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离缘蝽的触角转录组和嗅觉相关基因
1
作者
柳大军
付淑慧
+5 位作者
郭青枝
靳辉
施宝仪
王洪潇
张虎芳
史晓晶
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期10-16,共7页
【目的】获得离缘蝽(Chorosoma macilentum)成虫触角的转录组数据,通过功能注释鉴定嗅觉相关基因,以期为研究离缘蝽触角信息交流的分子基础提供理论依据。【方法】采用Illumina HiSeq高通量测序平台对离缘蝽雌、雄成虫触角转录组进行测...
【目的】获得离缘蝽(Chorosoma macilentum)成虫触角的转录组数据,通过功能注释鉴定嗅觉相关基因,以期为研究离缘蝽触角信息交流的分子基础提供理论依据。【方法】采用Illumina HiSeq高通量测序平台对离缘蝽雌、雄成虫触角转录组进行测序,并对相关数据进行注释和表达差异分析。【结果】经组装后获得93395条unigenes,其中22904条在NR数据库得到注释,与茶翅蝽(Halyomorpha halys)相似性最高,为42.84%。GO注释结果显示:26769条unigenes根据其功能注释到细胞组分、分子功能和生物学过程3类53个亚类。KEGG代谢通路分析结果显示:10831条unigenes参与了5类代谢通路,且以信号转导占比最高,为11.62%。基于注释信息,在离缘蝽触角转录组中挖掘出94个嗅觉相关基因,包括54个嗅觉受体基因、25个气味结合蛋白基因、7个化学感受蛋白基因、5个味觉受体基因和3个感觉神经元膜蛋白基因。表达差异分析显示:与雌虫触角转录组相比,离缘蝽雄虫触角转录组包括131个上调表达基因和171个下调表达基因,下调表达基因中包含1个化学感受蛋白基因,且有5个嗅觉受体基因仅在雄成虫触角中表达。【结论】本研究测得了离缘蝽成虫触角转录组,筛选出嗅觉相关基因,推测雌、雄离缘蝽成虫对外界气味化合物的识别存在差异,差异表达基因可能在离缘蝽信息识别过程中发挥着重要作用。
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关键词
离缘蝽
触角
转录组测序
嗅觉相关基因
差异表达基因
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题名
离缘蝽的触角转录组和嗅觉相关基因
1
作者
柳大军
付淑慧
郭青枝
靳辉
施宝仪
王洪潇
张虎芳
史晓晶
机构
忻州师范学院生物系
出处
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期10-16,共7页
基金
山西省基础研究计划青年科学研究项目(20210302124140)
山西省基础研究计划自然科学研究面上项目(202103021224331)。
文摘
【目的】获得离缘蝽(Chorosoma macilentum)成虫触角的转录组数据,通过功能注释鉴定嗅觉相关基因,以期为研究离缘蝽触角信息交流的分子基础提供理论依据。【方法】采用Illumina HiSeq高通量测序平台对离缘蝽雌、雄成虫触角转录组进行测序,并对相关数据进行注释和表达差异分析。【结果】经组装后获得93395条unigenes,其中22904条在NR数据库得到注释,与茶翅蝽(Halyomorpha halys)相似性最高,为42.84%。GO注释结果显示:26769条unigenes根据其功能注释到细胞组分、分子功能和生物学过程3类53个亚类。KEGG代谢通路分析结果显示:10831条unigenes参与了5类代谢通路,且以信号转导占比最高,为11.62%。基于注释信息,在离缘蝽触角转录组中挖掘出94个嗅觉相关基因,包括54个嗅觉受体基因、25个气味结合蛋白基因、7个化学感受蛋白基因、5个味觉受体基因和3个感觉神经元膜蛋白基因。表达差异分析显示:与雌虫触角转录组相比,离缘蝽雄虫触角转录组包括131个上调表达基因和171个下调表达基因,下调表达基因中包含1个化学感受蛋白基因,且有5个嗅觉受体基因仅在雄成虫触角中表达。【结论】本研究测得了离缘蝽成虫触角转录组,筛选出嗅觉相关基因,推测雌、雄离缘蝽成虫对外界气味化合物的识别存在差异,差异表达基因可能在离缘蝽信息识别过程中发挥着重要作用。
关键词
离缘蝽
触角
转录组测序
嗅觉相关基因
差异表达基因
Keywords
Chorosoma macilentum
antenna
transcriptome sequencing
olfaction-related genes
differentially expressed genes
分类号
Q969.352.2 [生物学—昆虫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
离缘蝽的触角转录组和嗅觉相关基因
柳大军
付淑慧
郭青枝
靳辉
施宝仪
王洪潇
张虎芳
史晓晶
《云南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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