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兔半乳糖凝聚素-3 cDNA分子多样性分析 被引量:2
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作者 方恩浩 张珊珊 +2 位作者 刘倩芸 周建钟 杨仙玉 《生命科学研究》 CAS CSCD 2015年第6期512-515,共4页
半乳糖凝聚素-3(galectin-3,Gal-3)是一种多功能蛋白,参与细胞增殖、分化、凋亡、血管发生及肿瘤发生与转移等多种生命活动过程。前期工作表明一些两栖类动物存在个体水平的gal-3 cDNA分子多样性。鉴于哺乳动物尚缺乏这方面的研究,选... 半乳糖凝聚素-3(galectin-3,Gal-3)是一种多功能蛋白,参与细胞增殖、分化、凋亡、血管发生及肿瘤发生与转移等多种生命活动过程。前期工作表明一些两栖类动物存在个体水平的gal-3 cDNA分子多样性。鉴于哺乳动物尚缺乏这方面的研究,选择新西兰兔(Oryctolagus cuniculus)为实验材料,制备3只不同个体的肝脏第一链cDNA,通过DNA聚合酶链式反应扩增gal-3开放阅读框(open reading frame,ORF)并进行克隆测序。结果表明,兔gal-3 ORF中存在5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,导致11个不同的ORF,其中1个与Gen Bank注册的序列完全相同,另外10个均为本研究首次发现。从1~3号个体的肝脏分别获得6、6、2条不同的兔gal-3 ORF,揭示兔肝脏存在个体水平的gal-3 cDNA分子多样性。 展开更多
关键词 半乳糖凝聚素-3 cDNA多样性 单核苷酸多态性(SNP)
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大鼠肝脏半乳糖凝聚素-3 cDNA分子多样性分析
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作者 方恩浩 张珊珊 +2 位作者 刘倩芸 周建钟 杨仙玉 《生物信息学》 2015年第2期88-95,共8页
半乳糖凝聚素-3(Galectin-3,Gal-3)是一种多功能蛋白,参与机体内的多种生命活动过程。为分析大鼠Rattus norvegicus gal-3 c DNA分子多样性,在分析Gen Bank注册的大鼠gal-3 c DNA序列的同时,从三只不同大鼠个体的肝脏第一链c DNA,共计9... 半乳糖凝聚素-3(Galectin-3,Gal-3)是一种多功能蛋白,参与机体内的多种生命活动过程。为分析大鼠Rattus norvegicus gal-3 c DNA分子多样性,在分析Gen Bank注册的大鼠gal-3 c DNA序列的同时,从三只不同大鼠个体的肝脏第一链c DNA,共计9个独立实验中克隆gal-3开放阅读框OFR(Open reading frame)。分析结果表明,在已注册的序列中存在1个单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)。本实验从1-3号大鼠肝脏分别获得118、95和120个克隆,新发现1处缺失和5处SNP,共克隆17个不同的gal-3 ORF,其中仅1个克隆与已报告大鼠gal-3 c DNA的ORF完全相同。从1号和3号个体肝脏中分别克隆11和14个不同的gal-3 ORF,揭示大鼠gal-3 c DNA存在个体水平的分子多样性。 展开更多
关键词 大鼠 半乳糖凝聚素-3 c DNA多样性 单核苷酸多态性
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中华大蟾蜍TAGLN2 cDNA的克隆与其组织分布 被引量:3
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作者 张珊珊 诸葛慧 +3 位作者 张姝芳 季煜程 方恩浩 杨仙玉 《生命科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期481-485,516,共6页
为研究蟾蜍旧ufo)基原的中药材中的多肽类有效成分,开展从日本蟾蜍(B.japonicus for-moslAs)皮肤cD—NA质粒文库中筛选蛋白编码基因的工作.由于后续拓展蟾蜍药用价值的研究中需要大量的实验材料,开始以中华大蟾蜍(B.gargariza... 为研究蟾蜍旧ufo)基原的中药材中的多肽类有效成分,开展从日本蟾蜍(B.japonicus for-moslAs)皮肤cD—NA质粒文库中筛选蛋白编码基因的工作.由于后续拓展蟾蜍药用价值的研究中需要大量的实验材料,开始以中华大蟾蜍(B.gargarizarts)皮肤第一链cDNA为模板,克隆其相关基因的工作.通过DNA聚合酶链式反应获得编码转胶蛋白-2(transgelin2,TAGLN2)的转录子(GenBank登录号为KF432856).该cDNA全长1207bp,其5’、3’端非翻译区域和开放阅读框分别为16bp、597bp和594bp,编码由197个氨基酸残基组成的蛋白质,与日本蟾蜍的TAGLN2(GenBank登录号为AGQ03775.1)相比,仅一个氨基酸发生替换,与人的同源性为82%,与其他动物的同源性介于70%~75%.RT—PCR组织分布检测表明TAGLN2在所检测的中华大蟾蜍各器官中均有表达.在肺、肝和肾中表达量较多.这些研究结果为后续中华大蟾蜍TAGLN2的生物学功能研究以及相关药物研发提供基础数据. 展开更多
关键词 中华大蟾蜍 转胶蛋白 2 基因克隆 RT—PCR
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基于L-系统的分形植物模拟研究 被引量:2
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作者 李娜 方恩浩 +2 位作者 滕飞 俞敏健 胡海龙 《计算机技术与发展》 2014年第8期199-201,205,共4页
鉴于动态植物模拟生动逼真的要求,致力于为植物动态模拟领域提供更加广阔的图形选择空间,文中以分形理论为基础,首先介绍了L-系统文法的基本原理,详细阐述了L-系统文法对植物的生成规则,并在VC++6.0环境下用字符串替换算法对植物进行模... 鉴于动态植物模拟生动逼真的要求,致力于为植物动态模拟领域提供更加广阔的图形选择空间,文中以分形理论为基础,首先介绍了L-系统文法的基本原理,详细阐述了L-系统文法对植物的生成规则,并在VC++6.0环境下用字符串替换算法对植物进行模拟,给出了具体的分形图形模拟步骤,进而对生成流程做出分析。通过连续改变字符串内部参数,模拟植物在风中摇曳的姿态,从而产生逼真的动态效果,避免出现建模方法下生成的植物呆板、不自然的现象。实验结果表明,通过连续改变生成角度以实现植物的动态模拟效果,实现了比较好的动态视觉效果,从而逼真模拟自然界中的动态植物,满足了实验要求。 展开更多
关键词 分形 L-系统 植物模拟 生成角度
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