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极大似然法探测主基因的效能
被引量:
6
1
作者
黄蛟龙
曹致琦
+1 位作者
马海燕
张泽
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期133-137,共5页
采用 Monte Carlo模拟数据和极大似然法探测 F2 群体主基因 (MG)。研究了遗传力、显性比和样本容量三因素对探测 F2 群体 MG的影响。结果表明 :1)在主基因的被发现率上 ,三因素的影响力为 :遗传力 >样本容量 >显性比。当遗传力较...
采用 Monte Carlo模拟数据和极大似然法探测 F2 群体主基因 (MG)。研究了遗传力、显性比和样本容量三因素对探测 F2 群体 MG的影响。结果表明 :1)在主基因的被发现率上 ,三因素的影响力为 :遗传力 >样本容量 >显性比。当遗传力较小时 ,如 0 .3,即使样本容量高达 10 0 0 ,其发现能力也仅有 5 1.6 3% ;当遗传力大于 0 .5时 ,样本容量大于 30 0 ,MG的被发现率在 80 %以上。 2 )一般来说 ,一旦 MG被探测到 ,参数 d和 h估计的准确度均较高。并且 ,随着遗传力 h2b 和样本容量 c的增大 ,参数 d和 h估计的精度也随之提高。
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关键词
极大似然法
主基因探测
遗传力
样本容量
显性比
MONTECARLO模拟
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职称材料
用一个相对简单的方法来探测核苷酸替代模型的异质性(英文)
2
作者
黄蛟龙
曹致琦
+1 位作者
张泽
朱大海
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005年第10期1027-1036,共10页
对于可观察到的分子序列进化模型的不同,提出一个相对简单的方法——卡方检测,来检测在DNA序列间替代过程的同质性。这个卡方检测方法不管在座位间下列3个条件是否满足皆是成立的:(1)替代率的异质性;(2)进化率/模型的相关性;(3)替代模...
对于可观察到的分子序列进化模型的不同,提出一个相对简单的方法——卡方检测,来检测在DNA序列间替代过程的同质性。这个卡方检测方法不管在座位间下列3个条件是否满足皆是成立的:(1)替代率的异质性;(2)进化率/模型的相关性;(3)替代模型的变异。计算机模拟也显示出卡方检测在各种生物学条件下的序列进化模型是非常有效的。在真实数据中,11种节肢动物线粒体DNA的比较中发现,水蚤或卤虫与其他9种节肢动物以高百分比违背了同质性进化模型假设,显然是由于AT含量高而引起的,且在两种蚊子的线粒体DNA比较中发现,其满足同质性假设仅有7.69%。还比较了卡方检测与KumarandGadagkar的ID检测之间的效能差异:在较为复杂的模型下,卡方检测效率在许多情况下较ID检测方法略高;并且在犯I-型错误以及卡方测验的效率曲线中清楚地表明我们的方法是保守的,而Kumar等的方法是不保守的。
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关键词
同质性
替代模型
卡方检测
效能
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职称材料
高等农业院校数学教学体系改革创新与实践
3
作者
黄燕苹
何世芬
+2 位作者
曹致琦
刘铁
李春
《农业教育研究(西南)》
2005年第2期42-44,共3页
1、成果主要内容 高等学校的数学课程如何适应高等教育事业和学科交叉融合的需要,做到按需施教、因材施教,是摆在各类高等院校面前的重要改革课题。本项目从构建高等农科数学教学体系的角度,进行了课题研究、教材建设、题库构建等...
