白念珠菌唑类耐药和生物膜相关基因的表达

目的研究白念珠菌临床分离株唑类耐药和生物膜形成相关基因的表达。方法收集上海市公共卫生临床中心2006至2011年92例感染性疾病患者[病毒性肝炎、结核、获得性免疫缺陷综合征(AIDS)]血液、无菌部位和黏膜分离鉴定的白念珠菌104株,选用ATB FUNGUS3检测抗菌药物(氟康唑、伊曲康唑和伏立康唑)的最低抑菌浓度(MIC),采用半定量逆转录聚合酶链反应(PCR)分析唑类敏感、浓度依赖性敏感(S-DD)和耐药菌株之间药物外排泵基因CDR1、CDR2、MDR1和药物靶酶基因ERG11表达的差异,同时通过甲基四氮盐(XTT)代谢试验筛选强生物膜形成能力菌株(HBFs),研究其与弱生物膜形成能力菌株(LBFs)相关基因ALS3和HWP1表达的差异。结果 104株白念珠菌中共检测出16株至少对1种唑类药物耐药,6株至少对1种唑类药物S-DD。药物靶酶基因ERG11在耐药株、S-DD株和敏感菌之间比较,差异有统计学意义(P=0.007 8),且耐药株、S-DD株分别与敏感菌比较,差异有统计学意义(P<0.05),然而CDR1、CDR2和MDR1表达量在3种菌株间无明显差异。生物膜形成能力试验显示16株菌生物膜形成能力增强,其HWP1表达量与LBFs比较差异有统计学意义(P=0.007 9),ALS3表达量差异无统计学意义。结论 ERG11基因的过度表达为白念珠菌唑类耐药的重要机制。菌丝细胞壁蛋白HWP1基因的高表达与白念珠菌生物膜形成增强相关。

3种方法检测艾滋病患者血和脑脊液中隐球菌的结果分析

目的比较真菌培养、墨汁染色、侧向免疫层析法(LFA)检测艾滋病患者脑脊液和血标本中隐球菌的阳性率差异,以期为临床医生提供隐球菌感染理想的检测方法。方法采用回顾性分析,收集2017年本院就诊的1 049例AIDS患者的血液和脑脊液标本,进行真菌培养、侧向免疫层析法和脑脊液墨汁染色。数据分析应用SPSS 14.0软件。结果 1 049例AIDS患者,其血培养、隐球菌抗原检测、脑脊液培养和墨汁染色阳性率分别为2.8%(19/688)、10.96%(115/1 049)、9.18%(29/316)、17.99%(59/328),其中201例患者同时做了脑脊液和血标本的隐球菌抗原检测,阳性率分别为27.86%和37.31%,差异有统计学意义(P<0.05)。292例AIDS患者同时做了脑脊液的墨汁染色和隐球菌抗原检测,阳性率分别为19.52%和23.97%,隐球菌抗原检测的阳性率大于墨汁染色法,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 3种方法检测结果显示侧向免疫层析法阳性率最高,比较脑脊液和血标本侧向免疫层析法阳性率,血标本阳性率较高,所以血标本侧向免疫层析法检测是诊断AIDS是否合并隐球菌感染的理想方法之一。

埃博拉病毒感染性标本在生物安全三级实验室的临床检验与生物安全防护

本文参考美国疾病预防控制中心的最新资讯和中国疾病预防控制中心制定的《埃博拉出血热个人防护指南(第二版)》,介绍当前在生物安全三级实验室开展埃博拉病毒感染者血液标本临床检验策略的最新研究进展,主要包括临床检验的操作流程以及操作人员必要的生物安全防护要点。

新型冠状病毒肺炎合并新生隐球菌感染1例报道

新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)是继严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(middle east respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)后出现的又一种能引起人严重呼吸系统疾病的新型冠状病毒——严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARSCoV-2)感染引发的传染病[1]。COVID-19传染性强、临床表现多样,给疫情防控和疾病治疗带来了一定的困难[2]。

2019年上海市三级医院细菌耐药监测

目的监测上海地区2019年三级甲等医院临床分离菌对抗菌药物的耐药性。方法对上述医院临床分离菌采用纸片扩散法或自动化仪器法,按上海市细菌真菌耐药监测网技术方案进行抗菌药物敏感性试验。按2019年CLSI文件标准判断结果。结果收集2019年1-12月监测网内三级医院临床分离菌共119 318株,其中革兰阳性菌占29.1%(34 756/119 318),革兰阴性菌占70.9%(84 562/119 318)。金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌和其他凝固酶阴性葡萄球菌中甲氧西林耐药株(MRSA、MRSE和其他MRCNS)的检出率分别为43.4%、83.2%和76.6%。甲氧西林耐药株(MRSA、MRSE和其他MRCNS)对绝大多数抗菌药物的耐药率均显著高于甲氧西林敏感株(MSSA、MSSE和其他MSCNS)。MRSA对甲氧苄啶-磺胺甲[口恶]唑和利福平的耐药率低,分别为5.2%和3.0%,MRSE对利福平耐药率低(7.6%),未发现万古霉素和利奈唑胺耐药株。肠球菌属中粪肠球菌对多数测试抗菌药物的耐药率均显著低于屎肠球菌;粪肠球菌中未发现万古霉素耐药株,但对利奈唑胺耐药率达1.7%;屎肠球菌对万古霉素和利奈唑胺耐药率分别为0.4%和0.2%。2019年儿童和成人中分离的肺炎链球菌中青霉素敏感株(PSSP)分别占96.8%和96.9%,检出率较2018年有所上升,中介和耐药株(PISP和PRSP)的检出率则有所下降。肠杆菌目细菌对碳青霉烯类抗生素仍较敏感,多数菌属的耐药率低于20.0%(除克雷伯菌属外)。此外,不动杆菌属对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为63.4%和63.1%,铜绿假单胞菌对上述两药的耐药率分别为30.0%和26.1%。结论临床分离菌对常见抗菌药物的耐药性仍呈增长趋势,尤其是碳青霉烯类耐药革兰阴性杆菌。上海市三级医院的耐药形势仍然严峻,需各相关部门协作以遏制耐药细菌流行播散。

