中段尿培养检出B群链球菌的临床意义

目的 探讨中段尿培养中分离出B群链球菌(GBS)的临床意义和耐药性,旨在为临床尿路感染诊治提供依据。方法 通过实验室信息系统搜索2020年2月—2022年12月南京某医院住院和门诊患者中段尿培养分离出GBS的菌株信息,筛选资料完整者,查阅病例资料、尿常规及药敏试验结果。结果 中段尿培养标本共检出非重复细菌9 081株,其中GBS 425株,占比4.7%,位列第6。剔除资料不完整者,共纳入365例患者进行研究。其中男性169例(46.3%),女性196例(53.7%),平均年龄(55.4±15.2)岁。365例检出GBS的患者来源于17个科室,泌尿外科(237例,64.9%)占比最高。患者基础疾病主要包括高血压病136例,糖尿病95例,泌尿系统结石120例,泌尿系统肿瘤98例;211例患者接受了泌尿系统手术,术前均使用了抗菌药物,205例在术后留置导尿管;9例在妊娠中晚期尿液中检出GBS。GBS菌落计数≤10^(4)CFU/mL占36.4%(133例),10^(4)~10^(5)CFU/mL占38.9%(142例),≥10^(5)CFU/mL占24.7%(90例)。有尿路感染症状的患者占24.9%(91例),无症状性菌尿患者占75.1%(274例)。男性中有尿路感染症状者低于女性(19.5%VS 29.6%,P<0.05)。随着尿培养GBS菌落计数增加,有尿路感染症状的患者比例呈升高趋势(P<0.05)。尿培养送检当日尿常规白细胞、白细胞酯酶、亚硝酸盐阳性比率分别为53.2%、50.1%、3.8%。有症状尿路感染患者中尿潜血、白细胞酯酶、白细胞、尿蛋白的阳性率均高于无症状性菌尿患者(均P<0.05)。未发现GBS对青霉素、氨苄西林、万古霉素、利奈唑胺、替加环素耐药,对左氧氟沙星、莫西沙星耐药率在40%左右,对四环素、克林霉素耐药率>60%。结论 尿液中分离出GBS在非妊娠成人中比较常见,有尿路感染症状者仅占少数。尿培养、尿常规结果应结合患者临床症状、体征综合判断。尿液中GBS对多种抗菌药物敏感,临床应根据药敏结果合理用药。

血培养大肠埃希菌的耐药特点、毒力基因分布及种系分型

目的检测并分析血培养大肠埃希菌的耐药特点、种系分型和毒力基因分布。方法收集我院2019年1月1日至2020年12月13日连续且非重复血培养大肠埃希菌。采用微量肉汤法测定大肠埃希菌对17种抗菌药物的敏感性;水煮法提取细菌基因组DNA,采用PCR法检测arpA、chuA、yjaA、TspE4C2、ArpAgpE和trpAgpC基因以确定细菌的种系分型;采用多重PCR法检测毒力基因iutA、fimH、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、cvac、hlyA、traT、kpsMTⅢ和PAI;使用卡方检验分析种系分型之间的耐药率及毒力基因分布差异。结果270株血培养大肠埃希菌对头孢曲松、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林和环丙沙星的耐药率较高,均大于50.0%;对亚胺培南、厄他培南、阿米卡星和哌拉西林/他唑巴坦的敏感性较高,耐药率均低于5.0%。在种系分型方面,最常见的型别是B2型和D型,分别占总数的38.0%和16.2%,而E型和隐分支Ⅰ型占比<1.0%,较为少见。毒力基因分析发现,fimH和fyuA基因的分布率最高,均在99.0%以上,而kpsMTⅢ、hlyA和cvaC 3种基因的分布率较低,均低于20.0%。卡方检验显示,毒力基因iutA、fimH、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、PAI在B2型的分布显著高于非B2型(P<0.05),且B2型携带的iutA、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、PAI基因显著高于D型(P<0.05)。结论在治疗引起血流感染的大肠埃希菌时,应慎用头孢曲松、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林和环丙沙星等药物。血流感染的大肠埃希菌为B2型时,应同时进行中段尿培养以确认感染源并监测治疗的成功率。

