岩陀DNA提取方法研究

以岩陀植物嫩叶为材料,用不同方法对岩陀叶片DNA进行提取,比较提取的质量差异,寻找适合岩陀叶片总DNA的提取方法,以满足多基原民族药岩陀DNA条形码识别系统构建的研究需要。采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、改良的CTAB法、十二烷基硫酸钠(SDS)法及碱裂解法提取岩陀叶片总DNA,利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法及PCR扩增效果检查DNA提取的质量。结果显示四种方法均能从岩陀植物叶片中提取到基因组DNA,改良CTAB法提取的DNA纯度和完整性明显好于其他方法,且采用此法进行PCR扩增获得的目标条带明亮单一,扩增效率达到100%。改良的CTAB法是岩陀叶片总DNA的提取中最为合适的提取方法,能够满足后续DNA条形码的研究需要。

一种基于WSD层级记忆网络建模的文档表示方法

针对传统自然语言处理中基于中文文档建模方法忽视了上下文语义关系和文档层级结构的问题,提出一种基于WSD层级记忆网络建模的文档表示方法,以充分利用词句级联的层次关系,增强文档建模内部的语义联系,实现文档分类。该方法首先通过Bert模型进行词到句的表示;然后利用双向长短时记忆网络结合注意力机制输出每个时刻句子信息的重要程度;最后通过全连接层获得连续的文档模型进行分类预测。对THUCNEWS、CHEM&ENGNEWS两个数据集进行仿真实验,结果表明本方法相比传统方法准确性提高7.06%~18.31%,有效地提高了文档分类的预测精度,为文档分类提供借鉴。

岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究

以岩陀植物叶片为材料,利用试剂盒提取方法提取植物叶片中的DNA,对ITS2序列进行PCR扩增条件优化并对ITS2序列鉴别物种能力进行考察;通过单因素实验分别研究退火温度、DNA模板量、循环次数等因素对岩陀DNA条形码鉴别中所选的ITS2序列扩增反应的影响,并对扩增体系进行优化,采用Seqman7.1软件对测序峰图进行校对拼接,应用MEGA计算种内种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树;结果表明:优化后的PCR扩增反应体系总体积为25μL,含TaqPCR Master Mix 12.5μL、DNA模板量5ng、上下游引物(10mol/L)各1μL、dd H2O 9.5μL,ITS2序列在退火温度设置为60℃,循环次数为30次的条件下进行PCR扩增,获得清晰单一的电泳条带,ITS2测序成功率100%,比对后的序列长度475bp,GC含量约50%,种内种间变异存在重叠,没有明显的Barcoding gap;结论:通过试剂盒提取岩陀植物叶片DNA,在优化后的PCR扩增反应体系对ITS2序列进行扩增,可以满足后续对鬼灯檠属多基原植物岩陀的亲缘关系、物种鉴别和遗传多样性等领域的研究,但ITS2序列不适合岩陀种DNA条形码鉴别。

专家多源信息融合算法研究

为了全面获取科研及技术领域专家的信息,更加科学规范地对专家影响力进行评估,同时为专家选择科研合作对象提供参考,提出了专家多源信息融合算法。该算法从科技论文和专利中抽取作者信息,构建专家合作关系子网;从专家Web页面抽取专家相关数据构建Web子网;从科技论文、专利中抽取关键词和摘要,构建关键词词典,并分析专家研究主题,构建主题子网。通过专家合作关系子网、Web子网和主题子网融合算法,实现了专家多源信息的有效融合。实验以机器学习领域为研究点构建机器学习领域专家信息网络进行实证研究。结果表明,专家信息网络融合算法在个人信息构建与领域信息构建方面均能够准确表示专家个人信息与领域专家信息,验证了融合算法的有效性。

