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基于网络药理学与分子对接探讨葛根芩连汤治疗认知功能障碍的作用机制
被引量:
1
1
作者
李俊诚
赵灿斌
+1 位作者
徐瑞蕊
刘春梅
《中国民间疗法》
2024年第11期97-102,共6页
目的:本研究通过网络药理学和分子对接方法分析葛根芩连汤治疗认知功能障碍的潜在分子靶点和治疗机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)确定药物的作用靶点。通过查询疾病基因网络数据库(DisGeNET)、药物数据库(DrugBa...
目的:本研究通过网络药理学和分子对接方法分析葛根芩连汤治疗认知功能障碍的潜在分子靶点和治疗机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)确定药物的作用靶点。通过查询疾病基因网络数据库(DisGeNET)、药物数据库(DrugBank)、人类基因数据库(GeneCards)、药物基因组学知识库(PharmGKB)获得认知功能障碍的潜在靶点,并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,基于Cytoscape 3.9.1获得葛根芩连汤和认知功能障碍的核心靶点;应用R软件包R 4.2.1进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,将筛选的关键成分和靶基因采用AutoDock软件进行分子对接,选择最佳结合靶点,验证结合活性。结果:获得葛根苓连汤有效活性成分140个,成分对应靶点基因241个,认知功能障碍靶点1 514个。基于PPI网络构建获得88个共同基因。基于Cytoscape软件获得28个核心靶点。GO分析结果显示,基因在氧化应激反应、细胞外刺激反应等生物过程中显著富集。KEGG富集分析显示,主要信号通路涉及脂质代谢、神经细胞衰老等方面,其中在AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路中富集到很多核心靶点基因。分子对接验证结果显示,葛根芩连汤的相关活性成分与核心靶点具有良好的亲和性,其中千层纸素A与IL6具有最小结合能。结论:葛根芩连汤治疗认知功能障碍的作用机制可能涉及炎性反应、细胞衰老、细胞代谢的调节,其中葛根芩连汤中的千层纸素A是最有治疗潜力的活性成分。
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关键词
认知功能障碍
痴呆
善忘
葛根芩连汤
千层纸素A
网络药理学
作用机制
分子对接
下载PDF
职称材料
中药防风抗流感病毒活性及不同极性部位的谱效相关性分析
被引量:
13
2
作者
姜晓琳
张继秋
+4 位作者
徐瑞蕊
蒋明浩
亢倩丽
杨勇
巩丽丽
《天然产物研究与开发》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期473-481,397,共10页
研究防风不同极性部位指纹图谱与抗流感病毒活性的谱效关系,推断防风中具有抗流感病毒活性的有效成分。本实验采用细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)法检测防风不同极性部位的抗流感病毒活性;建立防风不同极性部位的UPLC-Q-Exactive ...
