目的:类风湿关节炎是一种常见的自身免疫性疾病,微RNA(microRNA,miRNA)可能参与其发病过程。本研究旨在检测胶原诱导型关节炎(collagen-induced arthritis,CIA)大鼠中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析。方法...目的:类风湿关节炎是一种常见的自身免疫性疾病,微RNA(microRNA,miRNA)可能参与其发病过程。本研究旨在检测胶原诱导型关节炎(collagen-induced arthritis,CIA)大鼠中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析。方法:提取实验动物滑膜内总RNA,通过miRNA芯片获得miRNA基因谱,筛选差异表达miRNA并预测其相关靶基因;对差异表达显著的miRNA靶基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果:CIA大鼠模型中有包括rno-miR-6215、rno-miR-709等在内的69个呈显著差异表达的miRNA,其中22个(31.9%)上调和47个(68.1%)下调;GO及KEGG富集分析结果发现上调miRNA的靶基因主要富集于细胞代谢过程,它们可能参与了MAPK和Wnt等信号通路;下调miRNA的靶基因主要富集于神经系统发育,它们可能参与了轴突引导的信号通路。结论:CIA大鼠模型内miRNA呈显著的差异表达,其靶基因可能参与细胞代谢的生物功能及MAPK和Wnt等信号通路。展开更多
文摘目的:类风湿关节炎是一种常见的自身免疫性疾病,微RNA(microRNA,miRNA)可能参与其发病过程。本研究旨在检测胶原诱导型关节炎(collagen-induced arthritis,CIA)大鼠中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析。方法:提取实验动物滑膜内总RNA,通过miRNA芯片获得miRNA基因谱,筛选差异表达miRNA并预测其相关靶基因;对差异表达显著的miRNA靶基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果:CIA大鼠模型中有包括rno-miR-6215、rno-miR-709等在内的69个呈显著差异表达的miRNA,其中22个(31.9%)上调和47个(68.1%)下调;GO及KEGG富集分析结果发现上调miRNA的靶基因主要富集于细胞代谢过程,它们可能参与了MAPK和Wnt等信号通路;下调miRNA的靶基因主要富集于神经系统发育,它们可能参与了轴突引导的信号通路。结论:CIA大鼠模型内miRNA呈显著的差异表达,其靶基因可能参与细胞代谢的生物功能及MAPK和Wnt等信号通路。
