铁椆与红菇提取液抑菌作用的比较

研究铁椆树根、铁椆果仁与红菇子实体的抑菌效果。以80%乙醇为提取剂,运用超声波技术分别制备铁椆树根、铁椆果仁、红菇子实体提取液,测定它们在一定质量浓度范围内对大肠杆菌(Escherichia coli)、藤黄微球菌(Micrococcus lueus)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、产气气杆菌(Aerobacter aerogenns)、卡尔伯斯酵母(Karlperth yeast)、阿达青霉(Penicillium adametzi Zaleski)6种供试菌种的抑菌作用,并对其大小进行比较。结果发现:在测试质量浓度范围内,3种测试提取液对大肠杆菌、藤黄微球菌、卡尔伯斯酵母均有抑制作用,其中对大肠杆菌、藤黄微球菌抑制作用比较明显,且随质量浓度升高抑菌作用增强;抑菌效果为铁椆树根>铁椆果仁>红菇子实体。研究表明,铁椆树根、铁椆果仁和红菇子实体3种提取液对不同菌种的抑菌作用有一定的选择性,抑菌效果顺序为铁椆树根最好、铁椆果仁次之,且抑菌效果在2.0g/mL质量浓度条件下较好。

广西单核细胞增生李斯特菌的流行率、毒力特征和分子分型研究

目的比较广西不同种类食品中单核细胞增生李斯特菌(以下简称单增李斯特菌)的流行情况、毒力特征和分子分型特征,更好地了解单增李斯特菌的遗传特点及其传播的潜力。方法对来自2002—2020年的210株单增李斯特菌进行全基因组测序(WGS),分析其序列分型(ST)、克隆群(CC)型及毒力基因。结果2002—2020年广西53.8%单增李斯特菌分离株来源于肉与肉制品,59.0%分离株来自于谱系Ⅱ,优势ST型为ST8和ST9。79.4%菌株携带LIPI-1基因(hly、prfA、plcA、plcB、mpl、actA),83.7%菌株携带LIPI-2基因(inlC、inlF、inlJ、inlK)。17.6%菌株携带LIPI-3基因(llsA、llsB、llsD、llsG、llsH、llsP、llsX、llsY)。结论肉与肉制品是广西单增李斯特菌检出率最高的食品类型,分子分型结果证实了单增李斯特菌种群具有高度的遗传多样性,WGS的高分辨力可用于监测食源性单增李斯特菌病的暴发。毒力基因的分布表明广西单增李斯特菌存在不同程度毒力基因的缺失,应警惕高致病性的菌株引起的食源性暴发事件。

2016年广西壮族自治区食源性沙门菌的耐药性与耐药谱研究

目的了解广西壮族自治区食源性沙门菌耐药状况,建立广西壮族自治区食源性沙门菌耐药性数据库。方法对2016年从广西壮族自治区各市县收集的分离自食品的70株沙门菌和分离自腹泻患者的234株沙门菌采用微量肉汤法对8类14种抗生素进行耐药性试验,开展耐药谱研究。结果所有沙门菌菌株均对亚胺培南敏感,对其余13种抗生素产生不同程度的耐药。70株食品来源的沙门菌对四环素耐药率最高(45.71%,32/70);234株腹泻患者来源的沙门菌对氨苄西林耐药率最高(70.94%,166/234),其次为四环素(70.09%,164/234)。腹泻患者来源沙门菌对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、四环素、萘啶酸、头孢噻肟和头孢唑啉的耐药率均高于食品分离株,差异有统计学意义(P<0.05)。2种来源的沙门菌耐药谱广泛,共同耐药谱为ACTT/S(耐氨苄西林-氯霉素-四环素-甲氧苄啶/磺胺甲噁唑)。结论广西壮族自治区食源性沙门菌耐药状况不容乐观,特别是对青霉素类、氯霉素类、磺胺类、四环素类抗生素严重耐药,提示应对其加强监测,建立科学的防控策略。