1、成果主要内容 高等学校的数学课程如何适应高等教育事业和学科交叉融合的需要,做到按需施教、因材施教,是摆在各类高等院校面前的重要改革课题。本项目从构建高等农科数学教学体系的角度,进行了课题研究、教材建设、题库构建等一系列的改革创新,并通过实践证明走出了有效的探索之路。取得如下成绩:
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关键词
改革创新
数学课程
教学体系
高等农业院校
实践
高等教育事业
课题研究
交叉融合
高等学校
按需施教
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职称材料
题名
极大似然法探测主基因的效能
被引量:
6
1
作者
黄蛟龙
曹致琦
马海燕
张泽
机构
西南农业大学农学系
西南农业大学基础科技学院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期133-137,共5页
基金
教育部留学回国人员科研启动基金资助项目 (教外司留 [2 0 0 1] 3 45号 )
文摘
采用 Monte Carlo模拟数据和极大似然法探测 F2 群体主基因 (MG)。研究了遗传力、显性比和样本容量三因素对探测 F2 群体 MG的影响。结果表明 :1)在主基因的被发现率上 ,三因素的影响力为 :遗传力 >样本容量 >显性比。当遗传力较小时 ,如 0 .3,即使样本容量高达 10 0 0 ,其发现能力也仅有 5 1.6 3% ;当遗传力大于 0 .5时 ,样本容量大于 30 0 ,MG的被发现率在 80 %以上。 2 )一般来说 ,一旦 MG被探测到 ,参数 d和 h估计的准确度均较高。并且 ,随着遗传力 h2b 和样本容量 c的增大 ,参数 d和 h估计的精度也随之提高。
关键词
极大似然法
主基因探测
遗传力
样本容量
显性比
MONTECARLO模拟
Keywords
Detecting major gene
Maximum likelihood
Heritability
Sample size
Domiance ratio
Monte Carlo simulation
Power
分类号
S33 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
用一个相对简单的方法来探测核苷酸替代模型的异质性(英文)
2
作者
黄蛟龙
曹致琦
张泽
朱大海
机构
哈尔滨工业大学生命科学与工程系
西南农业大学基础科学与技术学院
西南农业大学农业与生命科学学院
School of Biosciences
中国医学科学院
出处
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005年第10期1027-1036,共10页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(编号:2001AA222031)
国家杰出青年科学基金资助项目(编号:300250)~~
文摘
对于可观察到的分子序列进化模型的不同,提出一个相对简单的方法——卡方检测,来检测在DNA序列间替代过程的同质性。这个卡方检测方法不管在座位间下列3个条件是否满足皆是成立的:(1)替代率的异质性;(2)进化率/模型的相关性;(3)替代模型的变异。计算机模拟也显示出卡方检测在各种生物学条件下的序列进化模型是非常有效的。在真实数据中,11种节肢动物线粒体DNA的比较中发现,水蚤或卤虫与其他9种节肢动物以高百分比违背了同质性进化模型假设,显然是由于AT含量高而引起的,且在两种蚊子的线粒体DNA比较中发现,其满足同质性假设仅有7.69%。还比较了卡方检测与KumarandGadagkar的ID检测之间的效能差异:在较为复杂的模型下,卡方检测效率在许多情况下较ID检测方法略高;并且在犯I-型错误以及卡方测验的效率曲线中清楚地表明我们的方法是保守的,而Kumar等的方法是不保守的。
关键词
同质性
替代模型
卡方检测
效能
Keywords
homogeneity
substitution model
χ^2 test
power
分类号
Q524 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
高等农业院校数学教学体系改革创新与实践
3
作者
黄燕苹
何世芬
曹致琦
刘铁
李春
机构
基础科技学院
出处
《农业教育研究(西南)》
2005年第2期42-44,共3页
文摘
1、成果主要内容 高等学校的数学课程如何适应高等教育事业和学科交叉融合的需要,做到按需施教、因材施教,是摆在各类高等院校面前的重要改革课题。本项目从构建高等农科数学教学体系的角度,进行了课题研究、教材建设、题库构建等一系列的改革创新,并通过实践证明走出了有效的探索之路。取得如下成绩:
关键词
改革创新
数学课程
教学体系
高等农业院校
实践
高等教育事业
课题研究
交叉融合
高等学校
按需施教
分类号
G633.6 [文化科学—教育学]
F719.3 [经济管理—产业经济]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
极大似然法探测主基因的效能
黄蛟龙
曹致琦
马海燕
张泽
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
6
下载PDF
职称材料
2
用一个相对简单的方法来探测核苷酸替代模型的异质性(英文)
黄蛟龙
曹致琦
张泽
朱大海
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005
0
下载PDF
职称材料
3
高等农业院校数学教学体系改革创新与实践
黄燕苹
何世芬
曹致琦
刘铁
李春
《农业教育研究(西南)》
2005
0
下载PDF
职称材料
已选择
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