新视角——质子泵抑制剂及其体外抑制幽门螺杆菌作用研究进展

胃质子泵H+-K+ATP酶的发现,为抗胃酸分泌新药的研究提供了新的可能。从1988年第一个质子泵抑制剂奥美拉唑问世,经10多年来的临床应用,已成为一类疗效高、耐受性好、副作用少的抗酸药物和联合治疗幽门螺杆菌感染的药物。由于奥美拉唑的巨大成功,推动了其衍生物的研究开发,新的质子泵抑制剂药品陆续上市。本文对质子泵、质子泵抑制剂及其作用特点以及质子泵抑制剂对幽门螺杆菌的抑制机制研究进展进行简要综述。

吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌WLAX基因序列分析

目的了解吉兰-巴雷综合征(GBS)相关空肠弯曲菌的WLAX基因序列特征,为进一步研究GBS相关空肠弯曲菌的分子致病机制打下基础。方法通过PCR方法对该基因进行扩增,将PCR产物克隆到质粒载体上,然后进行测序,将测序结果通过DNAstar软件进行比较和聚类分析。结果与非GBS相关空肠弯曲菌比较,GBS相关空肠弯曲菌的WLAX核苷酸序列发生变异的频率增大;菌株的核苷酸序列与全基因测序空肠弯曲菌NCTC11168比较存在差异;聚类关系反映了空肠弯曲菌具有一定的区域特征。结论GBS相关空肠弯曲菌中WLAX基因发生突变的概率明显增大,这些突变与GBS致病性的关系有待于进一步确定。

肠道常见病原菌检测基因芯片的制备与评价

目的建立并评价快速准确地检测肠道致病菌的基因芯片检测方法。方法在基因芯片制备基础上,通过对靶基因的扩增、杂交和对杂交结果的分析,对常见肠道致病菌的检测和鉴定效果进行评价。结果应用包含38种特异性探针的基因芯片,对涉及沙门菌、志贺菌、霍乱弧菌、致泻性大肠埃希菌、空肠弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌、副溶血弧菌和单核细胞李斯特菌等8个菌属的16株致病菌进行检测,均得到特异性杂交图谱。结论制备的基因芯片能够同时检测多种重要的肠道致病菌,为肠道致病菌感染的快速诊断提供了准确、快速、灵敏的方法。

转染试剂及幽门螺杆菌对AGS细胞形态的影响

目的:探讨不同的转染试剂对AGS细胞形态的影响,观察这些转染试剂能否像幽门螺杆菌那样引起AGS细胞蜂鸟状改变．方法:用多聚阳离子转染试剂(多聚乙酰亚胺、梭华-Sofast)和改良的脂类转染试剂 (Effectene Transfection Reagent)分别转染AGS 细胞,观察细胞形态的变化．用幽门螺杆菌 26695菌株攻击AGS细胞,观察细胞形态的变化并与经转染试剂作用的细胞进行形态比较．结果:幽门螺杆菌攻击后4 h能引起AGS细胞发生蜂鸟状改变．两种多聚阳离子转染试剂也均能引起AGS细胞发生蜂鸟状改变,与幽门螺杆菌引起的细胞形态改变相似,大部分细胞拉长,并且不受是否转染DNA的影响．此种变化在转染4 h时便出现,与试剂剂量的增加呈正相关．当PEI的剂量为10 μL时,细胞出现凋亡,15μL时凋亡加重．改良的脂类转染试剂对 AGS细胞的形态未产生影响．结论:在研究引起AGS细胞形态改变的因素时,不宜选择多聚阳离子转染试剂;多聚阳离子引起的AGS细胞形态改变与幽门螺杆菌引起的AGS细胞形态改变之间是否存在关系值得进一步研究．

