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渝西地区奶牛隐孢子虫的分离和基因型鉴定
被引量:
3
1
作者
林洁
周荣琼
+3 位作者
谭燕财
马光旭
敖冯虎
胡志刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期495-500,共6页
为鉴定渝西地区奶牛隐孢子虫分离株的种类和基因型,本研究利用巢氏PCR(Nested PCR)扩增18S rRNA基因,PCR产物进行限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP);将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体...
为鉴定渝西地区奶牛隐孢子虫分离株的种类和基因型,本研究利用巢氏PCR(Nested PCR)扩增18S rRNA基因,PCR产物进行限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP);将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体,对阳性克隆进行测序,序列用BLAST和MEGA 4.0进行同源性和种系发育分析。结果表明阳性样品均成功扩增出约830bp的目的基因片段,PCR产物分别经SspⅠ和MboⅡ酶切后进行RFLP分析,显示渝西地区存在3种隐孢子虫,即C.andersoni、C.bovis、C.ryanae。其中C.andersoni为优势虫种。鉴定结果为进一步开展奶牛隐孢子虫的病原生物学研究及该地区隐孢子虫病的监测奠定了基础。
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关键词
隐孢子虫
18S
RRNA
PCR-RFLP
种系发育分析
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职称材料
寄生虫丝/苏氨酸蛋白磷酸酶研究进展
被引量:
2
2
作者
谭燕财
林洁
+3 位作者
马光旭
敖冯虎
胡志刚
周荣琼
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期81-84,共4页
丝/苏氨酸蛋白磷酸酶(Proteinserine/threonine phosphatases,PSTP)属于蛋白磷酸酶家族中重要的细胞内调节蛋白,能够催化磷酸化丝氨酸或磷酸化苏氨酸的去磷酸化反应,并参与许多关键的生物学过程,例如细胞周期进程、细胞凋亡和...
丝/苏氨酸蛋白磷酸酶(Proteinserine/threonine phosphatases,PSTP)属于蛋白磷酸酶家族中重要的细胞内调节蛋白,能够催化磷酸化丝氨酸或磷酸化苏氨酸的去磷酸化反应,并参与许多关键的生物学过程,例如细胞周期进程、细胞凋亡和胞外分泌等。蛋白质的磷酸化和去磷酸化是调节多种细胞功能的基本过程。蛋白激酶从ATP将磷酸基团转移到蛋白质上(磷酸化),而蛋白磷酸酶催化磷酸基团从蛋白质的特定残基移除(去磷酸化)。
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关键词
丝
苏氨酸蛋白磷酸酶
寄生虫
磷酸化反应
去磷酸化
生物学过程
蛋白质
调节蛋白
周期进程
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职称材料
荣昌猪miR-182基因序列多态性分析
被引量:
1
3
作者
龙熙
敖冯虎
+2 位作者
邱进杰
王涛
邱小田
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2015年第21期15-19,共5页
实验旨在研究免疫相关基因miR-182的序列多态性,以期为荣昌猪抗病育种提供新的遗传变异素材。利用PCR、测序、序列多重比对、计算机模拟miRNA折叠、qRT-PCR等方法,分析了275头荣昌猪新生小猪的miR-182基因序列,计算了miR-182基因在荣昌...
实验旨在研究免疫相关基因miR-182的序列多态性,以期为荣昌猪抗病育种提供新的遗传变异素材。利用PCR、测序、序列多重比对、计算机模拟miRNA折叠、qRT-PCR等方法,分析了275头荣昌猪新生小猪的miR-182基因序列,计算了miR-182基因在荣昌猪群体中各基因频率和基因型频率,检验了miR-182基因在荣昌猪群体中的遗传平衡状态,并检测了miR-182基因序列突变对其成熟体和靶基因表达量的影响。结果表明:miR-182前体第95位发生了一个G/A突变,该位点在哺乳动物中是高度保守;荣昌猪群体中G、A基因频率分别为0.5945、0.4055,GG、AA、GA,基因型频率分别为0.3535、0.1644、0.4821,且该突变在群体内已处于平衡状态;该突变能影响miR-182的空间结构,导致前体自由能升高9.86%,显著影响其成熟体在皮下脂肪组织中的表达量。
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关键词
荣昌猪
miR-182
基因多态性
前体突变
表达量
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职称材料
重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析
被引量:
1
4
作者
黄丽
周荣琼
+3 位作者
林洁
谭燕财
马光旭
敖冯虎
《西南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期95-100,共6页
利用聚合酶链式反应(PCR)扩增犬钩虫rDNA的ITS及5.8S序列,然后将PCR扩增产物回收纯化后连接到pMDTM19-T载体上进行克隆.重组质粒通过菌落PCR鉴定,将阳性重组质粒进行序列测定并且进行序列分析.结果显示,5株犬钩虫荣昌分离株ITS序列的总...