基于平均核苷酸相似度和16S rDNA技术对全球沙门氏菌的鉴定比对分析

目的评估平均核苷酸相似度(average nucleotide identity,ANI)和16S rDNA技术对沙门氏菌的鉴定能力。方法从GenBank数据库批量下载全球沙门氏菌基因组和相应血清型,以沙门氏菌典型菌株的基因组作为分型菌株。利用fastANI软件,根据默认参数进行ANI分析。使用在线软件SpeciesFinder针对细菌的16S rDNA进行物种和血清型鉴定。结果在下载的2306个基因组中,1767株沙门氏菌存在178种血清型,以鼠伤寒沙门菌323株(18.3%)和肠炎沙门菌300株(17.0%)最为常见。ANI分析显示,以95%为界值时,仅有30株(1.3%)沙门氏菌被分配到1个特定的亚种,其余2276株(98.7%)沙门氏菌均可分配到2~5个亚种;以97%为界值时,2306株(100%)沙门氏菌均可被鉴定到唯一的亚种。基于16S rDNA的分析仅鉴定出1072株(46.5%)沙门氏菌,其中95.2%(1021/1072)的沙门氏菌鉴定的亚种结果与ANI(≥97%)分析鉴定的结果完全一致;与已知的血清型相比,仅有2.4%(19/784)的沙门氏菌与已知的血清型结果一致。结论ANI更适合沙门氏菌的种及亚种鉴定,ANI≥97%可作为沙门氏菌亚种的鉴定标准。16S rDNA技术对于沙门氏菌鉴定的敏感性尚有待提高。

基于NCBI数据库的皮氏不动杆菌分子分型及blaOXA基因分析

目的分析全球皮氏不动杆菌的分布特点、序列分型(ST)及blaOXA基因分布,为感染防控及临床用药提供参考。方法采用Aspera软件从NCBI批量下载所有皮氏不动杆菌基因组序列(截止日期为2023年11月30日),并使用perl脚本从下载的gbk文件中批量提取菌株元信息。使用自制的Perl程序从每个皮氏不动杆菌基因组序列文件中提取该基因的核苷酸编码序列作为分析数据库。从网站下载不动杆菌属7个管家基因的等位基因序列作为查询数据库进行BLASTN比较分析,确定每个基因组的ST。从NCBI病原细菌耐药基因数据库下载耐药基因blaOXA的核苷酸序列,采用自我编写的AMRG软件进行blaOXA基因的分布分析。结果共获取305株皮氏不动杆菌的基因组,主要分离自1990年至2020年,分离率呈逐年增长趋势,其中2015年分离率最高。美国、中国、德国的分离率位居前三位,分别为29.5%(90株)、15.7%(48株)、13.4%(41株)。180株(59.0%)标本来源为人类,其中,痰液[42株(23.3%)]、血液[27株(15.0%)]和皮肤软组织[15株(8.3%)]位居前三位。305株皮氏不动杆菌共鉴定出79种ST,其中,ST93(14.4%)、ST64(12.1%)和ST63(11.8%)占比较高。美国、中国、德国分别以ST64、ST63、ST93流行分布为主。305株皮氏不动杆菌中除6株不携带blaOXA基因外,其余299株菌共携带31种blaOXA变异体,其中252个blaOXA基因具有碳青霉烯酶水解活性,另有146株携带blaOXA-500基因。结论皮氏不动杆菌全球流行分布存在地域差异,D型碳青霉烯酶基因blaOXA的高度流行提示其潜在多药耐药趋势,值得临床监测。

肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶研究进展

肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemases,KPC)能水解几乎所有的β-内酰胺类抗生素,是临床上最重要的碳青霉烯酶,常见于以肺炎克雷伯菌为代表的肠杆菌科细菌。自首次分离以来,KPC酶已产生多种亚型,其编码基因位于质粒和转座子等可移动元件上,并迅速传播至世界各地。产KPC酶的细菌所引起的感染非常棘手,给患者带来巨大危害。该文就KPC酶的结构和流行特点、耐药特征、传播机制、感染人群分布及检测技术等方面进行综述,以期为临床合理用药及阻止产KPC酶细菌的传播提供依据。

碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌基因型检测研究

目的 分析碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)不同基因型耐药性及临床特征差异,为临床预防及治疗CRKP感染提供参考。方法 回顾性分析我院2018年9月—2021年8月收治的56例分离出CRKP菌株患者的临床资料,检测其耐药基因,并分析不同基因型CRKP的耐药性和临床特征。结果 56株CRKP中检出47株KPC型耐药基因(83.93%)、9株NDM-1型耐药基因(16.07%),未检出IMP、VIM以及OXA-48耐药基因;耐药性分析结果发现,KPC和NMD-1型耐药基因对氨曲南耐药性差异有统计学意义(P<0.05);KPC和NMD-1型耐药基因对应患者年龄、性别、收治科室、标本来源分布情况、合并基础疾病、抗菌药物使用时间、3种及以上抗菌药物联用史、住院时间以及侵入性操作比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 CRKP基因型主要以KPC型最常见,不同基因型CRKP临床特征无明显差异,不同基因型CRKP对常用抗菌药物耐药性存在异质性,临床抗感染治疗需结合基因检测及耐药性分析制定合理方案。

外科重症监护病房中铜绿假单胞菌耐药性及同源性分析

目的研究外科重症监护室(ICU)临床分离铜绿假单胞菌的耐药性及遗传相关性。方法收集本院于2007年3月至2008年3月的外科ICU住院病人非痰标本中的铜绿假单胞菌21株,采用琼脂2倍稀释法,测定铜绿假单胞菌对15种抗菌药物的敏感性;利用脉冲场凝胶电泳技术分析其遗传同源性。结果 21株铜绿假单胞菌对其中8种抗菌药物耐药率较高,耐药率均在57%以上;并且有2株对所测15种抗菌药物均耐药,属泛耐药细菌;21株铜绿假单胞菌中大多具有很高的同源性。结论外科ICU分离的铜绿假单胞菌对常用抗菌药物耐药率高,耐药情况严重,且大多来源于同一克隆。

碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌ST11菌株的基因组学特点分析

目的分析碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)ST11菌株的基因组学特点。方法挑取南京地区流行的3株CRKP-ST11菌株,提取基因组DNA,进行全基因组学测序,获得拼接后的全基因组。同时,从NCBI数据库中下载HS11286(中国上海)、JM45(中国杭州)、ATCC BAA-2146(美国/印度)的基因组为对照菌株,进行基因组GC碱基含量、单核苷酸多态性、亲缘关系及荚膜多糖(CPS)基因簇结构分析。结果CPS基因簇的G+C含量大多<50%,不同于染色体其他部分,是CRKP-ST11的主要单核苷酸多态性位点;进化树分析显示南京地区分离的3株CRKP-ST11菌株与上海、杭州的CRKP-ST11亲缘关系相近,与美国/印度的CRKP-ST11较远。这3株CRKP-ST11的CPS基因簇一致,与杭州、上海及美国/印度的3株CRKP-ST11菌株的差异主要在CPS可变区。结论CPS是CRKP-ST11的主要单核苷酸多态性位点,可能是CRKP-ST11菌株的主要进化区,CRKP-ST11的流行可能与CPS基因簇可变区有关,具有地域特点。

肠杆菌科细菌中耐药质粒分型技术的研究进展

质粒是染色体外能够自主复制的环状DNA分子,可以编码抗菌药物耐药基因、毒力基因等遗传信息,导致其宿主菌的耐药性和致病性的产生[1];也可以通过水平转移在相同或不同种属的细菌之间播散,易化了潜在的有利基因如抗菌药物耐药基因在细菌群体之间快速播散[2];此外,

