油棕植物激素相关基因的生物信息学分析

油棕(Elaeis guineensis Jacq.)享有"世界油王"的称誉,油棕中果皮的棕榈油(Palm oil)含量非常丰富,占干重的80%。众所周知,赤霉素(gibberellins,GAs)、生长素(Auxin)和乙烯(Ethane)是分布较广的植物激素,参与多种植物的油脂代谢和脂肪酸积累过程,且这3种激合成相关基因素在油棕中的研究鲜有报道。基于前期对非洲油棕果壳转录组基础上,本研究针对油棕赤霉素相关基因EgGA20ox 1-D和EgGA20ox 2,生长素相关基因EgYUC1和乙烯相关基因EgACS,进行生物信息学分析及生物学功能预测。结果发现,EgGA20ox1-D、EgGA20ox 2、Eg YUC1和EgACS蛋白均为疏水性蛋白,且具有多个功能位点(糖基化位点和磷酸化位点)。除了EgYUC1蛋白有2个跨膜结构区外,其余无跨膜结构区。此外,这四类蛋白二级结构的主要元件为无规则卷曲和α螺旋。该研究结果对深入解析油棕这3类植物激素相关基因在油脂代谢中的功能及其调控机理提供科学参考。