肝细胞癌患者血液外泌体ceRNA调控网络的构建及生物信息学分析

目的基于肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者血液外泌体中差异表达的长链非编码RNA(long non-cording RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA),从竞争性内源性(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络角度出发,探索HCC的发病机制及潜在的分子标志物。方法通过exoRBase数据库获取HCC患者及健康对照者血液外泌体RNA的表达谱数据和注释文件,利用R软件进行数据处理和差异表达分析。使用Targetscan、miRanda、CSCD数据库预测可能与差异表达的lncRNA、circRNA、mRNA结合的miRNA,预测结果取交集后使用cytoscape3.9.1构建ceRNA调控网络。最后,对网络中的DEmRNA进行GO、KEGG富集分析及生存分析。结果共发现62个差异表达lncRNAs,18个差异表达circRNAs和160个差异表达mRNAs。经数据库分别预测其可能的结合靶点并将结果取交集后,共计20个DElncRNAs,16个DEcircRNAs,40个DEmRNAs,44个miRNAs被筛选出来构建ceRNA调控网络。GO富集分析显示网络中的DEmRNAs在生物学过程中主要富集在含核定位信号蛋白导入细胞核、肌管分化、RNA剪接调控等方面,细胞组分集中在核斑点、核膜孔、PML体等,分子功能主要表现在蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性、蛋白激酶调节剂活性、GTP酶激活剂活性等方面。KEGG富集结果显示这些DEmRNAs与MAPK信号通路、癌症中的中心碳代谢、胰高血糖素信号通路等有密切关联。生存分析显示,12个基因(ADAMTS5、CDC42、HNRNPA3、LSM12、MOB1A、RBM39、SEPT7、SMARCA5、STK4、TUBB2A、UBC、VOPP1)与HCC患者的预后相关。结论HCC患者血液外泌体ceRNA网络的构建和生物信息学分析结果可为探讨HCC的发病机制及潜在生物标志物提供新的思路和理论依据。

PNI和SII对TACE联合卡瑞利珠单抗及酪氨酸激酶抑制剂治疗肝癌患者的预后评估

目的探讨预后营养指数(PNI)和系统免疫炎症指数(SII)对接受经肝动脉化疗栓塞术(TACE)联合卡瑞利珠单抗及酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗的不可切除肝细胞癌(uHCC)患者的预后评估价值。方法对2018年10月—2022年9月徐州医科大学附属医院收治的140例接受TACE联合卡瑞利珠单抗及TKI治疗的uHCC患者的临床资料进行回顾性分析。使用受试者工作特征(ROC)曲线确定PNI和SII的最佳截断值,卡方检验评估不同水平PNI、SII与患者临床病理特征的关系,并利用Cox比例风险模型分析影响患者预后的危险因素。通过Kaplan-Meier法绘制生存曲线,ROC曲线用于评价PNI、SII及PNI-SII对接受TACE联合卡瑞利珠单抗及TKI治疗的uHCC患者预后的预测效能。结果PNI最佳截断值为46.05,SII最佳截断值为303.09,PNI、SII的曲线下面积(AUC)分别为0.744、0.778,敏感度分别为78.6%、81.4%,特异度分别为70.0%、61.4%。单因素和多因素分析结果显示,低PNI、高SII是uHCC患者无进展生存期(PFS)、总生存期(OS)的独立危险因素(P<0.05)。生存分析显示,高PNI组、低SII组分别较低PNI组、高SII组有更长的中位PFS和OS(P<0.05);PNI-SII评分0分组的生存情况显著优于2分组(P<0.05)。PNI-SII的AUC为0.854,优于单独PNI和SII(P<0.05)。结论PNI、SII可作为接受TACE联合卡瑞利珠单抗及TKI治疗的uHCC患者有效的预后评估指标,PNI-SII联合相较于单独指标预测效能更高。