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控制虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因的筛查
被引量:
8
1
作者
任晓亮
侯睿
+3 位作者
王珊
战渊超
黄晓婷
包振民
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第9期41-47,共7页
利用抑制性差减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)对虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因进行筛查和分析。以虾夷扇贝橘红色闭壳肌和白色闭壳肌cDNA构建正反向差减文库,结合454测序技术在正向差减文库中测序得到2 ...
利用抑制性差减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)对虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因进行筛查和分析。以虾夷扇贝橘红色闭壳肌和白色闭壳肌cDNA构建正反向差减文库,结合454测序技术在正向差减文库中测序得到2 640条序列,拼接得到50个contigs(重叠群);反向差减文库中测序得到2 496条序列,拼接得到187个contigs。经过同源性比对分析,共获得150多个差异表达基因,从中选择3种清道夫受体SRB1、SRF2和SRCR作为候选基因进行研究,对其在虾夷扇贝各组织中的表达量水平进行检测,初步阐述了其在虾夷扇贝中的组织表达规律。根据结果推测在虾夷扇贝橘红色闭壳肌中,清道夫受体有可能是调节类胡萝卜素累积和转运的关键基因。本研究为虾夷扇贝闭壳肌类胡萝卜素累积相关通路的探索提供了初步研究的基础数据。
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关键词
虾夷扇贝
闭壳肌
类胡萝卜素
抑制性差减杂交
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职称材料
题名
控制虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因的筛查
被引量:
8
1
作者
任晓亮
侯睿
王珊
战渊超
黄晓婷
包振民
机构
中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室
出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第9期41-47,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31072190
31130054)
+1 种基金
国家重点基础研究发展计划项目(2010CB126406)
现代农业产业技术体系建设专项资助
文摘
利用抑制性差减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)对虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因进行筛查和分析。以虾夷扇贝橘红色闭壳肌和白色闭壳肌cDNA构建正反向差减文库,结合454测序技术在正向差减文库中测序得到2 640条序列,拼接得到50个contigs(重叠群);反向差减文库中测序得到2 496条序列,拼接得到187个contigs。经过同源性比对分析,共获得150多个差异表达基因,从中选择3种清道夫受体SRB1、SRF2和SRCR作为候选基因进行研究,对其在虾夷扇贝各组织中的表达量水平进行检测,初步阐述了其在虾夷扇贝中的组织表达规律。根据结果推测在虾夷扇贝橘红色闭壳肌中,清道夫受体有可能是调节类胡萝卜素累积和转运的关键基因。本研究为虾夷扇贝闭壳肌类胡萝卜素累积相关通路的探索提供了初步研究的基础数据。
关键词
虾夷扇贝
闭壳肌
类胡萝卜素
抑制性差减杂交
Keywords
Patinopecten yessoensis
adductor muscle
carotenoid
SSH
分类号
S197 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
控制虾夷扇贝闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因的筛查
任晓亮
侯睿
王珊
战渊超
黄晓婷
包振民
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012
8
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