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番木瓜赖氨酸基序类受体激酶LysM-RLK基因家族鉴定及生物信息学分析
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作者 郭盼 孔华 +6 位作者 王雨 戴云素 贾瑞宗 周瑶 郭安平 纪长绵 马春花 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期867-879,共13页
本研究采用生物信息学方法在番木瓜全基因组范围系统鉴定了7个LysM-RLK家族基因,并解析了其染色体分布特征、基因结构特征、蛋白理化性质和亚细胞定位信息。基因家族进化分析表明番木瓜的7个LysM-RLK基因可划分为3个亚组(Lym-II,Lym-III... 本研究采用生物信息学方法在番木瓜全基因组范围系统鉴定了7个LysM-RLK家族基因,并解析了其染色体分布特征、基因结构特征、蛋白理化性质和亚细胞定位信息。基因家族进化分析表明番木瓜的7个LysM-RLK基因可划分为3个亚组(Lym-II,Lym-III,Lym-IV),并分布于4条染色体上。基因复制是番木瓜LysM-RLK家族进化的主要驱动力,基因复制分析鉴定得到7对复制基因。启动子序列调控元件分析发现其包含多个光响应元件及参与低温应答和逆境相关激素信号应答的元件。大规模比较转录组分析系统地解析了LysM-RLK在番木瓜生物胁迫、非生物胁迫条件下及不同组织中的基因表达模式,揭示其特异性的表达模式及潜在的生物学功能。复制基因对的表达分化、结构域组成差异和蛋白质三级结构的变化,暗示其在进化过程中的亚功能化现象。生物和非生物胁迫条件下的核心共表达网络分析鉴定了27个与LysM-RLK3强关联的核心基因,揭示了LysM-RLK3潜在的转录调控模式。相关结果为番木瓜LysM-RLK家族起源演化、功能分化及其在逆境响应和生长发育过程中的角色提供重要依据。 展开更多
关键词 番木瓜 LysM-RLK家族 生物信息分析 基因表达 蛋白三维结构
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宿迁商贸物流服务能力分析研究
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作者 戴云素 刘彬斌 《市场周刊》 2018年第2期36-37,共2页
在中国商务物流仍处于初级阶段的背景下,从国家对商贸物流业的政策中,可以发现商贸物流被越来越多的重视。文章经过对宿迁市商贸物流发展环境进行分析研究,指出在发展商贸物流的过程当中,宿迁商贸物流面临的机会与威胁,分析出需要改进... 在中国商务物流仍处于初级阶段的背景下,从国家对商贸物流业的政策中,可以发现商贸物流被越来越多的重视。文章经过对宿迁市商贸物流发展环境进行分析研究,指出在发展商贸物流的过程当中,宿迁商贸物流面临的机会与威胁,分析出需要改进的地方,从而加强商贸物流服务能力。 展开更多
关键词 商贸物流服务能力 第三方商贸物流 顾客满意度
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参薯miR172基因与靶基因AP2特征分析 被引量:1
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作者 王丹丹 刘梦丽 +5 位作者 戴云素 黄东益 肖勇 吴文嫱 黄小龙 夏薇 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第13期4216-4223,共8页
参薯是热带和亚热带的重要薯类作物,其块茎中富含淀粉。由于miR172是调控马铃薯块茎形成的关键基因,为分析miR172及其靶基因AP2的基因特征和不同发育时期的表达模式,本研究开展参薯miR172及靶基因预测分析和验证。基于参薯转录组和基因... 参薯是热带和亚热带的重要薯类作物,其块茎中富含淀粉。由于miR172是调控马铃薯块茎形成的关键基因,为分析miR172及其靶基因AP2的基因特征和不同发育时期的表达模式,本研究开展参薯miR172及靶基因预测分析和验证。基于参薯转录组和基因组序列,找到8个DalmiR172基因,并预测到其靶基因主要为AP2基因家族。通过多序列比对,发现8条DalmiR172成熟序列高度保守,其前体序列有一定差异。通过RT-qPCR分析参薯miR172在不同生长阶段中的表达情况,发现参薯已结薯植株中的表达量显著高于参薯幼苗期,表明miR172的表达水平在参薯幼苗到结薯时期呈增加趋势,推测miR172可能对参薯块茎形成具有促进作用。通过农杆菌介导的烟草瞬时表达实验验证了参薯miR172负调控AP2的转录水平。本研究为miR172-AP2调控模块在参薯生长发育过程中的功能分析提供实验依据。 展开更多
关键词 参薯(Dioscorea alata) miR172 AP2 特征分析
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气候变化背景下番茄角蓟马在全球的适生区预测 被引量:1
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作者 程春喜 姜明鑫 +5 位作者 高玉林 胡海琴 林南方 戴云素 吕宝乾 陈李林 《植物检疫》 2022年第6期72-79,共8页
番茄角蓟马是一种重要的检疫性害虫,现广泛分布于泰国、印度等热带及亚热带地区。本研究结合田间分布数据点,利用MaxEnt模型预测在当前及未来气候条件下该虫在全球的适生区分布。结果表明:在当前气候条件下,番茄角蓟马在全球的适生区主... 番茄角蓟马是一种重要的检疫性害虫,现广泛分布于泰国、印度等热带及亚热带地区。本研究结合田间分布数据点,利用MaxEnt模型预测在当前及未来气候条件下该虫在全球的适生区分布。结果表明:在当前气候条件下,番茄角蓟马在全球的适生区主要集中在热带及亚热带地区,高度适生区包括泰国、印度、中国、孟加拉国、缅甸、老挝、柬埔寨、东帝汶、尼泊尔、越南、菲律宾、肯尼亚、坦桑尼亚、马拉维、莫桑比克、布基纳法索、马里、几内亚、几内亚比绍、塞内加尔、巴西、哥伦比亚、委内瑞拉、古巴、墨西哥和澳大利亚等26个国家,而在我国,该虫的高度适生区主要分布在海南,零星分布于云南和台湾。在2050年的SSP2_4.5和SSP5_8.5两种气候条件下,番茄角蓟马在全球的高度适生区增加了巴基斯坦、索马里和埃塞俄比亚等10个国家,中低度适生区均有不同程度扩大,且整体向北移动。我国广西出现高度适生区,总的适生区相较于当前气候条件下均有不同程度扩大,几乎覆盖我国整个华南、华中和华东地区及西南南部地区。在未来全球气候变暖的情况下,番茄角蓟马将持续扩散,危害风险较大,预测其潜在适生区分布可为农业部门开展番茄角蓟马防控工作和为检验检疫部门制定检疫策略提供科学依据。 展开更多
关键词 番茄角蓟马 生物入侵 气候变化 适生区预测
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