题名 通过DFT变换提取DNA序列特征聚类物种
被引量:3
1
作者
昌攀
钟诚
机构
广西大学计算机与电子信息学院广西高校并行分布式计算技术重点实验室
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2018年第3期463-467,共5页
基金
国家自然科学基金项目(61462005)资助
广西自然科学基金项目(2014GXNSFAA118396)资助
文摘
利用离散傅里叶变换(Discrete Fourier Transformation,DFT)可以在不丢失信息的情况下揭示DNA序列隐藏信息的特性,通过挖掘DNA序列中子序列种类、含量和位置3种生物特征,将任意长度的DNA序列提取成等长的特征向量,使用欧式距离计算DNA序列相似度,给出一种改进的应用于物种聚类的无需比对的DNA序列相似度计算算法AFCS_DFT.实验结果表明:与已有的同类方法相比,AFCS_DFT算法计算得到了更准确的DNA序列相似度,利用此相似度对物种聚类,可以更准确地构建出反映物种聚类特征的系统进化树,揭示了进化水平越相近的物种的DNA序列越相近的特性.
关键词
DNA序列
聚类
相似度
无需比对
离散傅里叶变换
Keywords
DNA sequence
clustering
similarity
alignment-free
discrete fourier transformation
分类号
TP338
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
题名 改进的TransH模型在知识表示与推理领域的研究
被引量:1
2
作者
昌攀
曹扬
机构
中电科大数据研究院国家工程实验室
出处
《广西大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2020年第2期321-327,共7页
基金
天津市科技计划项目(18ZXZNGX00370)
国家自然科学基金资助项目(61572350)。
文摘
针对Trans系列的知识图谱表示与推理模型在训练的过程中,随机构造正负例三元组样本进行训练,没有考虑替换的实体与原实体之间存在的相似度差异度关系,导致模型无法识别实体之间的相似度,效果低下。在TransH模型的构建基础上,采用单层神经网络的非线性操作来精确刻画实体和关系之间的语义信息,同时创新性地加入了正、负三元组之间的头/尾实体之间的差异度信息,用于校正正、负三元组样本之间的联系,使模型能够辨别替换的实体与原实体间的相似度,进而提出了mTransH模型。实验证明:mTransH模型在知识图谱的链接预测任务中,提高了模型对正例样本的辨识度,从而提高知识推理的链接预测准确率。
关键词
知识图谱
表示
推理
相似度
mTransH模型
链接预测
Keywords
knowledge graph
representation
reasoning
similarity
mTransH model
link prediction
分类号
TP391
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
题名 基于C/S架构的音乐播放器
3
作者
昌攀
陈姚节
葛程
方志
机构
武汉科技大学
出处
《教育教学论坛》
2014年第49期72-74,共3页
文摘
本文论述了采用Java语言开发一种基于C/S架构的音乐播放器,利用JMF(Java Media Framework)实现播放功能。该播放器除实现普通播放器的功能外,其亮点在于可以自动或手动下载歌词并保存,并且可以自动进行歌词同步。该播放器设计界面简洁,功能强大,并且占用内存小,执行速度快。
关键词
音乐
JMF
播放器
分类号
TS954
[轻工技术与工程]
题名 基于多源导航信息的三维辅助导航仿真系统
被引量:1
4
作者
昌攀
机构
广西大学计算机与电子信息学院
出处
《广西科学院学报》
2017年第1期59-64,共6页
基金
广西科学研究与技术开发计划项目(桂科能1140008-3B)资助
文摘
【目的】为模拟仿真海上航行可能遇到的各种天气状况,开发一款基于多源导航信息的三维辅助导航仿真系统。【方法】在接受电子海图的数据基础上,利用OsgOcean类库对图形生成迅速以及对硬件的依赖性较低的特点,设计效果逼真的三维海景,真实再现海风、海浪等常见的天气状况;利用OpenSenceGraph(OSG)粒子对场景的渲染效果,模拟现实情形;利用碰撞检测算法,提前预估碰撞的状况,避免碰撞,构建起较真实的驾驶场景。【结果】仿真实验表明,设计的原型系统能消除驾驶员对真实驾驶环境的依赖,不受天气限制,驾驶员可以随时进行模拟驾驶。【结论】仿真系统实现了三维模拟仿真的基本功能,能够提供简便、直观的船舶模拟驾驶。
关键词
三维模拟驾驶
天气
导航信息
Keywords
three-dimensional simulation driving
weather
multi-source navigation information
分类号
TP393
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
题名 人员落水定位装置硬件设计与实现
被引量:2
5
作者
何世华
昌攀
张琪
葛程
方志
机构
武汉科技大学
出处
《教育教学论坛》
2014年第49期75-76,共2页
文摘
本文从海上救生的迫切性、重要性出发,应用射频技术、GPS技术和单片机技术研制出了一种基于GPS卫星导航系统研发的海上救生示位装置,实现了落水人员漂移轨迹实时跟踪等功能,解决了一直困扰着我国海上搜救"听不见落水人员报警"和"找不到落水人员位置"的难题。
关键词
GPS
海上搜救
实时跟踪
分类号
V244.215
[航空宇航科学与技术—飞行器设计]
题名 改进的无需比对的DNA序列分类算法
6
作者
张文影
昌攀
钟诚
机构
广西大学计算机与电子信息学院
出处
《计算机工程与设计》
北大核心
2018年第11期3415-3419,3455,共6页
基金
广西自然科学基金项目(2014GXNSFAA118396)
文摘
针对现有方法容易导致因序列重排或碱基丢失而影响分类精度、敏感度和特异性等问题,提出一种改进的无需比对DNA序列分类算法。通过对不等长的DNA序列功率谱采取匹配加权值的方法提取特征值,将任意长度的DNA序列映射成等长的特征向量,准确计算不同类DNA序列特征向量之间的距离,利用计算得到的距离值,通过K-NN(K-Nearest Neighbor)分类器完成DNA序列分类。在核小体DNA序列数据集CE、DM和HM上的实验结果表明,与已有的同类方法相比,该算法总体上获得了较高的分类精度、敏感度和特异性。
关键词
DNA序列
分类
无需比对
特征提取
离散傅里叶变换
Keywords
DNA sequence
classification
alignment-free
feature extraction
discrete Fourier transform
分类号
TP338.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
TP301.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]