拟南芥、水稻和杨树ACTIN家族全基因组分析

鉴定了覆盖拟南芥、水稻和杨树3种模式植物全基因组的20个拟南芥、18个水稻、22个杨树ACTIN蛋白基因,对其染色体定位、基因结构、基因复制等进行了综合分析.并在系统进化分析基础上,将ACTIN基因家族分为12个亚家族,有助于揭示植物ACTIN基因家族的进化历史,为后续ACTIN基因家族的功能提供线索,对研究植物ACTIN基因家族功能和进化上的多样性提供理论基础.

拟南芥和水稻SET结构域基因家族全基因组鉴定、分类和表达

SET(Su(var),Enhancer of zeste(E(z)),and Trithorax)结构域基因家族是一组含有保守SET结构域的蛋白的统称,它们参与蛋白甲基化,影响染色体结构,并且调控基因表达,在植物发育中起着重要的作用。分析拟南芥和水稻中SET结构域基因家族进化关系,对研究这一基因家族中各成员的功能有着重要的意义。我们系统地鉴定了47个拟南芥(Arabidopsis thaliana)和43个水稻(Orysa sativa japonica cultivar Nipponbare)的SET结构域基因,染色体定位和基因复制分析表明SET结构域基因扩增是由片段复制和反转录引起的,根据这些结构域差异和系统发育分析把拟南芥和水稻的SET结构域基因划分成5个亚家族。通过分析SET结构域基因家族在拟南芥和水稻各个发育阶段的表达谱,发现SET结构域基因绝大部分至少在一个组织中表达;大部分在花和花粉中高表达;一些SET结构域基因在某些组织中有特异的表达模式,表明与组织发育有密切的关系。在拟南芥和水稻中分别找到了4个差异表达基因。拟南芥4个差异基因都在花粉管高表达,水稻4个差异基因有3个在雄性花蕊中高表达,另一个在幼穗中高表达。

再力花强化人工湿地除汞效能的试验研究

环境中的汞可以通过沉降进入生态系统,各类水体也因人类生产活动受到汞污染的威胁,人工湿地作为一种常用的水质净化技术对重金属有良好的去除效果。通过围绕湿地去除汞的效能,开展湿地植物再力花的含汞营养液水培试验,考察了再力花的汞富集效能,并对种植再力花的人工湿地进行除汞试验,分析其除汞能力的提升效果。结果表明:在3种浓度(50、100、200μg/L)的含汞水培营养液中,再力花均长势良好,对汞具有一定的富集作用;再力花对汞的吸收途径主要是从根系富集,占到了植物体总汞吸收量的50%以上;在3种浓度(50、100、200μg/L)的含汞进水下,湿地CW-1(种植再力花)对THg(总汞)、PHg(颗粒态汞)的去除主要发生在湿地的前1/4段,整体去除率分别为82.1%~87.3%、80.0%~89.5%,DHg(溶解态汞)浓度沿程均匀降低,去除率为81.1%~94.1%;与具有相同填料结构但无植物的湿地CW-2相比,湿地CW-1对THg、PHg和DHg的去除率分别提高了7.7%~8.8%、4.8%~6.0%、16.7%~19.3%。

Genome-wide analysis of basic leucine zipper transcription factor families in Arabidopsis thaliana,Oryza sativa and Populus trichocarpa

The basic leucine zipper(bZIP) transcription factors form a large gene family that is important in pathogen defense,light and stress signaling,etc.The Completed whole genome sequences of model plants Arabidopsis(Arabidopsis thaliana),rice(Oryza sativa) and poplar(Populus trichocarpa) constitute a valuable resource for genome-wide analysis and genomic comparative analysis,as they are representatives of the two major evolutionary lineages within the angiosperms:the monocotyledons and the dicotyledons.In this study,bioinformatics analysis identified 74,89 and 88 bZIP genes respectively in Arabidopsis,rice and poplar.Moreover,a comprehensive overview of this gene family is presented,including the gene structure,phylogeny,chromosome distribution,conserved motifs.As a result,the plant bZIPs were organized into 10 subfamilies on basis of phylogenetic relationship.Gene duplication events during the family evolution history were also investigated.And it was further concluded that chromosomal/segmental duplication might have played a key role in gene expansion of bZIP gene family.

5G平行仿真网络靶场的架构设计与部署实践

5G靶场是通过实战检验5G网络安全防护能力的最佳手段之一。本文基于平行仿真和5G实体网络靶场的虚实互联理念,提出了5G平行仿真网络靶场的设计方案,并从靶标、攻击、防守、管控和监测5大维度,阐述了5G安全攻防演练靶场平台的整体部署,从5G网络攻防对抗的视角,分析了5G靶场攻防策略,由此通过5G靶场攻防演练助推5G安全创新研究、验证测评和攻防演练等靶场应用场景加速落地。

基于SNP实验流程的信息管理系统

针对研究单核苷酸多态性(SNP)分子生物实验的特点和需求,利用Java技术开发一套基于SNP实验流程的,并且集成TaqMan、Sequencing、Illumina 3个实验平台数据的实验室信息管理系统。系统为B/S体系,采用基于MVC(Model-View-Con- troller)模式的J2EE架构,层次清晰、界面友好、使用方便、支持多用户同时在线操作,且可跨操作系统平台(Windows/Linux/ Unix)运行。本文简要介绍系统的设计思路、体系架构、实现过程和主要功能。本系统实现了实验室数据的收集、存储、整合、查询,提高实验室的工作效率和管理水平,可为今后分子生物学、化学、医学以及其他实验学科的实验室信息管理系统的建设提供参考。