广西鼠伤寒沙门菌1,4,[5],12∶i∶-耐药性及分子分型特征研究

目的通过研究2018年广西壮族自治区食源性鼠伤寒沙门菌单相变体1,4,[5],12∶i∶-(S.1,4,[5],12∶i∶-)耐药情况和分子分型特征,建立广西壮族自治区食源性S.1,4,[5],12∶i∶-数据库。方法对来自病例监测和食品监测分离的124株S.1,4,[5],12∶i∶-用微量肉汤稀释法进行药敏试验,用脉冲电场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果124株S.1,4,[5],12∶i∶-均对亚胺培南敏感,对另外13种抗生素产生不同程度的耐药,对四环素耐药率最高(96.8%,120/124),其次为氨苄西林(95.2%,118/124),三重及以上耐药率为26.6%(33/124)。47.1%S.1,4,[5],12∶i∶-分离株具有氨苄西林、氯霉素、磺胺类、四环素(ACSuT)多重耐药。PFGE结果分为104种带型,相似度为72.9%~100%,优势带型为JPXX01.GX0114(5株)和JPXX01.GX0294(4株),均来源于食源性疾病监测。结论广西壮族自治区S.1,4,[5],12∶i∶-耐药情况不容乐观,特别对青霉素类和四环素类耐药严重。S.1,4,[5],12∶i∶-分子型别呈高度散发状态,及时对S.1,4,[5],12∶i∶-进行分子溯源,可以提高广西壮族自治区在散发病例中识别潜在的食源性S.1,4,[5],12∶i∶-暴发事件的能力。

广西食源性鼠伤寒沙门菌血清型和分子特征研究

目的掌握广西食源性沙门菌优势血清型,建立广西食源性沙门菌优势血清型脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱资料库。方法对2015年收集的菌株进行血清分型,用PFGE方法对优势血清型鼠伤寒沙门菌进行分子分型,结合相关流行病学信息进行分析。结果 2015年从广西共收集到330株沙门菌,80株经血清学鉴定为鼠伤寒沙门菌,其中哨点医院病例中77株,食品中3株。80株鼠伤寒沙门菌经Xba I酶切分为67种型别,其中24株菌11种型别同源性分别达到100%,优势型别为JEX001.CN0056(3株)和JEX001.CN0062(3株)。36株菌26种型别同源性达到96%以上,JEX001.CN0015为食品分离株与腹泻病例株完全匹配型别。结论鼠伤寒沙门菌是2015年广西食源性沙门菌的优势血清型,呈高度散发状态。食品分离株与临床株之间同源性不高,但大部分散发腹泻菌株具有高度同源性。

2021年广西腹泻病人来源的鼠伤寒沙门菌及其单相变种比较分析

目的通过研究比较2021年广西壮族自治区腹泻病人来源的鼠伤寒沙门菌及其单相变体1,4,[5],12∶i∶-(S.1,4,[5],12∶i∶-)流行特征与耐药情况,更好地了解鼠伤寒沙门菌及其单相变体多重耐药克隆的流行病学及其在传播的潜力。方法对来自病例监测分离的276株鼠伤寒沙门菌用血清凝集方法进行第一次分型,当第二项鞭毛抗原诱导三次后依然不凝集,再用多重PCR的方法进行第二次分型,用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果经多重PCR确认为鼠伤寒沙门菌单相变体的有201株(72.8%),鼠伤寒沙门菌75株。鼠伤寒沙门菌对磺胺类药物、氯霉素的耐药率显著高于鼠伤寒沙门菌单相变体(P<0.05)。鼠伤寒沙门菌单相变体对氨苄西林、头孢噻肟、萘啶酸、庆大霉素、四环素5种抗生素的耐药率显著高于鼠伤寒沙门菌(P<0.05)。两种沙门菌对3类及以上抗生素耐药率达到79%以上,共同多重优势耐药谱为耐氨苄西林、氯霉素、甲氧苄啶/磺胺甲唑和四环素。结论鼠伤寒沙门菌单相变体已经超过鼠伤寒沙门菌成为广西壮族自治区腹泻病人中最优势的血清型。两种沙门菌耐药情况不容乐观,特别是多重耐药菌株的快速增加。需要有针对性地加强对食源性鼠伤寒沙门菌和鼠伤寒沙门菌单相变体进行耐药监测,揭示其耐药性的潜在决定因素,并展开有效的干预措施。

十字花科黑腐病菌hrp基因致病功能分析

通过对Xcc 8004菌株的hrp基因进行逐一敲除,系统研究单个hrp基因对Xcc致病性的贡献。结果表明,9个hrc(hypersensitive response and conserved)基因单独突变后在满身红萝卜上的致病性和在辣椒ECW-10R上激发HR的能力完全丧失;9个hrp基因中,hrpW突变后在辣椒ECW-10R上仍能产生HR,满身红萝卜上致病性减弱,其余hrp基因突变后致病性和过敏反应均丧失;4个hpa(hrp associated protein)基因突变后,hpaA和hpaB突变体完全丧失在满身红萝卜上的毒性也不能在辣椒ECW-10R上引起HR,hpa1和hpaP突变后致病性和HR显著减弱。另外,通过RT-PCR对Xcc 8004 hrp基因簇的每个基因受hrpX和hrpG的调控情况进行分析,结果表明所有hrp基因在不同程度上都受到hrpG、hrpX的正向调控。

