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基于深度学习与阈值分割的线虫识别
1
作者
杜昕泽
金治宇
+4 位作者
施朋
赵鱼良
俸浩然
张璇
朱作斌
《徐州医科大学学报》
CAS
2022年第3期157-162,共6页
目的基于深度学习和阈值分割的方法探索对图像中秀丽隐杆线虫数量和聚集程度的统计是否能提高行为实验的效率和准确度,便于利用线虫等小型模式生物高通量筛选针对孤独症的潜在药物。方法采集5000张含有单只线虫的培养基样本,分别用人工...
目的基于深度学习和阈值分割的方法探索对图像中秀丽隐杆线虫数量和聚集程度的统计是否能提高行为实验的效率和准确度,便于利用线虫等小型模式生物高通量筛选针对孤独症的潜在药物。方法采集5000张含有单只线虫的培养基样本,分别用人工计数法和基于深度学习与阈值分割的方法设计线虫识别检测算法,实现对培养基中线虫的计数与聚集程度判断,并对比其耗时长短和准确率。结果本研究基于深度学习和阈值分割算法,设计了自动统计线虫数量及聚集程度的软件,该软件对每张图像的检测时间在毫秒级别,相比较人工统计的100 s量级,检测效率显著提高,且检测的准确率较好,针对单只线虫的检测准确率超过90%。结论与人工计数法相比,基于深度学习与阈值分割算法的软件对模式生物秀丽隐杆线虫计数和聚集程度判断的效率明显提高,本研究的基于深度学习与阈值分割算法将显著提高孤独症等神经行为相关药物筛选效率。
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关键词
秀丽隐杆线虫
识别计数
聚集行为
深度学习
阈值分割
下载PDF
职称材料
失眠,用磁石菊花水泡脚吧
2
作者
施朋
《祝你幸福》
2013年第4期64-64,共1页
正出于工作需要,半年前我离开父母妻子来到山东,照顾老人、孩子的工作都落到了妻子身上。妻子从来没有向我诉说过压力,反而常常安慰我,让我在外面好好工作。我是个粗枝大叶的男人,哪懂关心别人的健康,直到有次被父母不满地数落我才知道...
正出于工作需要,半年前我离开父母妻子来到山东,照顾老人、孩子的工作都落到了妻子身上。妻子从来没有向我诉说过压力,反而常常安慰我,让我在外面好好工作。我是个粗枝大叶的男人,哪懂关心别人的健康,直到有次被父母不满地数落我才知道,我离家后妻子压力很大,经常失眠。
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关键词
失眠
菊花
磁石
泡脚
妻子
中药
父母
工作
过压力
夜交藤
原文传递
题名
基于深度学习与阈值分割的线虫识别
1
作者
杜昕泽
金治宇
施朋
赵鱼良
俸浩然
张璇
朱作斌
机构
徐州医科大学第一临床医学院
南京大学电子科学与工程学院
徐州医科大学麻醉学院
徐州医科大学遗传学教研室
出处
《徐州医科大学学报》
CAS
2022年第3期157-162,共6页
基金
基础医学国家级实验教学示范中心(徐州医科大学)资助项目
江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(创新训练项目,202010313070Y)
国家自然科学基金(81701390)。
文摘
目的基于深度学习和阈值分割的方法探索对图像中秀丽隐杆线虫数量和聚集程度的统计是否能提高行为实验的效率和准确度,便于利用线虫等小型模式生物高通量筛选针对孤独症的潜在药物。方法采集5000张含有单只线虫的培养基样本,分别用人工计数法和基于深度学习与阈值分割的方法设计线虫识别检测算法,实现对培养基中线虫的计数与聚集程度判断,并对比其耗时长短和准确率。结果本研究基于深度学习和阈值分割算法,设计了自动统计线虫数量及聚集程度的软件,该软件对每张图像的检测时间在毫秒级别,相比较人工统计的100 s量级,检测效率显著提高,且检测的准确率较好,针对单只线虫的检测准确率超过90%。结论与人工计数法相比,基于深度学习与阈值分割算法的软件对模式生物秀丽隐杆线虫计数和聚集程度判断的效率明显提高,本研究的基于深度学习与阈值分割算法将显著提高孤独症等神经行为相关药物筛选效率。
关键词
秀丽隐杆线虫
识别计数
聚集行为
深度学习
阈值分割
Keywords
Caenorhabditis elegans
identification and count
gathering behavior
deep learning
threshold segmentation
分类号
R-332 [医药卫生]
下载PDF
职称材料
题名
失眠,用磁石菊花水泡脚吧
2
作者
施朋
出处
《祝你幸福》
2013年第4期64-64,共1页
文摘
正出于工作需要,半年前我离开父母妻子来到山东,照顾老人、孩子的工作都落到了妻子身上。妻子从来没有向我诉说过压力,反而常常安慰我,让我在外面好好工作。我是个粗枝大叶的男人,哪懂关心别人的健康,直到有次被父母不满地数落我才知道,我离家后妻子压力很大,经常失眠。
关键词
失眠
菊花
磁石
泡脚
妻子
中药
父母
工作
过压力
夜交藤
分类号
R163 [医药卫生—公共卫生与预防医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于深度学习与阈值分割的线虫识别
杜昕泽
金治宇
施朋
赵鱼良
俸浩然
张璇
朱作斌
《徐州医科大学学报》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
2
失眠,用磁石菊花水泡脚吧
施朋
《祝你幸福》
2013
0
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