利用聚合酶链式反应(PCR)扩增犬钩虫rDNA的ITS及5.8S序列,然后将PCR扩增产物回收纯化后连接到pMDTM19-T载体上进行克隆.重组质粒通过菌落PCR鉴定,将阳性重组质粒进行序列测定并且进行序列分析.结果显示,5株犬钩虫荣昌分离株ITS序列的总长为833 bp^834 bp.ITS-1序列总长无差异,但存在个别碱基的差异;5.8S序列总长与序列均无差异;ITS-2序列总长存在差异(221 bp^222 bp).通过与GeneBank上报道的其他钩虫的ITS序列进行相似性分析,发现犬钩虫荣昌分离株(RCF)与犬钩虫广州分离株相似性最高,为99.9%,与美国北海狮弯口属钩口线虫ITS序列的相似性最低,为86.1%.表明ITS可作为分子标记用于犬钩虫种属以及种间的鉴定.该研究结果旨在为今后犬钩虫的分类鉴定、种群遗传关系、分子流行病学调查以及对该病的防治等方面的更深入研究奠定基础.
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关键词
犬钩虫
内转录间隔区(ITS)
PCR
序列分析
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职称材料
题名
渝西地区奶牛隐孢子虫的分离和基因型鉴定
被引量:
3
1
作者
林洁
周荣琼
谭燕财
马光旭
敖冯虎
胡志刚
机构
西南大学荣昌校区动物医学系
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期495-500,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31172313)
重庆市自然科学基金项目(CSTC
+1 种基金
2009BB113)
西南大学博士基金(11BSr04)
文摘
为鉴定渝西地区奶牛隐孢子虫分离株的种类和基因型,本研究利用巢氏PCR(Nested PCR)扩增18S rRNA基因,PCR产物进行限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP);将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体,对阳性克隆进行测序,序列用BLAST和MEGA 4.0进行同源性和种系发育分析。结果表明阳性样品均成功扩增出约830bp的目的基因片段,PCR产物分别经SspⅠ和MboⅡ酶切后进行RFLP分析,显示渝西地区存在3种隐孢子虫,即C.andersoni、C.bovis、C.ryanae。其中C.andersoni为优势虫种。鉴定结果为进一步开展奶牛隐孢子虫的病原生物学研究及该地区隐孢子虫病的监测奠定了基础。
关键词
隐孢子虫
18S
RRNA
PCR-RFLP
种系发育分析
Keywords
Cryptosporidium
18S rRNA
PCR-RFLP
phylogenetic analysis
分类号
S852.723 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
寄生虫丝/苏氨酸蛋白磷酸酶研究进展
被引量:
2
2
作者
谭燕财
林洁
马光旭
敖冯虎
胡志刚
周荣琼
机构
西南大学荣昌校区动物医学系
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期81-84,共4页
基金
国家自然科学基金(31172313)
重庆市自然科学基金(CSTC
+1 种基金
2009BB113)
西南大学博士基金(11BSr04)
文摘
丝/苏氨酸蛋白磷酸酶(Proteinserine/threonine phosphatases,PSTP)属于蛋白磷酸酶家族中重要的细胞内调节蛋白,能够催化磷酸化丝氨酸或磷酸化苏氨酸的去磷酸化反应,并参与许多关键的生物学过程,例如细胞周期进程、细胞凋亡和胞外分泌等。蛋白质的磷酸化和去磷酸化是调节多种细胞功能的基本过程。蛋白激酶从ATP将磷酸基团转移到蛋白质上(磷酸化),而蛋白磷酸酶催化磷酸基团从蛋白质的特定残基移除(去磷酸化)。
关键词
丝
苏氨酸蛋白磷酸酶
寄生虫
磷酸化反应
去磷酸化
生物学过程
蛋白质
调节蛋白
周期进程
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
荣昌猪miR-182基因序列多态性分析
被引量:
1
3
作者
龙熙
敖冯虎
邱进杰
王涛
邱小田
机构
重庆市畜牧科学院