幽门螺杆菌cagA基因及蛋白序列多态性分析

目的:结合本实验室研究结果,充分利用NCBI的核酸和蛋白数据库中检索到的CagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列,分析其序列特征以及与地域和疾病的相关性. 方法:利用Vector NTI Suite 9.0,ClastalX(version 1.8), Phylip(version 3.5)和Treeview(version 1.61)软件对检索到的幽门螺杆菌CagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列进行多序列比较和系统发育分析. 结果:检索到可以利用的全序列44条,部分序列560条. 通过44条全序列比对,相似性分析和构建系统进化树, 发现CagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列可分为具有明显地域特征的东西方两类.通过44条CagA全序列和266条C端部分序列分析,发现C端相对多变区的重复序列可分为两类:第一类为菌株共有的不连续重复序列,第二类为个别菌株特有的连续重复序列,此类重复序列包含EPIYA模体的重复.序列特征与疾病的关系分析表明,非胃癌株中包含第二类重复序列的菌株占13%(9/71),胃癌株中包含第二类重复序列的菌株占31%(12/39),),X2检验P=0.021<0.05, 故可以认为胃癌株中包含第二类重复序列出现率高于非胃癌株,可以认为包含第二类重复序列的菌株与胃癌有关. 结论:幽门螺杆菌CagA基因及蛋白序列多态性明显,具有东西方两个地域聚类特征,重复序列可分为两类.第二类重复序列中包含EPIYA模体的重复可能导致菌株致病性增强.

重要肠道病原菌多重PCR-基因芯片检测方法研究

目的:建立并初步评价一种针对重要肠道病原菌的多重PCR-基因芯片检测方法。方法:对筛选出的特异引物进行多重PCR优化,将引物分别按种属内混合和种属间混合的方案排查引物间的竞争性抑制现象,再将不同菌属的模板混合,用相对应的混合引物扩增,探寻高效特异的引物组合。分别掺入和不掺入荧光素,验证其对混合PCR反应的影响,并与芯片杂交,探寻多重PCR扩增效率对芯片杂交的影响。分析不同数量引物组合产生的杂交结果,筛选出无交叉反应的最优引物组合。结果:种属内引物混合均得到特异性扩增结果。种属间混合霍乱弧菌和空肠弯曲菌得到部分预期条带,随着混合引物数量的增加,交叉抑制现象也增多。杂交信号强度随多重PCR扩增效率的增加而增强。反应中掺入荧光素的扩增条带产量低于无荧光素的产物。可将35对混合引物拆成3个体系分别标记样品,以避免假阴性结果。结论:PCR反应中掺入荧光素降低扩增效率和杂交效率,但并不影响对杂交结果的判读和数据分析。基因芯片杂交信号强度取决于多重PCR的扩增效率。肠道病原菌多重PCR-基因芯片检测方法具有较高的特异性,混合PCR可以分别按照种属内和种属间的引物组合方案用于多病原的筛检。该基因芯片检测可以采用3个引物体系完成样品标记。

霍乱弧菌山梨醇发酵相关基因序列特征分析

目的比较霍乱弧菌流行株与非流行株山梨醇发酵相关基因的差异,为采用分子生物学方法快速区分两类菌株提供理论依据。方法采用基因测序的方法,分别对42株霍乱弧菌(O1群埃尔托型33株、O139群9株)流行株和非流行株的糖发酵激活蛋白、外周质麦芽糖结合蛋白、外周质磷酸盐结合蛋白和外周质氨基酸结合蛋白编码基因进行序列比较。结果糖发酵激活蛋白编码基因在霍乱弧菌流行株与非流行株共发现三个位置有单个碱基的差异,即第106、150和378位核苷酸(在流行株分别为A、A和T,而在非流行株分别为G、G和C)。第106位碱基的差异导致了氨基酸的不同(编码蛋白的第36个氨基酸在流行株和非流行株分别为苏氨酸和丙氨酸)。外周质麦芽糖结合蛋白和外周质磷酸盐结合蛋白编码基因各发现两个碱基的规律变化,外周质氨基酸结合蛋白编码基因未发现一致性碱基改变。结论在这些基因中存在着多个单核苷酸多态性,可能会成为快速区分两类菌株的重要依据。糖发酵激活蛋白第36位氨基酸的改变,可能会引起该蛋白活性的改变。