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南蛇藤假种皮形成过程中萜类合成基因的表达分析
1
作者
祖奎玲
董树斌
+2 位作者
李建霞
徐申健
赵良成
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期276-282,共7页
为探究南蛇藤(Celastrus orbiculatus Thunb.)假种皮发育过程中萜类物质合成相关基因的表达差异,本文选取3个不同发育时期(盛花期、落花期和幼果期)的南蛇藤雌花为实验材料,构建3个c DNA文库,通过Illumina Hi SeqTM2000平台进行转录组测...
为探究南蛇藤(Celastrus orbiculatus Thunb.)假种皮发育过程中萜类物质合成相关基因的表达差异,本文选取3个不同发育时期(盛花期、落花期和幼果期)的南蛇藤雌花为实验材料,构建3个c DNA文库,通过Illumina Hi SeqTM2000平台进行转录组测序,共获得87 600个unigene序列,平均长度为453 bp,N50/N90比值为4.64。通过3个不同发育阶段基因差异表达的比较及功能富集分析,鉴定出16个萜类合成相关基因,其中8个基因的编码蛋白参与调控7个萜类合成代谢位点。还确定了与萜类合成相关的7个转录因子家族的成员数量以及相对表达量最高的基因。
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关键词
南蛇藤
萜类合成
差异基因
转录因子
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职称材料
题名
南蛇藤假种皮形成过程中萜类合成基因的表达分析
1
作者
祖奎玲
董树斌
李建霞
徐申健
赵良成
机构
北京林业大学自然保护区学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期276-282,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31370213)
北京市自然科学基金项目(5133036)~~
文摘
为探究南蛇藤(Celastrus orbiculatus Thunb.)假种皮发育过程中萜类物质合成相关基因的表达差异,本文选取3个不同发育时期(盛花期、落花期和幼果期)的南蛇藤雌花为实验材料,构建3个c DNA文库,通过Illumina Hi SeqTM2000平台进行转录组测序,共获得87 600个unigene序列,平均长度为453 bp,N50/N90比值为4.64。通过3个不同发育阶段基因差异表达的比较及功能富集分析,鉴定出16个萜类合成相关基因,其中8个基因的编码蛋白参与调控7个萜类合成代谢位点。还确定了与萜类合成相关的7个转录因子家族的成员数量以及相对表达量最高的基因。
关键词
南蛇藤
萜类合成
差异基因
转录因子
Keywords
Celastrus orbiculatus Thunb.
Terpenoid biosynthesis
Differentially expressed genes
Transcription factors
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
南蛇藤假种皮形成过程中萜类合成基因的表达分析
祖奎玲
董树斌
李建霞
徐申健
赵良成
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
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参考文献
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