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利什曼原虫感染树突状细胞早期基因表达差异分析及关键基因筛选
1
作者
余鹏
宋咏刚
+7 位作者
黄卓
闵海
黄江涛
张世超
陈晋
胡祖权
王赟(
指导
)
曾柱
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期13-20,共8页
目的:分析利什曼原虫感染树突状细胞(DCs)早期的基因表达与信号通路变化,探究DCs感染后应答,寻找利什曼原虫感染后基于DCs的免疫治疗方法。方法:GEO数据库下载利什曼原虫感染前后DCs基因芯片数据,RStudio软件筛选差异表达基因(DEGs),STR...
目的:分析利什曼原虫感染树突状细胞(DCs)早期的基因表达与信号通路变化,探究DCs感染后应答,寻找利什曼原虫感染后基于DCs的免疫治疗方法。方法:GEO数据库下载利什曼原虫感染前后DCs基因芯片数据,RStudio软件筛选差异表达基因(DEGs),STRING构建DEGs蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscape筛选差异表达蛋白质的核心模块,RStudio软件对DEGs进行GO和KEGG富集分析。结果:共筛选出DEGs 129个,其中IL12B与CXCL10差异最为显著,GO分析共富集23个过程,主要涉及病毒感染过程相关细胞反应及Ⅰ-IFN相关免疫反应;KEGG分析共富集3条信号通路,分别为甲型流感、麻疹及DNA复制信号通路。结论:利什曼原虫感染DCs前后Ⅰ-IFN信号通路和TLR4/NF-κB信号通路激活,影响IL12表达,提示Ⅰ-IFN/IL12信号通路与TLR4/NF-κB/IL12信号通路可作为利什曼原虫感染治疗的靶点,CXCL10也有望成为潜在的治疗靶点;利什曼原虫感染后,出现类似病毒感染现象,推测抗病毒免疫疗法可能在对抗利什曼原虫感染中具有一定疗效。
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关键词
利什曼原虫
树突状细胞
生物信息学
基因芯片
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职称材料
题名
利什曼原虫感染树突状细胞早期基因表达差异分析及关键基因筛选
1
作者
余鹏
宋咏刚
黄卓
闵海
黄江涛
张世超
陈晋
胡祖权
王赟(
指导
)
曾柱
(
指导
)
机构
贵州医科大学基础医学院
贵阳市妇幼保健院优生遗传科
贵州医科大学生物与工程学院
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期13-20,共8页
基金
国家自然科学基金(31771014,11762006,31860262,21906036)
贵州省科技计划项目(黔科合基础[2018]1412号,[2020]1Y091号,黔科合平台人才[2016]5676号,[2017]5718号,[2018]5779-54号,黔科合支撑[2019]2787号)资助。
文摘
目的:分析利什曼原虫感染树突状细胞(DCs)早期的基因表达与信号通路变化,探究DCs感染后应答,寻找利什曼原虫感染后基于DCs的免疫治疗方法。方法:GEO数据库下载利什曼原虫感染前后DCs基因芯片数据,RStudio软件筛选差异表达基因(DEGs),STRING构建DEGs蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscape筛选差异表达蛋白质的核心模块,RStudio软件对DEGs进行GO和KEGG富集分析。结果:共筛选出DEGs 129个,其中IL12B与CXCL10差异最为显著,GO分析共富集23个过程,主要涉及病毒感染过程相关细胞反应及Ⅰ-IFN相关免疫反应;KEGG分析共富集3条信号通路,分别为甲型流感、麻疹及DNA复制信号通路。结论:利什曼原虫感染DCs前后Ⅰ-IFN信号通路和TLR4/NF-κB信号通路激活,影响IL12表达,提示Ⅰ-IFN/IL12信号通路与TLR4/NF-κB/IL12信号通路可作为利什曼原虫感染治疗的靶点,CXCL10也有望成为潜在的治疗靶点;利什曼原虫感染后,出现类似病毒感染现象,推测抗病毒免疫疗法可能在对抗利什曼原虫感染中具有一定疗效。
关键词
利什曼原虫
树突状细胞
生物信息学
基因芯片
Keywords
Leishmania
Dendritic cells
Bioinformatics
GeneChip
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利什曼原虫感染树突状细胞早期基因表达差异分析及关键基因筛选
余鹏
宋咏刚
黄卓
闵海
黄江涛
张世超
陈晋
胡祖权
王赟(
指导
)
曾柱
(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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