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河南地区新记录蝇种郭氏欧麻蝇形态和DNA条形码鉴定
被引量:
2
1
作者
高洁
张芳
+3 位作者
张勤
曹晓婉
王富昌
张卫东
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2020年第5期657-662,共6页
目的:应用形态学分类和DNA条形码技术对采自新郑机场口岸区域的蝇类样本进行种属鉴定。方法:提取蝇类后足的基因组DNA,用通用引物LCO1490/HCO2198扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段,测序后与NCBI和BOLD中的序列进行分析比...
目的:应用形态学分类和DNA条形码技术对采自新郑机场口岸区域的蝇类样本进行种属鉴定。方法:提取蝇类后足的基因组DNA,用通用引物LCO1490/HCO2198扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段,测序后与NCBI和BOLD中的序列进行分析比对,用Mega 7.0软件以邻接法、最大简约法、最大似然法和最小进化法构建系统发育树,并结合传统形态学方法鉴定该蝇类。结果:所获得DNA条形码序列与NCBI和BOLD中的郭氏欧麻蝇(Sarcophaga depressifrons)的序列相似度均为99.84%。结合形态学和分子生物学的鉴定结果,该蝇类标本为郭氏欧麻蝇,经查阅文献,确认为河南地区新记录蝇种;结论:郭氏欧麻蝇为河南地区新记录蝇种;应加强口岸检疫及监测力度,防止外来物种及传染病入侵。
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关键词
郭氏欧麻蝇
新记录
形态学鉴定
DNA条形码鉴定
河南
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职称材料
应用重组酶介导逆转录扩增技术快速登革病毒血清型鉴定
被引量:
2
2
作者
张勤
王永亮
+3 位作者
曹晓婉
左锋
邱英华
付玉和
《口岸卫生控制》
2020年第6期21-25,共5页
目的本研究建立了基于逆转录重组酶介导核酸扩增技术(RT-RAA)快速鉴定登革病毒血清型的方法。方法选取登革病毒基因组NS1基因片段分别设计DV I型、DVⅡ型、DVⅢ型和DVⅣ型引物和探针,建立登革病毒血清型鉴定RT-RAA检测方法,并分别对其...
目的本研究建立了基于逆转录重组酶介导核酸扩增技术(RT-RAA)快速鉴定登革病毒血清型的方法。方法选取登革病毒基因组NS1基因片段分别设计DV I型、DVⅡ型、DVⅢ型和DVⅣ型引物和探针,建立登革病毒血清型鉴定RT-RAA检测方法,并分别对其灵敏度、特异性和重复性进行测试。结果建立的方法检测时间短(<30min),与基孔肯雅病毒、黄热病毒、寨卡病毒、乙型脑炎病毒等黄病毒属病毒及DV不同血清型间无交叉反应,检测的灵敏度可达102copies/μl,试验的重复性好。结论建立的登革病毒血清型鉴定RT-RAA方法具有快速、特异以及灵敏的特点,为探究登革病毒是否本土化,确定登革病毒分子流行病学趋势提供技术支持。
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关键词
重组酶介导核酸扩增
登革病毒
血清型鉴定
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职称材料
乙脑病毒实时荧光重组酶介导逆转录扩增方法的建立
被引量:
2
3
作者
张勤
高洁
+3 位作者
张芳
邱英华
付玉和
曹晓婉
《中国国境卫生检疫杂志》
CAS
2020年第6期385-388,共4页
目的建立基于逆转录重组酶介导核酸扩增技术(RT-RAA)快速进行乙脑病毒(JEV)分型鉴定方法。方法根据乙脑病毒NS1基因设计通用型引物和探针,针对E基因分别设计Ⅰ型和Ⅲ型JEV特异性引物和探针,建立JEV RT-RAA检测方法,并分别对其灵敏度、...
