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吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用
1
作者
张茗起
王蕊
+16 位作者
张春宵
孙擘
任洁
李淑芳
王璐
朱少喜
张江斌
施昕晨
王海杰
张云龙
田红丽
赵怡锟
匡猛
王元东
易红梅
李晓辉
王凤格
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期236-249,I0001,I0002,共16页
【目的】农作物种质资源具有重要的战略地位。吉林省玉米种质资源库主要存储具有北方春玉米区特色的种质资源。鉴于在传统农作物种质资源管理过程中难以获取真实身份信息的现状,利用分子标记技术构建种质资源分子身份证可以有效鉴定种...
【目的】农作物种质资源具有重要的战略地位。吉林省玉米种质资源库主要存储具有北方春玉米区特色的种质资源。鉴于在传统农作物种质资源管理过程中难以获取真实身份信息的现状,利用分子标记技术构建种质资源分子身份证可以有效鉴定种质资源真实身份,强化种质资源的分类管理。通过深度发掘吉林省玉米种质资源库的优异资源,推动共享利用。【方法】以吉林省玉米种质资源库中的2918份玉米种质资源为研究对象,采用玉米品种鉴定检测标准中推荐的40对SSR标记,以及61214个SNP标记来构建其分子身份证。根据获得的分子身份证信息将种质资源划分为核心、同近源、异质和群体等类进行管理,并进一步针对核心种质进行遗传多样性分析。【结果】为2918份种质资源构建了SSR分子身份证,为除异质性种质外的2502份种质资源构建了SNP分子身份证。分别制定了玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的建设规范。其中,SSR分子身份证由40个SSR位点指纹转化为三位数字和一位字母的编码组合构成,并以二维码形式存储;SNP分子身份证由61214个SNP位点指纹转化为可视化的条形码。根据样品纯合度和指纹特异性等特征,将样品划分为1561份核心类、705份同近源类、416份异质类及236份群体类种质资源。遗传多样性分析表明,以旅大红骨群、黄改群为代表的国内种质资源是该库的主要种质资源,占全部核心种质资源的64.38%。【结论】提出了玉米种质资源分子身份证构建流程,为吉林省玉米种质资源库2918份种质资源构建了全部的SSR分子身份证和2502份SNP分子身份证;建立了核心、同近源、异质、群体四类种质资源筛选方案,实现了种质资源的分类管理。
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关键词
玉米
种质资源
吉林
SSR
SNP
分子身份证
下载PDF
职称材料
适于玉米杂交种复杂样品纯度鉴定的SSR复合检测方案的建立
2
作者
施昕晨
王蕊
+5 位作者
葛建镕
张云龙
任洁
王璐
易红梅
王凤格
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期74-81,共8页
为了解决玉米复杂样品纯度中存在遗传不稳定及回交株等难以鉴定的问题,通过分析3998份国家和省级审定玉米品种,结合快速提取、多重扩增体系等技术,构建一套适用于复杂样品纯度检测的复合检测方案。分析53份不同来源的郑单958纯度测试样...
