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儿童社区获得性肺炎病例病原谱分析
被引量:
6
1
作者
黄小燕
东建亭
曾宪鍫
《分子诊断与治疗杂志》
2023年第1期14-17,共4页
目的 分析珠海市金湾区2018至2019年儿童社区获得性肺炎病例的病原体谱结果,总结病原流行病学特征,为新发病例的诊治提供依据。方法 回顾性分析2018年12月至2019年11月在珠海市金湾区住院,符合儿童社区获得性肺炎诊断的805例患儿咽拭子...
目的 分析珠海市金湾区2018至2019年儿童社区获得性肺炎病例的病原体谱结果,总结病原流行病学特征,为新发病例的诊治提供依据。方法 回顾性分析2018年12月至2019年11月在珠海市金湾区住院,符合儿童社区获得性肺炎诊断的805例患儿咽拭子标本,通过多重PCR和Luminex液相芯片杂交进行13种呼吸道病原体的核酸检测,对结果按照患儿年龄进行分组统计分析,各分组年龄区间为0~6月龄、6~12月龄、1~3周岁、3~7周岁、7周岁以上。结果 580例患儿咽拭子的病原体核酸检测为阳性;235例患儿检出两或以上病原体核酸阳性;检出率最高的前3种病原体分别是肺炎链球菌(SP)、呼吸道合胞病毒(RSV)和肺炎支原体(MP)。RSV在1岁以下低龄患儿中常见;ADV和MP在1岁以上患儿中检出率更高;其他病原体在各年龄组段分布比较平均。大多数季节特异的病原体如SP、HRV、MC、ADV、RSV检出高峰在春季(1~3月份)和冬季(10~12月),但也有少部分如Hi和MP有独立的流行规律,在非检出高峰时段流行。结论 在临床诊断和治疗中,应注意病原体流行的季节性变化、不同年龄组常见病原体的差异以及多种病原体的感染。
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关键词
多重PCR
液相芯片杂交技术
儿童社区获得性肺炎
病原体
儿童
下载PDF
职称材料
2011—2015年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析
被引量:
4
2
作者
梁丽君
倪汉忠
+6 位作者
张欣
曾宪鍫
邹丽容
李来庆
宋颖超
黄平
武婕
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期900-904,共5页
目的揭示2011-2015年广东地区甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因进化特征和变异特点。方法采用时空抽样方法抽样,测定2011—2015年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列,同时检索全球HA序列作为对照,采用MEGA5.05、BEAST v1.7.0和BioEdit7.1...
目的揭示2011-2015年广东地区甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因进化特征和变异特点。方法采用时空抽样方法抽样,测定2011—2015年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列,同时检索全球HA序列作为对照,采用MEGA5.05、BEAST v1.7.0和BioEdit7.1.3软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析。结果广东48株H3N2流感病毒的HA序列核苷酸同源性为96.4%-100.00%,2013-2015年广东H3N2亚型流感病毒HA基因与南半球疫苗株A/Switzerland/9715293/2013的同源性为97.8%~98.7%,抗原性较为接近。序列系统进化分析显示,其进化规律都是沿着树枝主干随着时间推移向上延伸,广东毒株主要分布在3C.3a分支,2015年部分毒株出现在3C.2a分支。2011—2015年HA基因共出现116个氨基酸位点突变,其中12个氨基酸位点突变涉及4个抗原表位,N241D(N225D)和K192C突变发生在受体结合部位和其中的190螺旋区内。结论2011-2015年广东甲型H3N2毒株HA抗原变异明显,抗原变异的积累可能出现抗原漂移和流感暴发,应该加强流感病原学监测,及时发现新的流感变异株,为流感防控和降低流感对公众健康危害提供科学依据。
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关键词
流感病毒
H3N2亚型
血凝素
进化
原文传递
题名
儿童社区获得性肺炎病例病原谱分析
被引量:
6
1
作者
黄小燕
东建亭
曾宪鍫
机构
广东省人民医院珠海医院(珠海市金湾中心医院)检验科
广东省人民医院珠海医院(珠海市金湾中心医院)儿科
