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川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析
1
作者
胡月
赵舒媛
+7 位作者
张亚美
贾榕
惠探月
凌春燕
赵丽丽
王艳
王勇
向蓓蓓
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第8期2528-2536,共9页
由Sm C4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶。本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测...
由Sm C4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶。本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测该基因的组织表达差异和不同胁迫处理条件下的表达情况。生物信息学分析结果显示SmC4H基因c DNA全长1 518 bp,编码505个氨基酸,相对分子质量为51.83 kD,为亲水性较强的不稳定蛋白,二级结构由47.52%α-螺旋、14.06%延伸链、4.95%β-转角和33.47%无规则卷曲构成,预测该蛋白可能不具有跨膜结构,不含有信号肽,属于p450超家族。SmC4H蛋白的相似性与其他植物的C4H蛋白较高,其中与美女樱(Glandularia×hybrida)的相似性最高。RT-qPCR结果显示,SmC4H基因在根、茎、花、叶中均有表达,表达量根>茎>花>叶,硝普钠(SNP)、赤霉素(GA3)和脱落(ABA)在一定程度上能使SmC4H基因的表达上调。此结果为进一步研究该基因在川西獐牙菜苯丙烷途径中的功能和通过基因工程手段提高呫吨酮化合物产量奠定了基础。
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关键词
川西獐牙菜
肉桂酸-4-羟基化酶
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
原文传递
藏药植物的分子生物学研究现状和展望
被引量:
3
2
作者
赵舒媛
胡月
+5 位作者
贾榕
张亚美
惠探月
赵丽丽
凌春燕
向蓓蓓
《药物生物技术》
CAS
2022年第5期515-521,共7页
藏药是重要的民族药资源,具有极高的药用研究价值,随着近年来研究人员对藏药植物的研究进展,许多藏药植物生长情况及药用成分已经逐渐清晰。为了给今后藏药相关研究提供重要的理论依据和技术支持,文章根据近年来分子生物学相关方法在藏...
藏药是重要的民族药资源,具有极高的药用研究价值,随着近年来研究人员对藏药植物的研究进展,许多藏药植物生长情况及药用成分已经逐渐清晰。为了给今后藏药相关研究提供重要的理论依据和技术支持,文章根据近年来分子生物学相关方法在藏药植物领域中的运用,综述了藏药药效成分生物合成途径、藏药药用植物分子鉴定、藏药药理作用等方面的研究进展。文章对藏药植物的研究方法和研究进展进行系统归纳整理,对研究成果进行分析和借鉴。通过以上整理,为我国藏药资源的充分开发及临床利用提供参考,为藏药植物保护措施和今后研究方向进行了展望。
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关键词
藏药植物
分子生物学
生物合成途径
分子鉴定
研究进展
中药资源
川西獐芽菜
原文传递
题名
川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析
1
作者
胡月
赵舒媛
张亚美
贾榕
惠探月
凌春燕
赵丽丽
王艳
王勇
向蓓蓓
机构
天津中医药大学中药学院
天津中医药大学制药工程学院
南开大学生命科学学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第8期2528-2536,共9页
基金
国家自然科学基金项目(82074120)
国家级大学生创新训练项目(202010063006)
天津中医药大学研究生科研创新项目(YJSKC-20201024)共同资助。
文摘
由Sm C4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶。本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测该基因的组织表达差异和不同胁迫处理条件下的表达情况。生物信息学分析结果显示SmC4H基因c DNA全长1 518 bp,编码505个氨基酸,相对分子质量为51.83 kD,为亲水性较强的不稳定蛋白,二级结构由47.52%α-螺旋、14.06%延伸链、4.95%β-转角和33.47%无规则卷曲构成,预测该蛋白可能不具有跨膜结构,不含有信号肽,属于p450超家族。SmC4H蛋白的相似性与其他植物的C4H蛋白较高,其中与美女樱(Glandularia×hybrida)的相似性最高。RT-qPCR结果显示,SmC4H基因在根、茎、花、叶中均有表达,表达量根>茎>花>叶,硝普钠(SNP)、赤霉素(GA3)和脱落(ABA)在一定程度上能使SmC4H基因的表达上调。此结果为进一步研究该基因在川西獐牙菜苯丙烷途径中的功能和通过基因工程手段提高呫吨酮化合物产量奠定了基础。
关键词
川西獐牙菜
肉桂酸-4-羟基化酶
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Swertia mussoti Franch
Cinnamic acid 4-hydroxylase
Gene cloning
Bioinformatic analysis
Expression analysis
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
藏药植物的分子生物学研究现状和展望
被引量:
3
2
作者
赵舒媛
胡月
贾榕
张亚美
惠探月
赵丽丽
凌春燕
向蓓蓓
机构
天津中医药大学中药学院
出处
《药物生物技术》
CAS
2022年第5期515-521,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.82074120)
2020年度天津市研究生科研创新项目(No.YJSKC-20201024)
国家级大学生创新训练项目(No.202010063006)。
文摘
藏药是重要的民族药资源,具有极高的药用研究价值,随着近年来研究人员对藏药植物的研究进展,许多藏药植物生长情况及药用成分已经逐渐清晰。为了给今后藏药相关研究提供重要的理论依据和技术支持,文章根据近年来分子生物学相关方法在藏药植物领域中的运用,综述了藏药药效成分生物合成途径、藏药药用植物分子鉴定、藏药药理作用等方面的研究进展。文章对藏药植物的研究方法和研究进展进行系统归纳整理,对研究成果进行分析和借鉴。通过以上整理,为我国藏药资源的充分开发及临床利用提供参考,为藏药植物保护措施和今后研究方向进行了展望。
关键词
藏药植物
分子生物学
生物合成途径
分子鉴定
研究进展
中药资源
川西獐芽菜
Keywords
Tibetan medicinal plants
Molecular biology
Biosynthetic pathway
Molecular identification
Research progress
Traditional Chinese medicine resources
Swertia mussotii
分类号
R282.71 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析
胡月
赵舒媛
张亚美
贾榕
惠探月
凌春燕
赵丽丽
王艳
王勇
向蓓蓓
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
0
原文传递
2
藏药植物的分子生物学研究现状和展望
赵舒媛
胡月
贾榕
张亚美
惠探月
赵丽丽
凌春燕
向蓓蓓
《药物生物技术》
CAS
2022
3
原文传递
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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