为了解决玉米复杂样品纯度中存在遗传不稳定及回交株等难以鉴定的问题,通过分析3998份国家和省级审定玉米品种,结合快速提取、多重扩增体系等技术,构建一套适用于复杂样品纯度检测的复合检测方案。分析53份不同来源的郑单958纯度测试样品,结果表明,对于复杂样品使用单个位点进行纯度判定时,不同位点间结果会有较大差别,使用3个或3个以上位点综合判定时能够有效获得准确稳定的纯度检测结果。复合检测方案能够在时间和成本未大幅增加、仅增加少数引物的条件下获得多个SSR标记指纹,使复杂样品得到更加全面、精准解析,从而为种子生产中复杂样品的质量问题提供解决方案。
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关键词
玉米
杂交种
复杂样品
纯度
SSR标记
复合检测方案
原文传递
题名
吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用
1
作者
张茗起
王蕊
张春宵
孙擘
任洁
李淑芳
王璐
朱少喜
张江斌
施昕晨
王海杰
张云龙
田红丽
赵怡锟
匡猛
王元东
易红梅
李晓辉
王凤格
机构
北京市农林科学院玉米研究所/农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建)/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室
吉林省农业科学院玉米研究所
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
吉林省农业科学院作物资源研究所
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期236-249,I0001,I0002,共16页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1201005)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20230303)
北京市农林科学院科研创新平台建设专项(PT2023-34)。
文摘
【目的】农作物种质资源具有重要的战略地位。吉林省玉米种质资源库主要存储具有北方春玉米区特色的种质资源。鉴于在传统农作物种质资源管理过程中难以获取真实身份信息的现状,利用分子标记技术构建种质资源分子身份证可以有效鉴定种质资源真实身份,强化种质资源的分类管理。通过深度发掘吉林省玉米种质资源库的优异资源,推动共享利用。【方法】以吉林省玉米种质资源库中的2918份玉米种质资源为研究对象,采用玉米品种鉴定检测标准中推荐的40对SSR标记,以及61214个SNP标记来构建其分子身份证。根据获得的分子身份证信息将种质资源划分为核心、同近源、异质和群体等类进行管理,并进一步针对核心种质进行遗传多样性分析。【结果】为2918份种质资源构建了SSR分子身份证,为除异质性种质外的2502份种质资源构建了SNP分子身份证。分别制定了玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的建设规范。其中,SSR分子身份证由40个SSR位点指纹转化为三位数字和一位字母的编码组合构成,并以二维码形式存储;SNP分子身份证由61214个SNP位点指纹转化为可视化的条形码。根据样品纯合度和指纹特异性等特征,将样品划分为1561份核心类、705份同近源类、416份异质类及236份群体类种质资源。遗传多样性分析表明,以旅大红骨群、黄改群为代表的国内种质资源是该库的主要种质资源,占全部核心种质资源的64.38%。【结论】提出了玉米种质资源分子身份证构建流程,为吉林省玉米种质资源库2918份种质资源构建了全部的SSR分子身份证和2502份SNP分子身份证;建立了核心、同近源、异质、群体四类种质资源筛选方案,实现了种质资源的分类管理。
关键词
玉米
种质资源
吉林
SSR
SNP
分子身份证
Keywords
maize
germplasm resource
Jilin
SSR
SNP
molecular ID
分类号
S513 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
适于玉米杂交种复杂样品纯度鉴定的SSR复合检测方案的建立
2
作者
施昕晨
王蕊
葛建镕
张云龙
任洁
王璐
易红梅
王凤格
机构
北京市农林科学院玉米研究中心/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室
出处
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期74-81,共8页
文摘
为了解决玉米复杂样品纯度中存在遗传不稳定及回交株等难以鉴定的问题,通过分析3998份国家和省级审定玉米品种,结合快速提取、多重扩增体系等技术,构建一套适用于复杂样品纯度检测的复合检测方案。分析53份不同来源的郑单958纯度测试样品,结果表明,对于复杂样品使用单个位点进行纯度判定时,不同位点间结果会有较大差别,使用3个或3个以上位点综合判定时能够有效获得准确稳定的纯度检测结果。复合检测方案能够在时间和成本未大幅增加、仅增加少数引物的条件下获得多个SSR标记指纹,使复杂样品得到更加全面、精准解析,从而为种子生产中复杂样品的质量问题提供解决方案。
关键词
玉米
杂交种
复杂样品
纯度
SSR标记
复合检测方案
Keywords
Maize
Hybrid
Complex sample
Purity
SSR marker
Multiplexed reaction system
分类号
S513.037 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用
张茗起
王蕊
张春宵
孙擘
任洁
李淑芳
王璐
朱少喜
张江斌
施昕晨
王海杰
张云龙
田红丽
赵怡锟
匡猛
王元东
易红梅
李晓辉
王凤格
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
适于玉米杂交种复杂样品纯度鉴定的SSR复合检测方案的建立
施昕晨
王蕊
葛建镕
张云龙
任洁
王璐
易红梅
王凤格
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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