目的利用再测序芯片对北京市首例人禽流感病例进行病原筛查和验证。方法采集病例咽拭子和气管抽吸物标本,利用real-ti me RT-PCR进行禽流感病毒H5N1亚型核酸检测;应用病原体再测序芯片对其进行复核,并对其它呼吸道病原体和流感病毒其它...目的利用再测序芯片对北京市首例人禽流感病例进行病原筛查和验证。方法采集病例咽拭子和气管抽吸物标本,利用real-ti me RT-PCR进行禽流感病毒H5N1亚型核酸检测;应用病原体再测序芯片对其进行复核,并对其它呼吸道病原体和流感病毒其它亚型进行筛查。结果气管抽吸物标本经real-ti me RT-PCR检测为禽流感病毒H5N1核酸阳性;再测序芯片检测的结果是获得了H5N1的非结构蛋白基因(NS)特异序列,通过与GenBank进行序列比对,确定为禽流感病毒H5N1核酸,并排除了30种流感病毒亚型和其它33种呼吸道病原体的感染。结论病原体再测序芯片具有高灵敏性和特异性,在北京市首例人禽流感病例的病原学筛查和验证中发挥了重要作用。展开更多
目的:对4株可疑霍乱弧菌进行种属鉴定。方法:对可疑菌落在传统血清学和系统生化鉴定的基础上进行细菌的分子鉴定:应用16S rDNA的序列分析进行细菌种属鉴定和实时荧光PCR检测O1、O139群霍乱弧菌。结果:16 s rDNA基因序列分析显示041和06...目的:对4株可疑霍乱弧菌进行种属鉴定。方法:对可疑菌落在传统血清学和系统生化鉴定的基础上进行细菌的分子鉴定:应用16S rDNA的序列分析进行细菌种属鉴定和实时荧光PCR检测O1、O139群霍乱弧菌。结果:16 s rDNA基因序列分析显示041和067为麦氏弧菌,059和074为霍乱弧菌;荧光定量PCR检测结果说明4株菌都不是O1和O139霍乱弧菌。结论:结合血清凝集和系统生化实验,可以确定041和067为麦氏弧菌,059和074为非O1/非O139霍乱弧菌。对于可疑和难鉴别的霍乱弧菌,不能单纯依靠血清学和表型鉴定方法,需要分子诊断方法,尤其是16SrDNA的序列分析,可以从分子水平为弧菌科细菌的种属鉴定提供更为直接的证据。展开更多
文摘目的利用再测序芯片对北京市首例人禽流感病例进行病原筛查和验证。方法采集病例咽拭子和气管抽吸物标本,利用real-ti me RT-PCR进行禽流感病毒H5N1亚型核酸检测;应用病原体再测序芯片对其进行复核,并对其它呼吸道病原体和流感病毒其它亚型进行筛查。结果气管抽吸物标本经real-ti me RT-PCR检测为禽流感病毒H5N1核酸阳性;再测序芯片检测的结果是获得了H5N1的非结构蛋白基因(NS)特异序列,通过与GenBank进行序列比对,确定为禽流感病毒H5N1核酸,并排除了30种流感病毒亚型和其它33种呼吸道病原体的感染。结论病原体再测序芯片具有高灵敏性和特异性,在北京市首例人禽流感病例的病原学筛查和验证中发挥了重要作用。
文摘目的:对4株可疑霍乱弧菌进行种属鉴定。方法:对可疑菌落在传统血清学和系统生化鉴定的基础上进行细菌的分子鉴定:应用16S rDNA的序列分析进行细菌种属鉴定和实时荧光PCR检测O1、O139群霍乱弧菌。结果:16 s rDNA基因序列分析显示041和067为麦氏弧菌,059和074为霍乱弧菌;荧光定量PCR检测结果说明4株菌都不是O1和O139霍乱弧菌。结论:结合血清凝集和系统生化实验,可以确定041和067为麦氏弧菌,059和074为非O1/非O139霍乱弧菌。对于可疑和难鉴别的霍乱弧菌,不能单纯依靠血清学和表型鉴定方法,需要分子诊断方法,尤其是16SrDNA的序列分析,可以从分子水平为弧菌科细菌的种属鉴定提供更为直接的证据。