基于ATT-CNN的化工装备分类算法

随着化工技术的飞速发展,化工装备在化工产业生产实践中发挥着更加重要的作用,与此同时也对化工装备的精准分类提出了更高要求。为了提高化工装备在化工生产中分类的准确率,提出了一种基于Attention注意力机制和卷积神经网络的化工装备文本分类算法。首先,分别使用卷积神经网络算法的输入层和Attention注意力机制提取化工装备文本特征;其次,将两种算法得到的特征与卷积核进行卷积操作,得到不同权重的输入,最后在分类器中对得到的化工装备文本特征进行分类,得到最终分类结果。通过多算法实验结果表明,该方法相比传统卷积神经网络与机器学习方法在数据挖掘中具有更高的分类准确性,达到了96.42%,证明ATT-CNN算法在化工装备分类中具有较好的性能。

中药DNA条形码分子鉴定技术的应用与展望

中药材品种广泛,存在多基原的情况,质量差异较大,使临床用药安全性和有效性难以得到保证。因传统中药鉴定方法的局限性,对准确鉴别多基原中药材带来了一定的挑战。为了保证中药临床用药安全有效可控,中药鉴定学已成为最重要的研究课题之一,也是当前中医药事业急需解决的关键技术要求。DNA基因鉴别是从基因层面对中药材进行快速、准确的鉴定,包括DNA分子标记法、核酸探针杂交法和DNA条形码技术,其中DNA条形码技术应用最为广泛。DNA条形码是利用标准的DNA片段对物种进行鉴定的技术,2015年版《中国药典》收载了DNA条形码技术指导原则,建立了动物类采用细胞色素C氧化酶亚基I（COI）序列为主,转录间隔区间（ITS）2为辅;植物类采用ITS2/ITS为主,叶绿体psb A-trn H为辅的中药材鉴定体系。该技术的广泛应用为中药鉴别提供更高效快速的方法,并且有效地应用于多基原中药材的鉴别中,使中药品种混乱现象得到极大改观。文章首先对DNA条形码技术的原理、目的及意义、标准片段的选择进行介绍,着重阐述该技术在中药鉴定中的应用以及存在的局限性,并提出展望,以期为中药材的鉴定研究提供参考。

多基原民族药岩陀DNA条形码鉴定

目的:采用ITS,ITS2,rbcL,matK和psbA-trnH这5种热门DNA条形码序列对多基原民族药岩陀的鉴别能力进行评价,筛选出适合该物种鉴定的DNA条形码。方法:通过比较各序列聚合酶链式反应(PCR)扩增成功率及测序成功率,计算种内种间遗传距离,运用Wilcoxon非参数秩和检验进行遗传差异分析,邻接(NJ)法构建系统发育树以及采用Blast 1和NJ建树方法评价不同序列对物种的鉴定成功率等策略的实施,综合评价上述5种DNA候选条形码在多基原岩陀植物中的鉴别效果。结果:ITS序列扩增成功率及测序成功率分别为100%和96.61%;ITS2序列扩增成功率及测序成功率分别为100%和98.31%;psbA-trnH序列扩增成功率及测序成功率均为100%;rbcL序列扩增成功率及测序成功率均为100%,matK扩增成功率及测序成功率均为98.31%。psbA-trnH序列拥有最高的种内及种间遗传变异,且种内最大变异的平均值小于种间最小变异的平均值。系统发育树构建结果显示,psbA-trnH序列能区分3种不同来源的岩陀药用植物,而ITS,ITS2,rbcL和matK序列聚类效果较差。psbA-trnH序列鉴定成功率均为100%,而ITS,ITS2,matK和rbcL序列对物种鉴定成功率均低于50%。结论:psbA-trnH较其他序列有明显优势,因此推荐psbA-trnH序列作为理想的DNA条形码,用于多基原民族药岩陀的鉴定研究。

