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2019—2021年华东地区6株禽源H3亚型流感病毒的遗传进化分析
1
作者
赵婉宸
李扬
+5 位作者
才天宇
葛志闯
高如一
王晓泉
顾敏
刘秀梵
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2024年第2期208-217,共10页
H3亚型流感病毒在自然界广泛存在,可感染人、猪、马、犬、禽等众多宿主并能发生跨种间传播,危害不容忽视。本研究于2019—2021年在华东地区活禽市场采集表观健康的家禽喉头与泄殖腔棉拭,通过血清学试验鉴定、筛选出6株代表性水禽源H3亚...
H3亚型流感病毒在自然界广泛存在,可感染人、猪、马、犬、禽等众多宿主并能发生跨种间传播,危害不容忽视。本研究于2019—2021年在华东地区活禽市场采集表观健康的家禽喉头与泄殖腔棉拭,通过血清学试验鉴定、筛选出6株代表性水禽源H3亚型流感病毒,并经RT-PCR试验确定5株为H3N2亚型、1株为H3N1亚型。进一步对6株分离株进行全基因组测序、同源性比对和遗传进化分析,结果显示:HA蛋白裂解位点处均为PEKQTR/GLF,不存在连续碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒的分子特征;受体结合位点处均为禽源特征性的226Q和228S,提示其跨种传播至哺乳动物的潜能较低;内部基因片段来源多样化,与H3N8、H4N6、H5N8、H6N1、H7N7、H0N3等众多亚型禽流感病毒的亲缘关系密切;除JS1018/19和JS1094/19的NS基因属于北美谱系以外,其余均属于欧亚谱系的禽源分支,与犬、马、猪、人等哺乳动物源毒株的亲缘关系较远,提示虽然可能存在不同进化谱系间的基因重组但并未发生从禽到哺乳动物宿主的基因交换。该研究结果丰富了H3亚型禽流感病毒的流行病学数据,为进一步了解我国低致病性禽流感病毒的分布特征提供了参考依据。
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关键词
禽流感病毒
H3N1
H3N2
基因组分析
遗传进化
下载PDF
职称材料
1株鸭源H1亚型禽流感病毒的分离鉴定与全基因遗传进化分析
被引量:
1
2
作者
张鑫煜
才天宇
+6 位作者
赵颖
葛志闯
徐凡
顾欣怡
徐欣然
王晓泉
顾敏
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期2325-2332,共8页
对2018年分离自江苏地区某活禽市场家鸭体内的1株H1亚型禽流感病毒进行了全基因组序列测定和遗传进化分析。BLAST检索结果显示,该分离株的HA、NA基因分别与A/pintail/Taiwan/WB2478/2017(H1N3)和A/chicken/Yuhuan/YH14/2016(H1N2)具有...
对2018年分离自江苏地区某活禽市场家鸭体内的1株H1亚型禽流感病毒进行了全基因组序列测定和遗传进化分析。BLAST检索结果显示,该分离株的HA、NA基因分别与A/pintail/Taiwan/WB2478/2017(H1N3)和A/chicken/Yuhuan/YH14/2016(H1N2)具有最高的核苷酸一致性,表明其为H1N2亚型,命名为A/duck/Huaian/0151/2018(H1N2)。进一步结合各基因的系统发生分析,发现该0151株的6个内部基因均与水禽群中的多种亚型低致病性禽流感病毒亲缘关系密切,其中PB2和NS基因分别与国内2013年的鸭源H7N3和H7N7病毒高度同源。关键氨基酸位点分析显示,该病毒HA蛋白裂解位点处的基序为具有低致病性特征的PSIQSR↓GLF,受体结合位点226Q与228G提示其亲嗜禽类受体;NA蛋白未出现可能导致病毒在陆禽中适应性增强的茎部氨基酸缺失;PB2蛋白也未发生E627K、D701N等与对小鼠毒力增强有关的突变。综上所述,0151分离株基因组来源复杂,可能由不同亚型低致病性禽流感病毒发生重组而形成,但尚未出现利于其宿主范围扩大的重要分子标记。该研究结果将为H1亚型禽流感病毒的流行病学监测提供参考。
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关键词
禽流感病毒
H1N2
基因组
遗传进化
H7亚型
原文传递
题名
2019—2021年华东地区6株禽源H3亚型流感病毒的遗传进化分析
1
作者
赵婉宸
李扬
才天宇
葛志闯
高如一
王晓泉
顾敏
刘秀梵
机构
扬州大学兽医学院农业农村部禽用生物制剂创制重点实验室
江苏省人兽共患病学重点实验室
江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2024年第2期208-217,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32072892)
江苏省博士后科研资助计划(1501075C)
+2 种基金
现代农业产业技术体系专项(CARS-40)江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
