目的探索miRNA-155对急性髓系白血病患者预后影响及可能分子机制。方法下载TCGA数据库中急性髓系白血病患者的miRNA和RNA表达谱及临床数据,按照miRNA-155表达水平高低排序,将前50%分为高表达组(n=81),剩余为低表达组(n=81),比较两组患...目的探索miRNA-155对急性髓系白血病患者预后影响及可能分子机制。方法下载TCGA数据库中急性髓系白血病患者的miRNA和RNA表达谱及临床数据,按照miRNA-155表达水平高低排序,将前50%分为高表达组(n=81),剩余为低表达组(n=81),比较两组患者生存时间,将患者各RNA表达水平逐一与miRNA-155表达水平进行Pearson相关性检测,根据相关系数分别选取与miRNA-155正相关和负相关的前50个基因,使用STRING工具完成KEGG通路和GO富集分析,并构建蛋白相互作用网络。结果miRNA-155低表达组中位生存时间高于miRNA-155高表达组,差异有统计学意义(609 d vs 485 d,P<0.05)。在检测的19448个基因中,21号染色体开放阅读框71(C21orf71)与miRNA-155正相关系数最高(r=0.634,P<0.05);溶质载体家族13成员5(SLC13A5)与miRNA-155负相关系数最高(r=-0.50,P<0.05)。GO富集分析和KEGG通路富集分析可见,相关基因主要涉及的生物学过程包括DNA复制启动与DNA链延伸;主要涉及的分子功能为解旋酶活性和作用于DNA的催化活性;主要涉及的细胞组分为微染色体维持复合体和三级颗粒;主要涉及的信号通路为DNA复制和细胞周期调控。微小染色体维持蛋白(MCM)基因家族是处于蛋白相互作用网络的核心。结论miRNA-155过表达与远期生存率降低有关,这可能与其调控细胞DNA复制有关。展开更多
文摘目的探索miRNA-155对急性髓系白血病患者预后影响及可能分子机制。方法下载TCGA数据库中急性髓系白血病患者的miRNA和RNA表达谱及临床数据,按照miRNA-155表达水平高低排序,将前50%分为高表达组(n=81),剩余为低表达组(n=81),比较两组患者生存时间,将患者各RNA表达水平逐一与miRNA-155表达水平进行Pearson相关性检测,根据相关系数分别选取与miRNA-155正相关和负相关的前50个基因,使用STRING工具完成KEGG通路和GO富集分析,并构建蛋白相互作用网络。结果miRNA-155低表达组中位生存时间高于miRNA-155高表达组,差异有统计学意义(609 d vs 485 d,P<0.05)。在检测的19448个基因中,21号染色体开放阅读框71(C21orf71)与miRNA-155正相关系数最高(r=0.634,P<0.05);溶质载体家族13成员5(SLC13A5)与miRNA-155负相关系数最高(r=-0.50,P<0.05)。GO富集分析和KEGG通路富集分析可见,相关基因主要涉及的生物学过程包括DNA复制启动与DNA链延伸;主要涉及的分子功能为解旋酶活性和作用于DNA的催化活性;主要涉及的细胞组分为微染色体维持复合体和三级颗粒;主要涉及的信号通路为DNA复制和细胞周期调控。微小染色体维持蛋白(MCM)基因家族是处于蛋白相互作用网络的核心。结论miRNA-155过表达与远期生存率降低有关,这可能与其调控细胞DNA复制有关。