西南地区HPV-6和HPV-11 E6/E7基因多态性分析

目的研究西南地区人乳头瘤病毒6型(HPV-6)和11型(HPV-11)E6/E7基因多态性,为低危型HPV的防治提供分子水平。方法对HPV-6和HPV-11阳性标本扩增其目的基因,测序并对比Genenbank参考序列,对变异初步分析;PAML 4.8软件作用于E6/E7基因的选择压力。结果 HPV-6E6/E7基因共12个突变位点,其中有3个是首次发现的突变位点,5/12为非同义突变;HPV-11E6/E7中,共计5个单核苷酸突变,具有2/5非同义和3/5同义突变。选择压力结果显示,只有HPV-6E7基因有3个正向选择位点,分别是4R**,34E**和52F**。结论 HPV-6E6和E7序列在分析的群组中高度保守,表示HPV-6在进化的过程中,形成了有利于生存的分离株。HPV-11突变未发现正向选择位点,表明选择的变异对HPV-11来说适应环境较困难。

气象因素对四川省手足口病发病率的影响及预测模型构建

目的分析2013-2019年四川省手足口病(hand foot and mouth disease, HFMD)的流行特征,研究气象学因素与HFMD发病率的相关性,并构建预测模型。方法通过中国疾病预防控制中心和中国气象数据网收集2013-2019年四川省HMFD监测数据和气象数据。采用Spearman相关分析探究HFMD月发病率与气象学因素的关系,同时采用多元回归模型和支持向量回归(support vector regression, SVR)模型分别构建HFMD月发病率预测模型。结果 2013-2019年四川省累计报道HFMD 615 840例,死亡病例81例,年均发病率107.31/10~5,死亡率0.16/10~6。Spearman相关分析显示月平均相对湿度(r=0.342)、月平均气温(r=0.284)、月平均水汽压(r=0.304)、月平均降水天数(r=0.259)与HFMD月发病率呈正向弱相关。多元回归模型预测结果(R^2=0.375)准确性不如SVR模型(R^2=0.836),SVR模型对2013-2018年HFMD月发病率有较好的拟合,能较好地预测2019年发病高峰。结论月平均相对湿度对HFMD月发病率影响最大;SVR模型的拟合值与实际值吻合度较高,对四川省HFMD发病情况预测具有一定价值。