上海本地居民马耳他布鲁菌感染1例

布鲁菌是一类人畜共患的感染性疾病的病原菌,牧区人群因接触患病的家畜或食用家畜肉、乳及乳制品而感染,临床表现为反复发热、关节痛、全身乏力,称为布鲁菌[1]。布鲁菌感染多发生于西北牧区,而城市居民接触病牲畜的机会较少,故罕见布鲁菌感染的相关报道[2]。本实验室于2016年9月从1例发热收治入院的上海本地城市居民的血液中分离出马耳他布鲁菌,现报告如下。

上海市热带念珠菌临床分离株耐药性及多位点序列分型研究

目的 分析上海市感染性疾病患者的热带念珠菌临床分离株耐药性,并对其进行分子特征研究.方法 于2012—2015年,从上海市公共卫生临床中心87例感染性疾病患者的真菌培养标本中分离热带念珠菌,共95株;同时,收集患者的临床基本资料.采用ATB FUNGUS 3药物敏感性检测板条分析菌株对抗真菌药物的耐药性,采用多位点序列分型法（MLST）对其进行分型,同时应用MEGA 5.2软件中UPGMA方法对95株热带念珠菌进行同源性分析.结果 95株热带念球菌分别来源于结核病患者（31株）、艾滋病患者（21株）、肝病患者（19株）和罕见原因感染或发热患者（24株）;对5-氟胞嘧啶、两性霉素B、氟康唑、伊曲康唑和伏立康唑的耐药率分别为：2.1%（2株）、0、26.3%（25株）、26.3%（25株）和26.3%（25株）,其中,唑类耐药株患者分别来源于罕见原因感染或发热患者（14株）、艾滋病患者（8株）和结核病患者（3株）.MLST分型分析显示,产生72个序列型（ST型）,其中70种为新型别;进化树分析显示,95株临床株分布为三大簇,唑类耐药株中有24株（96.0%）分布于同一簇.结论 分离的热带念珠菌主要对唑类药物耐药,MLST分型显示与其遗传背景密切相关.

2010年至2014年上海地区艾滋病患者深部真菌分离情况及药物敏感性分析

目的：探讨上海市公共卫生临床中心艾滋病患者临床标本中真菌菌株分布及药物敏感情况。方法对2010年1月至2014年12月上海市公共卫生临床中心收治的住院艾滋病患者的临床标本中真菌分离结果进行回顾性调查分析。结果共纳入3155例研究对象，送检深部真菌培养标本11291份，真菌分离阳性标本1786份（15．82％）。分离出真菌979株，鉴定为27个种或属，最常见的为白念珠菌（503株）、热带念珠菌（60株）、光滑念珠菌（48株）、克柔白念珠菌（41株）、新生隐球菌（179株）和马尔尼菲青霉菌（59株）。979株真菌的标本来源以呼吸道标本最多（61．09％），其次是粪便（13．28％）、脑脊液（11．24％）和全血（11．13％）；无菌组织标本真菌分离阳性率为6．92％（558／8052），主要来源于全血和脑脊液标本，分离的真菌中96．24％（537／558）为新型隐球菌和马尔尼菲青霉菌。药物敏感性分析显示，念珠菌对两性霉素B、5‐氟胞嘧啶、氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑的药物敏感性依次为100．00％、91．67％、83．33％、70．83％和83．33％，新生隐球菌对两性霉素B、5‐氟胞嘧啶及氟康唑的敏感性依次为96．05％、94．74％和97．37％。结论上海地区艾滋病患者重要的致病真菌有念珠菌、新生隐球菌及马尔尼菲青霉菌，全血和脑脊液标本病原菌的分布存在特殊性。念珠菌和新生隐球菌对常用抗真菌药物有不同程度耐药。

BACTECMGIT960系统培养分枝杆菌时污染菌的分析

目的通过分析不同标本,经BACTEC MGIT 960系统培养后出现的污染菌种类、污染率,寻找降低BACTEC MGIT 960系统培养的污染率方法,提高分枝杆菌培养的阳性率。方法对2011年8月-2012年3月本院送检的各类标本,经BACTEC MGIT960系统培养后产生的污染菌,用常规普通细菌培养鉴定方法和16S rRNA核酸测序进行菌种鉴定,并对污染菌种类、来源和前处理方法进行分析。结果 2 518份临床标本,污染222例,总污染率为8.8%(222/2 518)。共分离出13种菌株:以革兰阳性球菌和棒状杆菌属为主。常见标本的污染率:痰11.4%(153/1 347),尿液13.5%(30/223)、脑脊液0.5%(1/182)、脓液5.1%(8/157)、穿刺液1.9%(4/206)。结论 222例污染标本中细菌,以革兰阳性菌为主,多为口腔、皮肤和环境中正常菌群。规范正确的标本采集、寻找对革兰阳性菌杀灭更有效的方法,或者在培养液中加入合适的抗生素将成为进一步研究的重点。