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基于板蓝根及其混伪品叶绿体基因组的mini-barcode开发及其定性能力的研究
被引量:
1
1
作者
郭华
徐流巍
+2 位作者
邢志美
杨霞
田晓轩
《天津中医药》
CAS
2023年第5期662-667,共6页
[目的]基于板蓝根及其混伪品的叶绿体基因组序列开发mini-barcode并验证其鉴定能力,为板蓝根的质量控制和科学评价提供方法。[方法]从GenBank数据库中下载板蓝根及其混伪品所有已发表的叶绿体基因组序列,导入PhyloSuite v1.2.1软件提取...
[目的]基于板蓝根及其混伪品的叶绿体基因组序列开发mini-barcode并验证其鉴定能力,为板蓝根的质量控制和科学评价提供方法。[方法]从GenBank数据库中下载板蓝根及其混伪品所有已发表的叶绿体基因组序列,导入PhyloSuite v1.2.1软件提取其共有蛋白编码基因并分别对齐,后续使用DnaSP 6软件进行核苷酸多态性分析以筛选出候选DNA mini-barcode区域。通过Geneious软件多序列比对,筛选高变区用于mini-barcode开发。针对候选条形码区域设计引物。采用试剂盒法提取板蓝根药材总DNA分别利用通用ITS2引物和该实验设计引物进行聚合酶链式反应(PCR)和测序。[结果]基于叶绿体基因组的核苷酸多态性分析结果,选择accD基因作为候选mini-barcode开发区域并设计了扩增引物。通过遗传距离和测序数据分析,该分子标记能被成功扩增并实现鉴定。[结论]开发了用于鉴定板蓝根及其混伪品的mini-barcode,为实现DNA降解的板蓝根药材及含板蓝根的中药制剂等混合样本的真伪鉴别奠定基础。
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关键词
板蓝根
叶绿体基因组
引物设计
mini-barcode
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职称材料
扩增子测序技术在中药分子鉴定中的应用
2
作者
张悦
张婷婷
+2 位作者
邢志美
徐流巍
田晓轩
《天津中医药大学学报》
CAS
2024年第10期937-943,共7页
中药鉴定是保证中药用药安全的关键环节。中药分子鉴定通过分析遗传物质的差异实现鉴定,弥补了传统鉴定方法主观性较强的不足,成为中药鉴定方法的有力补充。扩增子测序技术通过对特定片段进行扩增,结合不同测序技术实现物种鉴定。文章...
中药鉴定是保证中药用药安全的关键环节。中药分子鉴定通过分析遗传物质的差异实现鉴定,弥补了传统鉴定方法主观性较强的不足,成为中药鉴定方法的有力补充。扩增子测序技术通过对特定片段进行扩增,结合不同测序技术实现物种鉴定。文章对扩增子测序技术在生物鉴定中的优势、扩增子测序技术在中成药及中药材中的应用,以及扩增子测序技术在中药鉴定中的关键技术步骤进行总结梳理,分析扩增子测序技术在中药分子鉴定中的应用现状及未来发展,为后续中药分子鉴定工作提供研究思路。
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关键词
扩增子测序
中药鉴定
中药分子鉴定
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职称材料
题名
基于板蓝根及其混伪品叶绿体基因组的mini-barcode开发及其定性能力的研究
被引量:
1
1
作者
郭华
徐流巍
邢志美
杨霞
田晓轩
机构
天津中医药大学
现代中医药海河实验室
出处
《天津中医药》
CAS
2023年第5期662-667,共6页
文摘
[目的]基于板蓝根及其混伪品的叶绿体基因组序列开发mini-barcode并验证其鉴定能力,为板蓝根的质量控制和科学评价提供方法。[方法]从GenBank数据库中下载板蓝根及其混伪品所有已发表的叶绿体基因组序列,导入PhyloSuite v1.2.1软件提取其共有蛋白编码基因并分别对齐,后续使用DnaSP 6软件进行核苷酸多态性分析以筛选出候选DNA mini-barcode区域。通过Geneious软件多序列比对,筛选高变区用于mini-barcode开发。针对候选条形码区域设计引物。采用试剂盒法提取板蓝根药材总DNA分别利用通用ITS2引物和该实验设计引物进行聚合酶链式反应(PCR)和测序。[结果]基于叶绿体基因组的核苷酸多态性分析结果,选择accD基因作为候选mini-barcode开发区域并设计了扩增引物。通过遗传距离和测序数据分析,该分子标记能被成功扩增并实现鉴定。[结论]开发了用于鉴定板蓝根及其混伪品的mini-barcode,为实现DNA降解的板蓝根药材及含板蓝根的中药制剂等混合样本的真伪鉴别奠定基础。
关键词
板蓝根
叶绿体基因组
引物设计
mini-barcode
Keywords
Isatis indigotica
chloroplast genome
primer design
mini-barcode
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
扩增子测序技术在中药分子鉴定中的应用
2
作者
张悦
张婷婷
邢志美
徐流巍
田晓轩
机构
天津中医药大学
出处
《天津中医药大学学报》
CAS
2024年第10期937-943,共7页
基金
天津中医药大学研究生科研创新项目(YJSKC-20221036)
天津市研究生科研创新项目(2022SKY227)
天津中医药大学第十三届大学生科技创新基金项目(KJ15)。
文摘
中药鉴定是保证中药用药安全的关键环节。中药分子鉴定通过分析遗传物质的差异实现鉴定,弥补了传统鉴定方法主观性较强的不足,成为中药鉴定方法的有力补充。扩增子测序技术通过对特定片段进行扩增,结合不同测序技术实现物种鉴定。文章对扩增子测序技术在生物鉴定中的优势、扩增子测序技术在中成药及中药材中的应用,以及扩增子测序技术在中药鉴定中的关键技术步骤进行总结梳理,分析扩增子测序技术在中药分子鉴定中的应用现状及未来发展,为后续中药分子鉴定工作提供研究思路。
关键词
扩增子测序
中药鉴定
中药分子鉴定
Keywords
amplicon sequencing
traditional Chinese medicine identification
molecular identification of traditional Chinese medicine
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于板蓝根及其混伪品叶绿体基因组的mini-barcode开发及其定性能力的研究
郭华
徐流巍
邢志美
杨霞
田晓轩
《天津中医药》
CAS
2023
1
下载PDF
职称材料
2
扩增子测序技术在中药分子鉴定中的应用
张悦
张婷婷
邢志美
徐流巍
田晓轩
《天津中医药大学学报》
CAS
2024
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职称材料
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