左手螺旋Z-DNA的研究:人工合成的Oligod(G—C)_n在PAGE中的异常泳动行为

为研究DNA的B,Z构象的相互转换,我们人工合成了dG-dC交替互补顺序的六聚体与十二聚体,在用PAGE法纯化过程中,发现5',3'-末端为双羟基的寡聚体的泳动速率是d(G-C)_3>d(G-C)_2>d(G-C),5'—末端带磷酸基的相应寡聚体的泳动速率则是:d~*(G-C)>d~*(G-C)_2>d~*(G-C)_3,二者行为正好相反,而5',3'—末端为双羟基的d(G-C)_5与d(G-C)_6和5'—末端带磷酸基的十聚与十二聚体在PAGE中的泳动行为是一致的。由此推测5',3'—末端为双羟基的寡聚体在PAGE中的异常行为的转折点在六聚到十聚之间。

寡聚脱氧核苷酸d(G-C)_3的激光喇曼谱及其分析

用改进的固相磷酰三酯法合成了oligo-d(G-C)_3。以氩离子激光为激发光源,波长488nm.,在室温条件下,分别测定了纯化后的oligo-d(G-C)_3和其组分单体5’-dGMP和5’-dCMP的激光喇曼谱。观察到被测定的物质在300-2500cm^(-1)频率区间,各自都有其特征的谱形和喇曼峰。5’-dGMP和5’-dCMP谱中大多数特征峰在寡聚体的谱中消失,而在oligo-d(G-C)_3谱中出现了几处新的喇曼峰。经查证,峰832,851和899cm^(-1)系糖-磷酸主链的特征喇曼峰,另外几处峰与DNA的构象有关。实验结果表明oligo-d(G-C)_3在水溶液中(室温)主要以B-构象存在。