目的建立基于逆转录重组酶介导核酸扩增技术(RT-RAA)快速进行乙脑病毒(JEV)分型鉴定方法。方法根据乙脑病毒NS1基因设计通用型引物和探针,针对E基因分别设计Ⅰ型和Ⅲ型JEV特异性引物和探针,建立JEV RT-RAA检测方法,并分别对其灵敏度、特异性和重复性进行测试。结果建立的方法检测时间短(<20 min),与登革病毒、基孔肯雅病毒、黄热病毒、寨卡病毒及无交叉反应,检测灵敏度可达100拷贝/μl,JEVⅠ检测体系的灵敏度可达10拷贝/μl;方法的重复性好。结论建立的JEV分型鉴定RT-RAA方法快速、特异、灵敏,适用于口岸现场JEV的快速检测。
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关键词
重组酶介导核酸扩增技术
乙脑病毒
基因型
原文传递
题名
河南地区新记录蝇种郭氏欧麻蝇形态和DNA条形码鉴定
被引量:
2
1
作者
高洁
张芳
张勤
曹晓婉
王富昌
张卫东
机构
郑州大学公共卫生学院流行病学教研室
郑州海关技术中心
河南捷信检测认证有限公司
出处
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2020年第5期657-662,共6页
基金
河南省重大科技专项(182102110220)。
文摘
目的:应用形态学分类和DNA条形码技术对采自新郑机场口岸区域的蝇类样本进行种属鉴定。方法:提取蝇类后足的基因组DNA,用通用引物LCO1490/HCO2198扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段,测序后与NCBI和BOLD中的序列进行分析比对,用Mega 7.0软件以邻接法、最大简约法、最大似然法和最小进化法构建系统发育树,并结合传统形态学方法鉴定该蝇类。结果:所获得DNA条形码序列与NCBI和BOLD中的郭氏欧麻蝇(Sarcophaga depressifrons)的序列相似度均为99.84%。结合形态学和分子生物学的鉴定结果,该蝇类标本为郭氏欧麻蝇,经查阅文献,确认为河南地区新记录蝇种;结论:郭氏欧麻蝇为河南地区新记录蝇种;应加强口岸检疫及监测力度,防止外来物种及传染病入侵。
关键词
郭氏欧麻蝇
新记录
形态学鉴定
DNA条形码鉴定
河南
Keywords
Sarcophaga depressifrons
new record
morphological identification
DNA barcoding molecular identification
Henan
分类号
R384.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
应用重组酶介导逆转录扩增技术快速登革病毒血清型鉴定
被引量:
2
2
作者
张勤
王永亮
曹晓婉
左锋
邱英华
付玉和
机构
郑州海关
天津海关
杭州众测生物科技有限公司
出处
《口岸卫生控制》
2020年第6期21-25,共5页
基金
原国家质检总局科技计划项目(2017IK309,2018IK035)。
文摘
目的本研究建立了基于逆转录重组酶介导核酸扩增技术(RT-RAA)快速鉴定登革病毒血清型的方法。方法选取登革病毒基因组NS1基因片段分别设计DV I型、DVⅡ型、DVⅢ型和DVⅣ型引物和探针,建立登革病毒血清型鉴定RT-RAA检测方法,并分别对其灵敏度、特异性和重复性进行测试。结果建立的方法检测时间短(<30min),与基孔肯雅病毒、黄热病毒、寨卡病毒、乙型脑炎病毒等黄病毒属病毒及DV不同血清型间无交叉反应,检测的灵敏度可达102copies/μl,试验的重复性好。结论建立的登革病毒血清型鉴定RT-RAA方法具有快速、特异以及灵敏的特点,为探究登革病毒是否本土化,确定登革病毒分子流行病学趋势提供技术支持。
关键词
重组酶介导核酸扩增
登革病毒
血清型鉴定
Keywords
Recombinase aid amplification
Denguevirus
Serotype detection
分类号
R512.8 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
乙脑病毒实时荧光重组酶介导逆转录扩增方法的建立
被引量:
2
3
作者
张勤
高洁
张芳
邱英华
付玉和
曹晓婉
机构
郑州海关
杭州众测生物科技有限公司
出处
《中国国境卫生检疫杂志》
CAS
2020年第6期385-388,共4页
基金
原国家质检总局科技计划项目(2017IK309,2018IK035)。
文摘
目的建立基于逆转录重组酶介导核酸扩增技术(RT-RAA)快速进行乙脑病毒(JEV)分型鉴定方法。方法根据乙脑病毒NS1基因设计通用型引物和探针,针对E基因分别设计Ⅰ型和Ⅲ型JEV特异性引物和探针,建立JEV RT-RAA检测方法,并分别对其灵敏度、特异性和重复性进行测试。结果建立的方法检测时间短(<20 min),与登革病毒、基孔肯雅病毒、黄热病毒、寨卡病毒及无交叉反应,检测灵敏度可达100拷贝/μl,JEVⅠ检测体系的灵敏度可达10拷贝/μl;方法的重复性好。结论建立的JEV分型鉴定RT-RAA方法快速、特异、灵敏,适用于口岸现场JEV的快速检测。
关键词
重组酶介导核酸扩增技术
乙脑病毒
基因型
Keywords
Recombinase aid amplification
Japanese encephalitis virus
Genotype
分类号
R183.5 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
河南地区新记录蝇种郭氏欧麻蝇形态和DNA条形码鉴定
高洁
张芳
张勤
曹晓婉
王富昌
张卫东
《郑州大学学报(医学版)》
CAS
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
2
应用重组酶介导逆转录扩增技术快速登革病毒血清型鉴定
张勤
王永亮
曹晓婉
左锋
邱英华
付玉和
《口岸卫生控制》
2020
2
下载PDF
职称材料
3
乙脑病毒实时荧光重组酶介导逆转录扩增方法的建立
张勤
高洁
张芳
邱英华
付玉和
曹晓婉
《中国国境卫生检疫杂志》
CAS
2020
2
原文传递
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