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基于碱基分子质量和π电子共振能的几种新距离在系统发育重建中的应用
被引量:
3
1
作者
袁哲明
欧阳芳
+2 位作者
吉洪湖
张平
文迪彪
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2005年第1期77-83,共7页
为探讨基于碱基分子质量和π电子共振能的几种新距离在系统发育重建中的应用,以Kimura2-parameter距离为对照,以鸻行目16种鸟类线粒体ND6基因和Cytb基因序列为例分别进行距离矩阵邻接法建树,并结合形态学分类和核型研究结果进行比较分析...
为探讨基于碱基分子质量和π电子共振能的几种新距离在系统发育重建中的应用,以Kimura2-parameter距离为对照,以鸻行目16种鸟类线粒体ND6基因和Cytb基因序列为例分别进行距离矩阵邻接法建树,并结合形态学分类和核型研究结果进行比较分析.结果表明:1)E距离和I距离基因树最大程度地吻合了形态学分类结果,将灰斑鸻和鸻属的两个种聚为同一单系,将滨鹬属两个种聚为同一单系;其反对将反嘴鹬和砺鹬单独成科的观点得到核型研究结果的强烈支持;E距离和I距离的ND6树和Cytb树相互支撑性较好;E距离和I距离是系统发育重建中2种颇具潜力的新距离;2)基于E距离和I距离的ND6树和Cytb树,结合形态学分类和核型研究结果,给出了鸻行目16种鸟类的分类归属.
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关键词
碱基分子质量
π电子共振能
E距离
I距离
系统进化
鸻行目
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职称材料
线粒体和核基因密码子的若干统计特征及其关联
被引量:
1
2
作者
袁哲明
王智
+3 位作者
张永生
吉洪湖
欧阳芳
文迪彪
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2005年第2期110-117,128,共9页
基于归1000密码子使用频次,从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明:线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大;不同进...
基于归1000密码子使用频次,从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明:线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大;不同进化阶层生物线粒体基因和核基因归1000密码子的相对π电子共振能呈极显著负相关且两者之和接近定值;真菌-真菌线粒体、植物-植物线粒体、无脊椎动物-无脊椎动物线粒体的密码子使用频次匹配较好;线粒体基因AU含量、密码子第三位碱基AU3s含量高于相应核基因;给出了密码子各位点碱基含量随进化以及在线粒体-核间的变化规律.由于线粒体环境不如核环境稳定,线粒体基因密码子的多个统计特征较核基因在不同进化阶层生物间变异较大,但二者在归1000密码子相对π电子共振能等若干特征方面仍存在明显关联.
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关键词
线粒体基因
核基因
密码子使用
关联
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职称材料
题名
基于碱基分子质量和π电子共振能的几种新距离在系统发育重建中的应用
被引量:
3
1
作者
袁哲明
欧阳芳
吉洪湖
张平
文迪彪
机构
湖南农业大学生物安全科技学院
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2005年第1期77-83,共7页
基金
国家自然科学青年基金资助项目(30100122)
文摘
为探讨基于碱基分子质量和π电子共振能的几种新距离在系统发育重建中的应用,以Kimura2-parameter距离为对照,以鸻行目16种鸟类线粒体ND6基因和Cytb基因序列为例分别进行距离矩阵邻接法建树,并结合形态学分类和核型研究结果进行比较分析.结果表明:1)E距离和I距离基因树最大程度地吻合了形态学分类结果,将灰斑鸻和鸻属的两个种聚为同一单系,将滨鹬属两个种聚为同一单系;其反对将反嘴鹬和砺鹬单独成科的观点得到核型研究结果的强烈支持;E距离和I距离的ND6树和Cytb树相互支撑性较好;E距离和I距离是系统发育重建中2种颇具潜力的新距离;2)基于E距离和I距离的ND6树和Cytb树,结合形态学分类和核型研究结果,给出了鸻行目16种鸟类的分类归属.
关键词
碱基分子质量
π电子共振能
E距离
I距离
系统进化
鸻行目
Keywords
base molecular weight
πenergy
E distance
I distance
phylogeny
charadriiformes
分类号
Q959.7 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
线粒体和核基因密码子的若干统计特征及其关联
被引量:
1
2
作者
袁哲明
王智
张永生
吉洪湖
欧阳芳
文迪彪
机构
湖南农业大学生物安全科技学院
湖南文理学院生命科学系
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2005年第2期110-117,128,共9页
基金
国家自然科学青年基金资助项目(30100122)
文摘
基于归1000密码子使用频次,从垂直和水平两个方向比较研究了不同进化阶层生物线粒体基因和核基因密码子使用的若干统计特征及其关联.结果表明:线粒体基因密码子多样性、相对分子质量和相对π电子共振能低于相应核基因且变异较大;不同进化阶层生物线粒体基因和核基因归1000密码子的相对π电子共振能呈极显著负相关且两者之和接近定值;真菌-真菌线粒体、植物-植物线粒体、无脊椎动物-无脊椎动物线粒体的密码子使用频次匹配较好;线粒体基因AU含量、密码子第三位碱基AU3s含量高于相应核基因;给出了密码子各位点碱基含量随进化以及在线粒体-核间的变化规律.由于线粒体环境不如核环境稳定,线粒体基因密码子的多个统计特征较核基因在不同进化阶层生物间变异较大,但二者在归1000密码子相对π电子共振能等若干特征方面仍存在明显关联.
关键词
线粒体基因
核基因
密码子使用
关联
Keywords
mitochondria genes
nucleus genes
codon usage
relevancy
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于碱基分子质量和π电子共振能的几种新距离在系统发育重建中的应用
袁哲明
欧阳芳
吉洪湖
张平
文迪彪
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2005
3
下载PDF
职称材料
2
线粒体和核基因密码子的若干统计特征及其关联
袁哲明
王智
张永生
吉洪湖
欧阳芳
文迪彪
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2005
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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