尿培养肺炎克雷伯杆菌的耐药性及超广谱β-内酰胺酶基因型分型和整合子分析

目的分析尿培养肺炎克雷伯杆菌的耐药性和产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）的产生情况，并对产ESBLs的菌株进行基因型分型和整合子分析。方法收集2012年中段尿培养的肺炎克雷伯杆菌，对细菌的药敏结果使用WHO—NET5．6进行统计分析；细菌产ESBLs的情况经ESBLs表型确认方法筛选；blaTEM，blaSHV，blaCTX-M基因型及Ⅰ，Ⅱ，Ⅲ类整合子在产ESBI。S菌株中的流行性经聚合酶链反应（PCR）法和DNA测序法分析；Ⅰ类整合子在blaSHV，blaCTxlM，blaTEM三种基因阳性菌株中的分布差异使用皮尔森卡方检验进行分析。结果总体上，68株细菌对广谱青霉素、头孢呋辛及头孢噻肟均具有较高的耐药性，耐药率大于64％，对哌拉西林／他唑巴坦、阿米卡星及亚胺培南有较高的敏感性，耐药率在9．0％～15％之间；40株细菌产ESBLs．blaTEM，blaSHV和blaCTX-M分别在37（92．5％），29（72．5％）及26（65．0％）株细菌中分布；I类整合子存在于22（55．0％）株细菌中，在blasHV，blaCTX和blaTEM基因阳性菌株中的分布差异无统计学意义（χ^2=0．497，P=0．780）。结论blaTEM，blaSHV，blaCTXM和1类整合子在该院尿培养肺炎克雷伯杆菌广泛存在，使得临床抗感染治疗和院感控制面临巨大挑战。

碳青霉烯耐药大肠埃希菌的基因组学特点分析

目的分析碳青霉烯耐药大肠埃希菌(CREC)的基因组流行病学特征,调查共携带blaNDM和blaKPC的大肠埃希菌在南京鼓楼医院的流行情况,并分析该类细菌的播散特点。方法对2015年从南京6家医院收集的11株CREC菌株,进行全基因组测序组装后,分析耐药基因、毒力因子、多位点序列分型(MLST)、血清型和FimH型的分布并构建系统发育树。对于从南京鼓楼医院2013—2017年收集的CREC菌,使用PCR和DNA测序法筛选共携带blaNDM和blaKPC的菌株,脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)进行遗传相关性分析;接合试验分析基因的可转移性。结果所有的CREC都携带了至少1种碳青霉烯酶编码基因,其中,9株CREC细菌携带blaNDM-5,3株携带blaKPC-2,2株携带blaNDM-1,3株同时携带blaNDM-5和blaKPC-2。MLST分析发现7种不同的序列分型(ST),2株细菌为ST410,其余的6种ST型依次为ST3489、ST156、ST683、ST297、ST167和ST361;其次,11株细菌中鉴定出6种不同的血清型和8种Fim型;11株细菌的质粒图谱虽然呈多样性,但每株细菌都含有质粒复制子IncX3。系统发育分析表明,11个CREC分离株之间有很大的遗传多样性;PFGE显示6株共携带blaNDM和blaKPC的分离株之间也存在较大的遗传多样性。接合试验表明blaNDM可转移,但与blaKPC基因不在同一质粒。结论blaNDM是CREC中主要的碳青霉烯酶基因,blaNDM-5是主要的blaNDM基因,可能通过IncX3质粒水平传播。MLST、Fim分型、血清分型和进化树发育表明CREC呈遗传多样性。

