cfr基因介导的耐利奈唑胺头状葡萄球菌及其同源性研究

目的 调查利奈唑胺耐药头状葡萄球菌临床株携带的cfr基因及其同源性。方法 收集2018年6月-2019年10月分离自ICU患者血液标本的9株利奈唑胺耐药头状葡萄球菌。菌株的鉴定和药敏使用VITEK 2Compact仪器;cfr和optrA基因通过PCR扩增和测序确认;基于高通量测序平台获得头状葡萄球菌QD40株的染色质和携带的质粒序列,并用软件分析菌株的生物学信息;脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测菌株之间的同源性。结果 9株头状葡萄球菌呈现多重耐药表型,且都携带cfr基因,但未检测到optrA基因。高通量测序显示头状葡萄球菌QD40株携带三个质粒(分别命名为pQD40-1,pQD40-2和pQD40-3)。其中,质粒pQD40-3大小为39 504bp,携带cfr基因。PFGE显示这9株菌的电泳条带图谱完全一致。结论 头状葡萄球菌临床株对利奈唑胺耐药的分子机制是与其携带cfr基因有关。另外,ICU病房中存在cfr基因介导的耐利奈唑胺头状葡萄球菌感染的暴发流行,应引起临床重视。

厦门希瓦氏菌临床株对碳青霉烯类耐药的分子机制

目的 探讨希瓦氏菌临床株HDC555对碳青霉烯类耐药的分子机制。方法 希瓦氏菌临床株的鉴定和药敏使用VITEK 2Compact自动仪;碳青霉烯酶的筛选通过免疫金标法;S1核酸酶切脉冲场凝胶电泳(S1-PFGE)检测菌株携带的质粒。基于二代Illumina和三代Nanopore技术获取菌株的全基因组序列,并用一系列软件分析菌株的生物学信息。结果 免疫金标法显示希瓦氏菌HDC555产OXA-48样和NDM酶。高通量测序数据经分析(ANI)表明希瓦氏菌HDC555株是厦门希瓦氏菌,且该株菌携带位于染色体上的blaOXA-199基因和位于质粒上的blaNDM-1基因。结论 厦门希瓦氏菌临床株HDC555对碳青酶烯类耐药的分子机制是因为该菌携带了blaOXA-199和blaNDM-1碳青霉烯酶基因。