长牡蛎(Crassostrea gigas)中ChIP-seq方法的建立

染色质免疫共沉淀技术(Ch IP)作为研究DNA结合蛋白与DNA相互作用最有力的工具,越来越受到重视。但目前该技术在牡蛎等贝类中的应用尚未见相关报道。为了研究长牡蛎早期胚胎发育过程中表观遗传信息的变化模式,本文在长牡蛎胚胎中探索并建立了一套完整的染色质免疫共沉淀方法,构建了高质量的高通量测序文库,首次获得了牡蛎全基因组水平的组蛋白H3K4me3修饰分布,从而为研究牡蛎的表观遗传调控奠定了基础。

ChIP-seq技术的研究进展

染色体免疫共沉淀测序(Chromatin immunoprecipitation followed by sequencing,ChIP-seq)是研究DNA-蛋白质互作的有力工具,被广泛用于RNA聚合酶、转录因子和组蛋白修饰等在基因组上的精确定位。近年来,在ChIP-seq技术的基础上,科学家提出了一系列研究DNA-蛋白质互作的技术方法,提高了测序分辨率,降低了实验成本,极大推动了表观基因组学的发展。本文综述了多种DNA-蛋白质互作研究技术的原理及其应用场景,介绍了在单细胞水平上研究DNA-蛋白质互作的实现方法,并展望其未来发展的方向。