血培养大肠埃希菌的药物敏感性分析及ESBLs编码基因的流行性分析

目的对2012年血培养分离121株大肠埃希茵的药物敏感性、产ESBLs情况及ESBLs编码基因blaCTX-M，bla-TEM和biaSHV的分布进行分析。方法收集2012年血培养非重复分离大肠埃希菌121株，使用wHONET5．6分析耐药性；采用双纸片协同法确认试验筛选产ESBLs菌；聚合酶链反应（PCR）法和DNA测序法分析产ESBLs茵中blaCTX—M，blaTEMt blasHV基因的流行性。结果121株大肠埃希菌对广谱青霉素和二，三代头孢菌素、左旋氧氟沙星及复方新诺明都有较高的耐药性，耐药率大于40％；对亚胺培南、哌拉西林／他唑巴坦、阿米卡星有较高的敏感性，耐药率小于12％；121株大肠埃希茵中，86（88．7％）株产ESBLs，blaCTX—M，blaTEM和biaSHV基因的检出率分别为59．5％（72），38．8％（47）及4．1％（5）株；其中，2（1．7％）株细菌同时携带blaCTX，blaTEM和blaSHV基因，30（24．8％）株细茵同时携带blaCTX和blaTEM基因，1（0．8％）株细菌同时携带blaSHV和blaTEM基因。结论南京鼓楼医院血培养大肠埃希菌大多产ESBLs，以bla（CTX-M-14）的流行为主，对大多数的青霉素类、头孢菌素和单环类等常用抗茵药物耐药治疗时应根据药敏结果选择抗茵药物。

产KPC-2肺炎克雷伯菌的基因分型、毒力基因和血清型特征研究

目的分析我院产KPC-2肺炎克雷伯菌基因分型、毒力基因和血清型特点。方法收集碳青霉烯类不敏感肺炎克雷伯菌菌株75株(采用改良Hodge试验和DNA测序以确定其表型和基因型)和同期分离的敏感株97株,脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析菌株间的同源性,PCR检测9种毒力基因all S、rmp A、mrk D、kfu BC、cf29a、fim H、uge、wab G、ure A和K1、K2、K5、K54、K57、K206种血清型。比较产KPC-2和非产KPC-2肺炎克雷伯菌的毒力基因和血清型差异。结果 75株碳青霉烯类不敏感肺炎克雷伯菌菌株中,有61株细菌经改良Hodge试验初筛为产碳青霉烯酶菌株,PCR扩增及DNA测序确定其为产KPC-2酶。PFGE结果显示,依据相似度80%的折点,产KPC-2酶组的61株细菌来源于30个克隆菌株,不产KPC-2酶组的111株肺炎克雷伯菌来源于96个克隆菌株。all S基因在不产KPC-2组中的阳性率(21.9%)高于在产KPC-2组的阳性率(3.3%),差异有统计学意义(P<0.05)。血清型K1、K2和K54在产KPC-2组与不产KPC-2组间的分布差异无统计学意义(P>0.05),其他3种血清型未检测到。结论产KPC-2肺炎克雷伯菌临床分离株携带的尿素酶基因all S减少,且大多不属于高致病性血清型,但作为高度耐药菌,应加强监控。

CIM和Carba NP筛选肠杆菌科细菌产碳青霉烯酶的比较

目的评估碳青霉烯类失活法(carbapenem inactivation method,CIM)和Carba NP对肠杆菌科细菌碳青霉烯酶表型筛选的能力。方法以PCR及测序技术检测菌株携带碳青霉烯酶相关基因结果为标准,评估CIM和Carba NP对75株耐碳青酶烯类抗生素肠杆菌科细菌及25株敏感菌株碳青霉烯酶表型筛选能力。结果 75株碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌中,CIM和Carba NP阳性菌株均为53株(70.67%);PCR检测碳青霉烯酶耐药基因阳性48株,阴性27株,其中blaKPC-2阳性29株,blaNDM-1阳性17株,同时携带blaKPC-2和blaNDM-12株。25株敏感菌株2种表型筛选试验均阴性,PCR未检出相关基因。与PCR检测结果相比较,CIM试验的一致率是87%,Kappa值为0.74;Carba NP试验的一致率是79%,Kappa值为0.58。结论 CIM试验简便、低成本,与测序方法具有较高的一致率,是碳青霉烯酶表型筛选的有效方法。

