq×Ten测序平台进行双端测序及比较转录组分析,并采用实时荧光定量PCR对具有重要功能的差异表达基因(DEGs)进行表达验证。【结果】野生罗非鱼在11℃时开始出现死亡个体,但在8℃时仍有50.0%的存活个体,说明野生罗非鱼较养殖吉富罗非鱼具有更强的低温耐受能力。在14℃的长时间低温胁迫过程中,养殖吉富罗非鱼脑组织中表达显著上调的差异表达基因数量约是野生罗非鱼的10倍,即养殖吉富罗非鱼的应激反应远比野生罗非鱼强烈。KEGG信号通路富集分析结果显示,养殖吉富罗非鱼和野生罗非鱼在14℃保持120和288 h的上调差异表达基因均富集到核糖体发生、内质网蛋白加工及剪接体信号等信号通路上,野生罗非鱼的上调差异表达基因还额外富集到核苷酸切除修复、N-糖基化生物合成和DNA复制信号等通路上。与养殖吉富罗非鱼相比,在野生罗非鱼中发现577个特有的差异表达基因,主要富集在NOD受体信号通路、凋亡和内吞等通路上,且表现为NOD受体信号通路被启动,而细胞凋亡受抑制。在野生罗非鱼中,参与NOD受体信号通路的关键功能基因(Nemo、NFκB、p38、JNK和IL-1β)在长时间低温胁迫中均维持在一个较高的表达水平,而内吞途径关键基因的表达上升倍数也明显高于养殖吉富罗非鱼。【结论】野生罗非鱼通过避免过度的应激反应和维持低水平代谢的细胞稳定以减轻低温胁迫对机体的损伤,并持续启动NOD受体信号通路及内吞途径以维持其免疫能力,而具有较养殖罗非鱼更强的低温耐受力。

基于AHP分析A公司棉布供应商的选择与评价文献述评

研究了A公司对棉布供应商的选择与评价,结合纺织业外贸行业的特点和棉布供应链的发展过程,研究如何建立和完善棉布供应商选择的评价体系,并对该体系的建立提出了管理制度等方面的建议。

金振口服液治疗支气管哮喘的药效作用和分子机制

目的建立小鼠支气管哮喘模型和人非小细胞肺癌细胞(A549)炎症模型,研究金振口服液(Jinzhen Oral Liquid,JZOL)对支气管哮喘的药效作用和分子机制。方法将66只雌性BALB/c小鼠随机分为对照组和模型组,模型组小鼠采用卵清蛋白(OVA)致敏法建立哮喘模型后,将其分为模型组和JZOL高、中、低剂量(4.4、2.2、1.1 mg·kg^(-1))组和地塞米松组(Dex,2 mg·kg^(-1))。全身体积描记系统测定小鼠气道反应Penh值。HE染色观察小鼠肺组织病理学情况。瑞氏-姬姆萨染色检测肺泡灌洗液(BALF)中炎性细胞数量。ELISA检测BALF中肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和血清中免疫球蛋白E(IgE)和免疫球蛋白G1(IgG1)浓度。采用20 ng·mL^(-1)白细胞介素(IL)-1β诱导A549细胞24 h建立细胞炎症模型,随机分为对照组、模型组以及4个质量浓度JZOL(5.39、2.69、1.35、0.67 mg·mL^(-1))处理组。MTS法测定JZOL对A549细胞的药物毒性。采用RNA-seq技术对6个实验组进行转录组学分析,筛选差异基因,对其进行GSEA通路富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体(GO)注释通路富集分析,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)实验对筛选出的关键基因进行实验验证。结果体内实验表明,JZOL能够改善小鼠肺组织炎性细胞浸润,降低小鼠气道高反应性Penh值,减少BALF中巨噬细胞、嗜酸性粒细胞和中性粒细胞的数量,降低BALF中TNF-α和血清中IgE和IgG1的浓度。体外实验表明,JZOL对A549细胞的最大无毒浓度为5.39 mg·mL^(-1)。基因富集分析结果显示,与对照组相比,模型组共获得46条炎症模型相关通路,而JZOL不同浓度处理组对这些通路的逆转比例分别为34.8%(5.39 mg·mL^(-1))、50%(2.69 mg·mL^(-1))、32.6%(1.35 mg·mL^(-1))和26%(0.67 mg·mL^(-1))。差异表达基因(DEG)的KEGG富集分析显示,与对照组相比,模型组共富集到58条通路;与模型组相比,JZOL处理组共富集到32条通路,逆转了IL-17、TNF、核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路等。对IL-17信号通路中趋化因子配体1(CXCL1)、趋化因子配体2(CXCL2)、脂质运载蛋白2(LCN2)进行qRT-PCR验证,与转录组测序结果一致。结论JZOL对由OVA诱导的小鼠支气管哮喘模型具有显著的治疗功效,能有效缓解哮喘小鼠的气道高反应性并抑制肺部组织的炎症反应。其抗炎效果是通过调节CXCL1、CXCL2和LCN2这几个关键基因的表达,进而影响IL-17信号通路来实现的。

银杏二萜内酯葡胺注射液对缺血性脑卒中小鼠黑质脑区的调控机制研究

目的研究银杏二萜内酯葡胺注射液(Diterpene Ginkgolides Meglumine Injection,DGMI)在C57BL/6J小鼠大脑中动脉闭塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型黑质脑区中抗脑缺血再灌注损伤的潜在作用通路。方法C57BL/6J小鼠按随机数字表分为假手术组、模型组、DGMI(25 mg/kg)组及银杏叶提取物761(Ginkgo biloba extract-761,EGb-761,100 mg/kg)组,构建MCAO模型,通过测定各组小鼠术后24 h的改良版神经功能缺损评分和脑梗死率,评价DGMI相较于EGb-761治疗缺血性脑卒中的疗效。进一步利用Illumina二代测序平台对各组小鼠脑组织黑质样本进行高通量转录组测序,并结合基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析等生物信息学分析方法,评价DGMI抗脑缺血再灌注损伤作用及潜在作用机制。采用qRT-PCR验证转录组测序中关键基因表达。结果与假手术组比较,模型组改良版神经功能缺损评分和脑梗死率显著升高(P<0.001);与模型组比较,DGMI组治疗效果与EGb-761接近,可显著改善改良版神经功能缺损评分和脑梗死率(P<0.01、0.001)。转录组的数据降维分析显示,模型组与假手术组样本显著分离。GSEA结果显示,模型组与假手术组对比显著富集35条通路,DGMI组相较于模型组可有效逆转7条通路。与假手术组相比,模型组共筛选出88个DEGs,将其与他人发现的大小鼠MCAO模型组共同差异基因比较(15个),有10个基因相同。模型组GO功能分析主要富集在炎症和细胞趋化等过程,KEGG通路分析主要富集在细胞因子互作、肿瘤坏死因子等信号通路。与模型组相比,DGMI组DEGs的GO功能分析主要富集在神经信号传导过程,KEGG通路分析主要富集在多巴胺能信号通路、神经活性受体配体作用等。qRT-PCR验证与转录组结果基本一致。结论DGMI可有效抵抗脑缺血再灌注损伤,发挥作用的关键基因及信号通路主要集中于抗炎、调节神经突触等生物学过程,可能通过改善多巴胺能通路治疗损伤。