研究防风不同极性部位指纹图谱与抗流感病毒活性的谱效关系,推断防风中具有抗流感病毒活性的有效成分。本实验采用细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)法检测防风不同极性部位的抗流感病毒活性;建立防风不同极性部位的UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS指纹图谱;采用Spearman分析、灰色关联度分析(GRA)及偏最小二乘回归(PLSR)分析法分析防风不同极性部位的UPLC特征指纹峰与其抗流感病毒活性之间的谱效关系。在标定的28个特征指纹峰中,确定了1、5、7、11、13、20、24号峰与抗流感病毒活性呈正相关,其对应的物质依次是焦谷氨酸、divaricatacid、升麻苷、亥茅酚苷、补骨脂素、异嗪皮啶、5-羟基-8-甲氧基补骨脂素,为深入研究防风抗流感病毒活性物质基础提供实验基础。
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关键词
防风
超高效液相色谱-串联四级杆静电场轨道阱高分辨质谱
抗流感病毒
谱效相关
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接探讨葛根芩连汤治疗认知功能障碍的作用机制
被引量:
1
1
作者
李俊诚
赵灿斌
徐瑞蕊
刘春梅
机构
山东中医药大学
山东省济宁市第一人民医院
山东中医药大学附属医院
出处
《中国民间疗法》
2024年第11期97-102,共6页
文摘
目的:本研究通过网络药理学和分子对接方法分析葛根芩连汤治疗认知功能障碍的潜在分子靶点和治疗机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)确定药物的作用靶点。通过查询疾病基因网络数据库(DisGeNET)、药物数据库(DrugBank)、人类基因数据库(GeneCards)、药物基因组学知识库(PharmGKB)获得认知功能障碍的潜在靶点,并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,基于Cytoscape 3.9.1获得葛根芩连汤和认知功能障碍的核心靶点;应用R软件包R 4.2.1进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,将筛选的关键成分和靶基因采用AutoDock软件进行分子对接,选择最佳结合靶点,验证结合活性。结果:获得葛根苓连汤有效活性成分140个,成分对应靶点基因241个,认知功能障碍靶点1 514个。基于PPI网络构建获得88个共同基因。基于Cytoscape软件获得28个核心靶点。GO分析结果显示,基因在氧化应激反应、细胞外刺激反应等生物过程中显著富集。KEGG富集分析显示,主要信号通路涉及脂质代谢、神经细胞衰老等方面,其中在AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路中富集到很多核心靶点基因。分子对接验证结果显示,葛根芩连汤的相关活性成分与核心靶点具有良好的亲和性,其中千层纸素A与IL6具有最小结合能。结论:葛根芩连汤治疗认知功能障碍的作用机制可能涉及炎性反应、细胞衰老、细胞代谢的调节,其中葛根芩连汤中的千层纸素A是最有治疗潜力的活性成分。
关键词
认知功能障碍
痴呆
善忘
葛根芩连汤
千层纸素A
网络药理学
作用机制
分子对接
分类号
R289 [医药卫生—方剂学]
下载PDF
职称材料
题名
中药防风抗流感病毒活性及不同极性部位的谱效相关性分析
被引量:
13
2
作者
姜晓琳
张继秋
徐瑞蕊
蒋明浩
亢倩丽
杨勇
巩丽丽
机构
山东中医药大学药学院
山东中医药大学实验中心
出处
《天然产物研究与开发》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期473-481,397,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(81774167)
山东中医药大学2019年大学生创新训练计划(S201910441036)。
文摘
研究防风不同极性部位指纹图谱与抗流感病毒活性的谱效关系,推断防风中具有抗流感病毒活性的有效成分。本实验采用细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)法检测防风不同极性部位的抗流感病毒活性;建立防风不同极性部位的UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS指纹图谱;采用Spearman分析、灰色关联度分析(GRA)及偏最小二乘回归(PLSR)分析法分析防风不同极性部位的UPLC特征指纹峰与其抗流感病毒活性之间的谱效关系。在标定的28个特征指纹峰中,确定了1、5、7、11、13、20、24号峰与抗流感病毒活性呈正相关,其对应的物质依次是焦谷氨酸、divaricatacid、升麻苷、亥茅酚苷、补骨脂素、异嗪皮啶、5-羟基-8-甲氧基补骨脂素,为深入研究防风抗流感病毒活性物质基础提供实验基础。
关键词
防风
超高效液相色谱-串联四级杆静电场轨道阱高分辨质谱
抗流感病毒
谱效相关
Keywords
Saposhnikovia divaricata
UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS
anti-influenza virus
spectrum activity relationship
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学与分子对接探讨葛根芩连汤治疗认知功能障碍的作用机制
李俊诚
赵灿斌
徐瑞蕊
刘春梅
《中国民间疗法》
2024
1
下载PDF
职称材料
2
中药防风抗流感病毒活性及不同极性部位的谱效相关性分析
姜晓琳
张继秋
徐瑞蕊
蒋明浩
亢倩丽
杨勇
巩丽丽
《天然产物研究与开发》
CAS
CSCD
北大核心
2020
13
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职称材料
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