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2015年第21期15-19,共5页
基金
国家自然科学基金(31101701)
重庆市基本科研业务费(2013cstc-jbky-00905
2012cstc-jbky-00901)
文摘
实验旨在研究免疫相关基因miR-182的序列多态性,以期为荣昌猪抗病育种提供新的遗传变异素材。利用PCR、测序、序列多重比对、计算机模拟miRNA折叠、qRT-PCR等方法,分析了275头荣昌猪新生小猪的miR-182基因序列,计算了miR-182基因在荣昌猪群体中各基因频率和基因型频率,检验了miR-182基因在荣昌猪群体中的遗传平衡状态,并检测了miR-182基因序列突变对其成熟体和靶基因表达量的影响。结果表明:miR-182前体第95位发生了一个G/A突变,该位点在哺乳动物中是高度保守;荣昌猪群体中G、A基因频率分别为0.5945、0.4055,GG、AA、GA,基因型频率分别为0.3535、0.1644、0.4821,且该突变在群体内已处于平衡状态;该突变能影响miR-182的空间结构,导致前体自由能升高9.86%,显著影响其成熟体在皮下脂肪组织中的表达量。
关键词
荣昌猪
miR-182
基因多态性
前体突变
表达量
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析
被引量:
1
4
作者
黄丽
周荣琼
林洁
谭燕财
马光旭
敖冯虎
机构
西南大学(荣昌校区)动物医学系
出处
《西南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期95-100,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31172313)
西南大学博士基金资助项目(11BSr04)
文摘
利用聚合酶链式反应(PCR)扩增犬钩虫rDNA的ITS及5.8S序列,然后将PCR扩增产物回收纯化后连接到pMDTM19-T载体上进行克隆.重组质粒通过菌落PCR鉴定,将阳性重组质粒进行序列测定并且进行序列分析.结果显示,5株犬钩虫荣昌分离株ITS序列的总长为833 bp^834 bp.ITS-1序列总长无差异,但存在个别碱基的差异;5.8S序列总长与序列均无差异;ITS-2序列总长存在差异(221 bp^222 bp).通过与GeneBank上报道的其他钩虫的ITS序列进行相似性分析,发现犬钩虫荣昌分离株(RCF)与犬钩虫广州分离株相似性最高,为99.9%,与美国北海狮弯口属钩口线虫ITS序列的相似性最低,为86.1%.表明ITS可作为分子标记用于犬钩虫种属以及种间的鉴定.该研究结果旨在为今后犬钩虫的分类鉴定、种群遗传关系、分子流行病学调查以及对该病的防治等方面的更深入研究奠定基础.
关键词
犬钩虫
内转录间隔区(ITS)
PCR
序列分析
Keywords
Ancylostoma caninum
internal transcribed spacer(ITS)
PCR
sequence analysis
分类号
Q968.9 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
渝西地区奶牛隐孢子虫的分离和基因型鉴定
林洁
周荣琼
谭燕财
马光旭
敖冯虎
胡志刚
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
下载PDF
职称材料
2
寄生虫丝/苏氨酸蛋白磷酸酶研究进展
谭燕财
林洁
马光旭
敖冯虎
胡志刚
周荣琼
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
下载PDF
职称材料
3
荣昌猪miR-182基因序列多态性分析
龙熙
敖冯虎
邱进杰
王涛
邱小田
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2015
1
下载PDF
职称材料
4
重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析
黄丽
周荣琼
林洁
谭燕财
马光旭
敖冯虎
《西南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
下载PDF
职称材料
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