嗜酸乳杆菌CICC 6074全基因组信息和高温、高盐胁迫下的转录组学分析

通过益生菌在高温、高盐条件下的转录组分析,揭示菌体细胞在类似环境下的生理反应情况及相关机制。采用三代测序及生物信息学分析方法测定并拼接完成嗜酸乳杆菌CICC 6074的全基因草图。将生长对数期的嗜酸乳杆菌细胞在高温、高盐条件下耐受后,提取总RNA,在Illumina HiSeq×Ten PE150平台上进行RNA测序,转录组学分析方法分析基因表达差异。结果表明,嗜酸乳杆菌CICC 6074的基因组为一条长1992024 bp的双链环状DNA分子,不含质粒序列,GC含量为34.71%,共预测出1864个基因。在高温胁迫组,共检测到513个有显著性差异,显著上调305个,显著下调208个;在高盐胁迫组中共检测到161个有显著性差异,显著上调81个,显著下调80个。功能富集分析结果表明,在高温胁迫时,嗜酸乳杆菌可能通过增强有机酸的代谢和转录翻译调控过程来提升细胞对环境的适应性;而在高盐胁迫时,主要通过增强糖醇类代谢和增强膜运输来提升生存能力。

基于实时荧光PCR方法的牦牛肉源性成分鉴别

为了建立牦牛肉源性检测的实时荧光PCR方法,本研究基于比较牦牛与黄牛、鸡、猪、羊、鸭等动物的Cytb基因序列差异,设计其特异性引物。特异性实验结果表明,猪肉、鸡肉和黄牛肉的DNA均不与引物发生交叉反应;灵敏度实验表明方法的最低检出限可达0.004 ng/μL;抗干扰实验结果表明,当牦牛肉的添加量为1%时仍可检出;对市场上的20份不同种肉样进行检测,除牦牛肉样品检测结果呈现阳性外,其余肉样均为阴性。本实验所建立的实时荧光PCR方法为牦牛源性成分鉴别提供一种快速、准确、专属性强的检测方法。