PIK3C3与SMAD4在胰腺癌中的表达及作用

背景与目的:Ⅲ型磷脂酰肌醇3-激酶(PIK3C3)及SMAD家族成员4 (SMAD4)参与的信号通路与胰腺癌(PAAD)关系密切,但两者与PAAD发生及预后是否有关尚不十分清楚。本研究初步探究两者在PAAD中的表达及其对患者预后的影响。方法:利用UALCAN在线网站分析PIK3C3 mRNA和SMAD4 mRNA在PAAD中的表达及两者各自对PAAD患者预后的影响;从TCGA数据库下载PAAD患者PIK3C3 mRNA和SMAD4 mRNA的表达数据和相应临床病理资料,基于PIK3C3和SMAD4联合的mRNA表达水平,用一致性聚类分析将PAAD患者分为两个聚类,用Kolmogorov-Smirnov检验及Kaplan-Meier法分析两个聚类患者PIK3C3与SMAD4的mRNA表达模式、临床病理因素和总体生存率的差异;用免疫组化的方法检测PAAD和癌旁组织组织芯片中PIK3C3及SMAD4蛋白表达水平,并用独立样本t检验及ROC曲线下面积(AUC)评估两个蛋白在癌和癌旁组织中的差异;采用Kaplan-Meier的方法分析PIK3C3和SMAD4的蛋白水平单独及联合对PAAD患者生存的影响。结果:分析结果表明,PIK3C3 mRNA或SMAD4 mRNA水平在PAAD中均无明显变化,并且两者单独均不影响PAAD患者的预后(均P>0.05)。PAAD中与PIK3C3 mRNA与SMAD4 mRNA具有较高的共表达相关性。两个聚类的PAAD患者之间,两基因的mRNA水平及年龄有明显差异(均P<0.05),其中,PIK3C3 mRNA及SMAD4 mRNA均高表达聚类的PAAD患者预后较好(P=0.006)。PAAD组织中PIK3C3和SMAD4的蛋白表达水平均明显低于癌旁组织(均P<0.001),AUC分别为0.7417及0.7991。PIK3C3和SMAD4蛋白之一阳性患者比两蛋白均阴性的患者预后更好(P=0.0359)。结论:PIK3C3和SMAD4蛋白可作为PAAD潜在的诊断标志物,PIK3C3和SMAD4联合分析可成为PAAD患者预后评估的新指标。

装配式建筑工程钢结构施工技术和施工管理措施

社会不断发展促使城市化建设逐渐深入,建筑工程的数量及规模明显增加。在这种情况下,各项工艺技术都在发展和创新,以此提升建设水平。其中装配式建筑工程中,钢结构施工技术主要为主要技术之一,直接关系到整体建设水平。因此要对钢结构施工技术以及施工管理进行详细地分析,保证各项施工要求可以落实到位。基于此,对装配式建筑钢结构体系的优势进行分析,以现阶段存在的问题为基础,研究钢结构施工技术以及施工管理措施。

HPLC-MS/MS法测定人血浆中地拉罗司

目的:建立高效液相色谱-串联质谱(HPLC-MS/MS)法测定人血浆中地拉罗司的浓度,并在方法开发中对样品和HPLC-MS/MS系统中存在的Fe^(3+)对地拉罗司浓度测定的干扰进行了排除。方法:本方法在流动相和样品中加入适量的乙二胺四乙酸(EDTA),竞争性抑制地拉罗司与Fe^(3+)的络合,从而解决了地拉罗司检测过程中不稳定的难题。以米非司酮为内标,血浆样品经乙腈沉淀蛋白后进行HPLC-MS/MS分析。色谱条件:采用Hanbon Hedera ODS-2 (2.1 mm×150 mm, 5μm)色谱柱,流动相为甲醇-0.1%甲酸溶液(含0.04 mmol·L^(-1) EDTA)梯度洗脱,流速0.5 mL·min^(-1);质谱条件:电喷雾(ESI)正离子模式,多反应监测(MRM)方式检测,m/z 430.1→m/z 372.2(地拉罗司)、m/z 374.2→m/z 108.1(内标米非司酮)。结果:地拉罗司标准曲线线性范围为0.04～40μg·mL^(-1),线性关系良好;无内源性杂质干扰;地拉罗司3个浓度水平质控样品的批内和批间精密度RSD在2.9%～11.8%之间,准确度的偏差RE在-3.1%～4.0%之间;提取回收率较高;地拉罗司和内标在人血浆样品中无基质效应。结论:在流动相及样品中加入EDTA保证了地拉罗司在检测过程中的稳定性。该方法操作简单,具有良好的特异性、可重复性和可靠性,并且成功应用于10名中国健康受试者口服地拉罗司后的药动学研究。