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红鳍东方鲀ctgf基因的SNPs筛选及其与早期生长性状的关联分析
被引量:
2
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作者
周金
旭王宁
+8 位作者
徐浩
王冠
马文超
杨晓
肖龙
刘圣聪
仇雪梅
孟雪松
王秀利
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期762-770,共9页
结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)是一种分泌蛋白,可调节细胞的增殖、分化和生长。为探究ctgf基因是否存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其与红鳍东方鲀早期生长性状的相关性,本研究对...
结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)是一种分泌蛋白,可调节细胞的增殖、分化和生长。为探究ctgf基因是否存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其与红鳍东方鲀早期生长性状的相关性,本研究对2月龄的893个红鳍东方鲀个体的体重、体长和体全长早期的生长性状进行了测定,筛选了ctgf基因上的SNPs位点,利用最小二乘法分析了SNPs与早期生长性状间的相关性。结果表明,在ctgf基因上存在14个SNP位点,其中C23T、G39T和C270G位点为错义突变,这些位点编码的氨基酸种类由苏氨酸、亮氨酸和丙氨酸分别变为甲硫氨酸、苯丙氨酸和甘氨酸。C23T、G39T和C270G位点均与红鳍东方鲀早期生长性状相关,其中C23T位点的CC基因型个体的体长极显著长于CT基因型个体的体长(P<0.01);G39T位点TT基因型在体全长上显著大于GG基因型和GT基因型个体的体全长(P<0.05),TT基因型个体在体重和体长这两个生长性状上极显著大于GG基因型和GT基因型个体的体重和体全长(P<0.01);C270G位点的CG基因型个体的体全长显著大于CC基因型个体的体全长(P<0.05)。研究结果为红鳍东方鲀体重、体长和体全长等早期生长性状的选择、分子标记辅助育种提供了参考。
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关键词
红鳍东方鲀
结缔组织生长因子(ctgf)基因
单核苷酸多态性
早期生长性状
原文传递
题名
红鳍东方鲀ctgf基因的SNPs筛选及其与早期生长性状的关联分析
被引量:
2
1
作者
周金
旭王宁
徐浩
王冠
马文超
杨晓
肖龙
刘圣聪
仇雪梅
孟雪松
王秀利
机构
大连海洋大学水产与生命学院
大连天正实业有限公司
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期762-770,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFD0900503)
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系项目(CARS-47)
大连市科技创新基金项目(2018J12SN070)共同资助。
文摘
结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)是一种分泌蛋白,可调节细胞的增殖、分化和生长。为探究ctgf基因是否存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其与红鳍东方鲀早期生长性状的相关性,本研究对2月龄的893个红鳍东方鲀个体的体重、体长和体全长早期的生长性状进行了测定,筛选了ctgf基因上的SNPs位点,利用最小二乘法分析了SNPs与早期生长性状间的相关性。结果表明,在ctgf基因上存在14个SNP位点,其中C23T、G39T和C270G位点为错义突变,这些位点编码的氨基酸种类由苏氨酸、亮氨酸和丙氨酸分别变为甲硫氨酸、苯丙氨酸和甘氨酸。C23T、G39T和C270G位点均与红鳍东方鲀早期生长性状相关,其中C23T位点的CC基因型个体的体长极显著长于CT基因型个体的体长(P<0.01);G39T位点TT基因型在体全长上显著大于GG基因型和GT基因型个体的体全长(P<0.05),TT基因型个体在体重和体长这两个生长性状上极显著大于GG基因型和GT基因型个体的体重和体全长(P<0.01);C270G位点的CG基因型个体的体全长显著大于CC基因型个体的体全长(P<0.05)。研究结果为红鳍东方鲀体重、体长和体全长等早期生长性状的选择、分子标记辅助育种提供了参考。
关键词
红鳍东方鲀
结缔组织生长因子(ctgf)基因
单核苷酸多态性
早期生长性状
Keywords
Takifugu rubripes
Connective tissue growth factor(ctgf)gene
Single nucleotide polymorphism
Early growth traits
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
红鳍东方鲀ctgf基因的SNPs筛选及其与早期生长性状的关联分析
周金
旭王宁
徐浩
王冠
马文超
杨晓
肖龙
刘圣聪
仇雪梅
孟雪松
王秀利
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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