目的:运用网络药理学方法预测三七治疗消化性溃疡的潜在作用靶点及通路。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取三七有效成分及相应...目的:运用网络药理学方法预测三七治疗消化性溃疡的潜在作用靶点及通路。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取三七有效成分及相应的蛋白质靶点,通过Uniprot数据库进行蛋白质靶点-基因匹配,并标准化蛋白质信息。借助人类基因组注释(GeneCards)数据库获取消化性溃疡发病相关基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—消化性溃疡的交集靶点。通过STRING在线数据库构建蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示。使用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。最后利用Cytoscape 3.7.1软件,制作“活性成分-靶点-通路”网络。结果:预测到三七有8个有效成分,178个作用靶点,获得消化性溃疡疾病靶点765个,三七—消化性溃疡的交集靶点81个,关键靶点12个;GO分析结果显示,三七—消化性溃疡的交集基因的生物功能主要涉及对脂多糖的反应、对氧化应激的反应、对无机物的反应、积极调节细胞运动等生物过程;膜筏、囊泡腔、膜小凹、胶原蛋白的细胞外基质等细胞组成;细胞因子受体结合、转录因子结合、激酶结合、血红素结合等分子功能。KEGG通路富集分析结果显示,三七—消化性溃疡的交集基因的通路主要涉及癌症疾病的通路、卡波西肉瘤相关的疱疹病毒感染、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、白细胞介素-17(Interleukin 17,IL-17)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)信号通路等。结论:三七治疗消化性溃疡的作用体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,为三七进一步的研究奠定了数据基础。展开更多
文摘目的:运用网络药理学方法预测三七治疗消化性溃疡的潜在作用靶点及通路。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取三七有效成分及相应的蛋白质靶点,通过Uniprot数据库进行蛋白质靶点-基因匹配,并标准化蛋白质信息。借助人类基因组注释(GeneCards)数据库获取消化性溃疡发病相关基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—消化性溃疡的交集靶点。通过STRING在线数据库构建蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示。使用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。最后利用Cytoscape 3.7.1软件,制作“活性成分-靶点-通路”网络。结果:预测到三七有8个有效成分,178个作用靶点,获得消化性溃疡疾病靶点765个,三七—消化性溃疡的交集靶点81个,关键靶点12个;GO分析结果显示,三七—消化性溃疡的交集基因的生物功能主要涉及对脂多糖的反应、对氧化应激的反应、对无机物的反应、积极调节细胞运动等生物过程;膜筏、囊泡腔、膜小凹、胶原蛋白的细胞外基质等细胞组成;细胞因子受体结合、转录因子结合、激酶结合、血红素结合等分子功能。KEGG通路富集分析结果显示,三七—消化性溃疡的交集基因的通路主要涉及癌症疾病的通路、卡波西肉瘤相关的疱疹病毒感染、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、白细胞介素-17(Interleukin 17,IL-17)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)信号通路等。结论:三七治疗消化性溃疡的作用体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,为三七进一步的研究奠定了数据基础。