碳青霉烯耐药非产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的药物敏感性及分子特征分析

目的分析碳青霉烯耐药非产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌(carbapenem resistant Klebsiella pneumoniae without producing carbapenemase,CRKPPC)的抗菌药物敏感性、β-内酰胺酶基因和外排泵基因的分布及外排泵抑制剂的抑制作用。方法收集2012—2014年我院碳青霉烯不敏感肺炎克雷伯菌108株,用Mastdiscs combi Carba plus纸片系统检测碳青霉烯酶表型。用微量肉汤稀释法测定CRKPPC菌株对抗菌药物的敏感性;用PCR和DNA测序技术检测β-内酰胺酶耐药基因,包括超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum beta-lactamase,ESBL)和质粒介导的头孢菌素酶(Amp C)编码基因及外排泵基因acr AB-tolC、kex D、kde A、kpn EF和kpn GH;外排泵抑制剂羰基氰化物间氯苯腙(CCCP)和利血平抑制试验分析外排泵在碳青霉烯耐药中的作用;十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析细菌外膜孔蛋白Omp K35和Omp K36的表达。结果碳青霉烯不敏感肺炎克雷伯菌菌株中有26株细菌为CRKPPC;这26株细菌对β-内酰胺类药物高度耐药,对阿米卡星、庆大霉素、左氧氟沙星和环丙沙星的耐药率均较高,但对替加环素、多黏菌素、头孢他啶/阿维巴坦和氨曲南/阿维巴坦等有很好的敏感性; blaCTX-M和blaSHV检出率依次为76.9%和57.7%;外膜孔蛋白Omp K35和Omp K36均有不同程度的缺失,缺失率分别为57.7%和19.2%;80%以上的细菌中存在acr AB-tolC、kex D、kde A、kpn EF和kpn GH基因; CCCP对碳青霉烯类药物具有显著的抑制作用,而利血平没有明显的抑制作用。结论替加环素、多黏菌素可以作为CRKPPC联合用药的基础药物。CRKPPC菌株中存在Amp C、ESBLs及不同程度的外膜孔蛋白Omp K35和Omp K36缺失,但外排泵对碳青霉烯类药物的外排作用是CRKPPC对碳青霉烯耐药的主要机制,外排泵抑制剂可能在这种细菌引起的感染治疗中有重要价值。

高中英语写作教学策略探讨

听、说、读、写是高中英语教学的基本任务，其中的写一般就是指写作。而对于教师而言，英语写作教学就成为一个必须重点研究的任务。自从新课程改革推进以来，我们注意到写作教学日益成为高中英语教学的一个研究热点，这其中的原因是因为我们的英语教师越来越认识到写作教学是提高学生英语语言素养、增强学生英语进行表达能力的必由之路。

亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌外膜蛋白与外排泵基因adeB分析

目的了解耐亚胺培南鲍曼不动杆菌中外膜蛋白表达以及外排泵基因adeB的分布情况。方法收集该院2008年9月至2010年12月亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌65株,采用PCR方法扩增外膜蛋白CarO编码基因及外排泵adeB基因;聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析耐药菌与敏感菌外膜蛋白表达的差异。结果 65株菌均检出CarO编码基因与adeB基因,其中2株菌CarO编码基因上游存在ISAba1插入序列。SDS-PAGE显示,耐药菌株与敏感菌株在外膜蛋白上存在主要有大约24×103蛋白的缺失和48×103蛋白的高表达。结论外膜蛋白CarO和adeB基因在亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌中广泛存在,adeB基因的高表达以及外膜蛋白表达的差异是鲍曼不动杆菌对亚胺培南耐药的重要机制。

利奈唑胺耐药金黄色葡萄球菌耐药机制分析

目的调查临床分离金黄色葡萄球菌对利奈唑胺的耐药情况及耐药机制。方法用Vitek 2系统GP67卡对2019年1月至12月南京鼓楼医院临床分离905株金黄色葡萄球菌进行药敏试验,对检出的利奈唑胺耐药菌株用E-test法复测利奈唑胺最低抑菌浓度(MIC);用PCR扩增及测序技术分析利奈唑胺耐药决定基因cfr、optr A及23S rRNA基因V区;对菌株基因组DNA进行全基因组测序分析,对耐药基因、毒力基因进行生物信息学分析;用多位点序列分型(MLST)技术获得菌株ST分型。结果 905株金黄色葡萄球菌检出1株(0.1%)利奈唑胺耐药株(MIC为16 mg/L),该菌株除对万古霉素和复方磺胺甲噁唑敏感外,对其余常用抗菌药物均耐药。PCR及测序技术显示该菌株携带cfr基因,23S rRNA V区存在T2337G和C2370G核苷酸突变位点;全基因组序列分析显示基因组包含碱基数为2 949 411 bp,总基因数为3 023个,包含59个tRNA编码基因以及7个完整的rRNA基因编码操纵子,获得Gen Bank登录号JAANYO000000000,且该菌株携带包括cfr在内的多种耐药决定基因和毒力基因;MLST分型为新型ST5985。结论利奈唑胺耐药金黄色葡萄球菌临床分离率较低。检出由cfr基因和23S rRNA V区突变介导的新ST型利奈唑胺耐药株。