江苏高校“青蓝工程”
扬州大学“高端人才支持计划”。
文摘
H3亚型流感病毒在自然界广泛存在,可感染人、猪、马、犬、禽等众多宿主并能发生跨种间传播,危害不容忽视。本研究于2019—2021年在华东地区活禽市场采集表观健康的家禽喉头与泄殖腔棉拭,通过血清学试验鉴定、筛选出6株代表性水禽源H3亚型流感病毒,并经RT-PCR试验确定5株为H3N2亚型、1株为H3N1亚型。进一步对6株分离株进行全基因组测序、同源性比对和遗传进化分析,结果显示:HA蛋白裂解位点处均为PEKQTR/GLF,不存在连续碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒的分子特征;受体结合位点处均为禽源特征性的226Q和228S,提示其跨种传播至哺乳动物的潜能较低;内部基因片段来源多样化,与H3N8、H4N6、H5N8、H6N1、H7N7、H0N3等众多亚型禽流感病毒的亲缘关系密切;除JS1018/19和JS1094/19的NS基因属于北美谱系以外,其余均属于欧亚谱系的禽源分支,与犬、马、猪、人等哺乳动物源毒株的亲缘关系较远,提示虽然可能存在不同进化谱系间的基因重组但并未发生从禽到哺乳动物宿主的基因交换。该研究结果丰富了H3亚型禽流感病毒的流行病学数据,为进一步了解我国低致病性禽流感病毒的分布特征提供了参考依据。
关键词
禽流感病毒
H3N1
H3N2
基因组分析
遗传进化
Keywords
Avian influenza virus
H3N1
H3N2
genomic analysis
genetic evolution
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
1株鸭源H1亚型禽流感病毒的分离鉴定与全基因遗传进化分析
被引量:
1
2
作者
张鑫煜
才天宇
赵颖
葛志闯
徐凡
顾欣怡
徐欣然
王晓泉
顾敏
机构
扬州大学兽医学院/农业部畜禽传染病学重点开放实验室
江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心
江苏省人兽共患病学重点实验室
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期2325-2332,共8页
基金
江苏省博士后基金资助项目(1501075C)
江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
+2 种基金
江苏高校“青蓝工程”资助项目
扬州大学“高端人才支持计划”资助项目
扬州大学大学生科技创新基金资助项目(X20190675)。
文摘
对2018年分离自江苏地区某活禽市场家鸭体内的1株H1亚型禽流感病毒进行了全基因组序列测定和遗传进化分析。BLAST检索结果显示,该分离株的HA、NA基因分别与A/pintail/Taiwan/WB2478/2017(H1N3)和A/chicken/Yuhuan/YH14/2016(H1N2)具有最高的核苷酸一致性,表明其为H1N2亚型,命名为A/duck/Huaian/0151/2018(H1N2)。进一步结合各基因的系统发生分析,发现该0151株的6个内部基因均与水禽群中的多种亚型低致病性禽流感病毒亲缘关系密切,其中PB2和NS基因分别与国内2013年的鸭源H7N3和H7N7病毒高度同源。关键氨基酸位点分析显示,该病毒HA蛋白裂解位点处的基序为具有低致病性特征的PSIQSR↓GLF,受体结合位点226Q与228G提示其亲嗜禽类受体;NA蛋白未出现可能导致病毒在陆禽中适应性增强的茎部氨基酸缺失;PB2蛋白也未发生E627K、D701N等与对小鼠毒力增强有关的突变。综上所述,0151分离株基因组来源复杂,可能由不同亚型低致病性禽流感病毒发生重组而形成,但尚未出现利于其宿主范围扩大的重要分子标记。该研究结果将为H1亚型禽流感病毒的流行病学监测提供参考。
关键词
禽流感病毒
H1N2
基因组
遗传进化
H7亚型
Keywords
avian influenza virus
H1N2
genome
genetic evolution
H7 subtype
分类号
R373.13 [医药卫生—病原生物学]
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2019—2021年华东地区6株禽源H3亚型流感病毒的遗传进化分析
赵婉宸
李扬
才天宇
葛志闯
高如一
王晓泉
顾敏
刘秀梵
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
1株鸭源H1亚型禽流感病毒的分离鉴定与全基因遗传进化分析
张鑫煜
才天宇
赵颖
葛志闯
徐凡
顾欣怡
徐欣然
王晓泉
顾敏
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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已选择
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引证文献
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