广州达安临床检验中心
出处
《分子诊断与治疗杂志》
2023年第1期14-17,共4页
文摘
目的 分析珠海市金湾区2018至2019年儿童社区获得性肺炎病例的病原体谱结果,总结病原流行病学特征,为新发病例的诊治提供依据。方法 回顾性分析2018年12月至2019年11月在珠海市金湾区住院,符合儿童社区获得性肺炎诊断的805例患儿咽拭子标本,通过多重PCR和Luminex液相芯片杂交进行13种呼吸道病原体的核酸检测,对结果按照患儿年龄进行分组统计分析,各分组年龄区间为0~6月龄、6~12月龄、1~3周岁、3~7周岁、7周岁以上。结果 580例患儿咽拭子的病原体核酸检测为阳性;235例患儿检出两或以上病原体核酸阳性;检出率最高的前3种病原体分别是肺炎链球菌(SP)、呼吸道合胞病毒(RSV)和肺炎支原体(MP)。RSV在1岁以下低龄患儿中常见;ADV和MP在1岁以上患儿中检出率更高;其他病原体在各年龄组段分布比较平均。大多数季节特异的病原体如SP、HRV、MC、ADV、RSV检出高峰在春季(1~3月份)和冬季(10~12月),但也有少部分如Hi和MP有独立的流行规律,在非检出高峰时段流行。结论 在临床诊断和治疗中,应注意病原体流行的季节性变化、不同年龄组常见病原体的差异以及多种病原体的感染。
关键词
多重PCR
液相芯片杂交技术
儿童社区获得性肺炎
病原体
儿童
Keywords
Multiplex PCR
Liquid chip technology
Community acquired pneumonia
Pathogens
Children
分类号
R725.6 [医药卫生—儿科]
下载PDF
职称材料
题名
2011—2015年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析
被引量:
4
2
作者
梁丽君
倪汉忠
张欣
曾宪鍫
邹丽容
李来庆
宋颖超
黄平
武婕
机构
广东省疾病预防控制中心
广州优迪生物科技有限公司
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第12期900-904,共5页
基金
广东省医学科学技术研究基金(A2012078)
广州市科技计划项目(2013J4200020,2014J4100091)
广东省科技计划项目(2013B020307006)
文摘
目的揭示2011-2015年广东地区甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因进化特征和变异特点。方法采用时空抽样方法抽样,测定2011—2015年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列,同时检索全球HA序列作为对照,采用MEGA5.05、BEAST v1.7.0和BioEdit7.1.3软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析。结果广东48株H3N2流感病毒的HA序列核苷酸同源性为96.4%-100.00%,2013-2015年广东H3N2亚型流感病毒HA基因与南半球疫苗株A/Switzerland/9715293/2013的同源性为97.8%~98.7%,抗原性较为接近。序列系统进化分析显示,其进化规律都是沿着树枝主干随着时间推移向上延伸,广东毒株主要分布在3C.3a分支,2015年部分毒株出现在3C.2a分支。2011—2015年HA基因共出现116个氨基酸位点突变,其中12个氨基酸位点突变涉及4个抗原表位,N241D(N225D)和K192C突变发生在受体结合部位和其中的190螺旋区内。结论2011-2015年广东甲型H3N2毒株HA抗原变异明显,抗原变异的积累可能出现抗原漂移和流感暴发,应该加强流感病原学监测,及时发现新的流感变异株,为流感防控和降低流感对公众健康危害提供科学依据。
关键词
流感病毒
H3N2亚型
血凝素
进化
Keywords
Influenza virus
H3N2 subtype
Hemagglutinin
Evolution
分类号
R511.7 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
儿童社区获得性肺炎病例病原谱分析
黄小燕
东建亭
曾宪鍫
《分子诊断与治疗杂志》
2023
6
下载PDF
职称材料
2
2011—2015年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析
梁丽君
倪汉忠
张欣
曾宪鍫
邹丽容
李来庆
宋颖超
黄平
武婕
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
4
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