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MALDI-TOF MS与16S rDNA方法对乳酸菌鉴定分析比较
被引量:
4
1
作者
宋丹靓敏
陈晴
+5 位作者
周梦瑶
张佳欣
程莎莎
方如雪
姜毓君
满朝新
《中国乳品工业》
CAS
北大核心
2021年第10期4-7,53,共5页
本研究通过将基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法与16S rDNA序列分析法,对于乳酸菌鉴定的准确性以及微生物系统分类学相关分析结果进行比较,采用MALDI-TOF MS对本实验所保藏的3株乳酸菌标准菌株,及由乳制品中分离得到...
本研究通过将基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法与16S rDNA序列分析法,对于乳酸菌鉴定的准确性以及微生物系统分类学相关分析结果进行比较,采用MALDI-TOF MS对本实验所保藏的3株乳酸菌标准菌株,及由乳制品中分离得到的12株乳酸菌进行蛋白质谱图收集,比对谱图特征峰对其进行鉴定及系统进行学分析;同时,进行16S rDNA提取并测序,得到分子生物化学水平鉴定,采用邻近连接法对16S rDNA序列进行系统进化树分析。结果表明,经MALDI-TOF MS与16S rDNA测序对试验所用的15株乳酸菌鉴定,乳杆菌属的2株微生物种水平鉴定结果存在偏差,其他13株鉴定结果一致;两种方法所得到的数据均可得出聚类热图及系统发育树,虽可确定为同一科水平,但不同属种水平微生物亲缘距离与位置有一定差异。MALDI-TOF MS法鉴定乳酸菌有着快速、准确的优势,但仍需要通过优化算法并扩大数据库以准确建立系统发育相关性。
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关键词
基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱
16S
rDNA
乳酸菌
系统进化
下载PDF
职称材料
题名
MALDI-TOF MS与16S rDNA方法对乳酸菌鉴定分析比较
被引量:
4
1
作者
宋丹靓敏
陈晴
周梦瑶
张佳欣
程莎莎
方如雪
姜毓君
满朝新
机构
东北农业大学食品学院乳品科学教育部重点实验室
出处
《中国乳品工业》
CAS
北大核心
2021年第10期4-7,53,共5页
文摘
本研究通过将基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法与16S rDNA序列分析法,对于乳酸菌鉴定的准确性以及微生物系统分类学相关分析结果进行比较,采用MALDI-TOF MS对本实验所保藏的3株乳酸菌标准菌株,及由乳制品中分离得到的12株乳酸菌进行蛋白质谱图收集,比对谱图特征峰对其进行鉴定及系统进行学分析;同时,进行16S rDNA提取并测序,得到分子生物化学水平鉴定,采用邻近连接法对16S rDNA序列进行系统进化树分析。结果表明,经MALDI-TOF MS与16S rDNA测序对试验所用的15株乳酸菌鉴定,乳杆菌属的2株微生物种水平鉴定结果存在偏差,其他13株鉴定结果一致;两种方法所得到的数据均可得出聚类热图及系统发育树,虽可确定为同一科水平,但不同属种水平微生物亲缘距离与位置有一定差异。MALDI-TOF MS法鉴定乳酸菌有着快速、准确的优势,但仍需要通过优化算法并扩大数据库以准确建立系统发育相关性。
关键词
基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱
16S
rDNA
乳酸菌
系统进化
Keywords
matrix assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry
16S rDNA
Lactic acid bacteria
phylogenetic system
分类号
Q93-331 [生物学—微生物学]
Q939.117 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
MALDI-TOF MS与16S rDNA方法对乳酸菌鉴定分析比较
宋丹靓敏
陈晴
周梦瑶
张佳欣
程莎莎
方如雪
姜毓君
满朝新
《中国乳品工业》
CAS
北大核心
2021
4
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