产CTX-M-14和CTX-M-15大肠埃希菌毒力基因分布差异

目的分析尿培养产CTX-M-14和产CTX-M-15大肠埃希菌毒力基因分布的差异。方法收集南京鼓楼医院2012年临床尿培养分离大肠埃希菌162株，双环协同试验检测超广谱β内酰胺酶（ESBLs）；采用PCR和DNA测序对CTX-M。编码基因及毒力基因iutA、ompT、fyuA、fdeC、fimH、traT、cvaC,pap、kpsMr、PAls、usp、aer、hlyA、cnf和chuA进行分析；用脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析产CTX-M-14和产CTX-M-15大肠埃希菌遗传相关性；将细菌分为产CTX-M-14和产CTX-M-15大肠埃希菌2组，统计学分析毒力基因在这2组之间的分布差异。结果162株大肠埃希菌中，126株产ESBLs，91株产CTX-M酶，其中blaCTX-M-14和blaCTX-M-15编码基因分别检出49株和36株。PFGE分析显示，产CTX-M酶大肠埃希菌具有遗传多样性。毒力基因iutA、fyuA、fimH、traT及chuA在2组中的检出率均较高（〉65％）；pap、kpsMV、ompT在2组中的检出率约为20％-60％；cvaC和PAls在2组中的检出率较低（〈20％）；毒力基因fedC在产CTX-M-14大肠埃希菌组中分布高于产CTX-M-15大肠埃希菌组（P=0．017）；未检出aeF、hlyA和cnf毒力基因。结论在尿培养大肠埃希菌中，产CTX-M-14菌株fedc毒力基因分布较产CTX-M-15菌株更高。

尿培养产CTX-M大肠埃希菌的种系分型及耐药和毒力特点分析

目的分析尿培养产CTX-M大肠埃希菌的种系分型，耐药及毒力特点，指导尿路感染的临床用药与控制医院感染。方法收集鼓楼医院2012年尿培养大肠埃希菌，纸片扩散法测定细菌的药物敏感性，双纸片法确定细菌产ESBLs的情况；PCR扩增CTX-M编码基因和毒力基因iutA，ompT，fyuA，fdeC，fimH，traT，cvaC，kpsMT，pap，pAI，usp和chuA；多重PCR分析产CTX—M大肠埃希菌的种系分型；采用肠杆菌属重复基因间隔共有序列-PCR（ERIC-PCR）对细菌进行遗传相关性分析；对比分析产CTX-M组和非产CTX-M组菌株在抗菌药物耐药性和毒力基因之间的差异。结果162株尿培养大肠埃希菌没有遗传相关性；126株ESBLs阳性菌株中，91株细菌产CTX-M，其中，57株产CTX-M大肠埃希菌属于D型，16株属于B2型。统计学分析发现，ESBLs阳性菌株中，产CTX-M组细菌的耐药率显著高于不产CTX-M组细菌（除亚胺培南外），毒力基因iutA，chuA和traT在产CTX—M细菌组中的流行显著高于非产CTX-M组，P值依次为：0．001，0．006和0．000。结论产CTX-M大肠埃希菌是鼓楼医院尿路感染的主要致病菌，大多属于D型，其耐药率显著增高，且与毒力基因iutA，chuA和traT密切相关，是尿路感染患者临床治疗的一个潜在威胁。