2014年广西牡蛎诺如病毒污染状况调查

目的调查广西养殖场、农贸市场、餐饮场所牡蛎中GⅠ型、GⅡ型诺如病毒的污染状况,了解广西牡蛎从养殖到餐桌各环节诺如病毒的污染情况。方法 2014年1-12月,在广西北海市两个养殖场、南宁市农贸市场及餐饮场所连续采集牡蛎样本480份,采用荧光RT-PCR法对样本中诺如病毒进行检测,确定牡蛎中诺如病毒污染状况及基因型分布。结果 480份牡蛎样本诺如病毒总检出率为11.04%(53/480),餐饮场所牡蛎样本未检出诺如病毒,养殖场及农贸市场牡蛎样本诺如病毒检出率分别为15.83%(38/240)、12.50%(15/120),检出的诺如病毒均为GⅡ型;春、夏、秋、冬四个季节牡蛎中诺如病毒检出率依次为13.33%、6.67%、7.50%、16.67%。养殖场与农贸市场牡蛎诺如病毒检出率差异无统计学意义(P>0.05),养殖场及农贸市场牡蛎诺如病毒检出率显著高于餐饮场所(P<0.01),冬季牡蛎诺如病毒检出率显著高于夏、秋季(P<0.05)。结论广西养殖场及农贸市场牡蛎诺如病毒污染情况较为严重,污染的诺如病毒均为GⅡ型,诺如病毒污染呈明显的季节性特点,以冬季污染最为严重。

应用多重实时荧光PCR方法确诊一起副溶血性弧菌所致食物中毒

目的采用多重实时荧光PCR对一起疑似食物中毒的样本进行快速检测,结合病原学的结果,确定病原体。方法2015年5月广西东兰县发生了一起疑似细菌性食物中毒。应用多重实时荧光PCR方法对留存食品和患者肛拭子标本进行副溶血性弧菌4种毒力基因的检测,同时对样本进行病原学检测。结果共检测15份食品样本和12份肛拭子标本,除了从1份肛拭子标本中分离培养出O3∶K6副溶血性弧菌外,其余标本均未分离出食源性致病菌。从8份肛拭子标本中检出副溶血性弧菌毒力基因,其中所有菌株均携带tdh、tlh和orf8基因,3株携带trh基因。结论这是广西首次利用多重实时荧光PCR技术确诊由副溶血性弧菌引起的食物中毒。多重实时荧光PCR方法可以同时鉴定和检测副溶血性弧菌及其毒力基因,具有快速、灵敏、准确的优点,可为食源性暴发事件提供快速、可靠的检测结果。

广西北部湾经济区2016—2018年沙门菌血清种类的区位熵模型和偏离-份额分析法模型分析

目的通过分析广西北部湾经济区食源性和人源沙门菌的空间分布和增长情况,为预防和控制沙门菌引起的疾病提供科学参考。方法以北部湾经济区为研究区域,采用2016—2018年的沙门菌血清种类数据,通过构建区位熵(LQ)模型和偏离-份额分析法(SSM)模型,有效获取沙门菌的区位熵和区域增长份额、沙门菌构成偏离份额和区位偏离份额的数值。结果根据LQ模型,北部湾经济区沙门菌的区位熵大于1的种类有两种:鼠伤寒沙门菌(区位熵为1.05)和肠炎沙门菌(区位熵为1.19)。根据SSM模型,北部湾经济区鼠伤寒沙门菌的总偏离量为23.50株,肠炎沙门菌的总偏离量为4.18株,增长速度均快于广西沙门菌总体的增长速度。结论北部湾经济区沙门菌区域集聚水平比较高的种类是鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌。北部湾经济区鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌具备种类优势且具有很强的增长趋势。

餐饮从业人员携带金黄色葡萄球菌耐药性及相关基因研究

目的研究餐饮从业人员携带的金黄色葡萄球菌的耐药性及相关基因情况。方法采用药敏试验和基因检测方法,对广西部分餐饮从业人员携带的金黄色葡萄球菌耐药性及其相关基因进行分析。结果从分离的118株金黄色葡萄球菌中检出多重耐药金黄色葡萄球菌(MDRSA)76株,检出率为64.41%。MDRSA耐消毒剂基因qacA/B检出率为42.1%,毒力基因以Tst和Seb为主,检出率分别为17.11%和46.05%。结论餐饮业人员携带的金黄色葡萄球菌中MDRSA占比较高,耐消毒剂基因qacA/B检出率也比较高,提示对餐饮业人员应加强人体带菌情况监管。

广西自治区2016～2018年沙门氏菌监测数据的SSM分析

目的通过分析广西南宁市和贵港市的食源性和人源鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌的监测数据,为科学防控沙门氏菌引起区域性疾病提供参考依据。方法选择2016～2018年南宁市13个监测点和贵港市6个监测点收集的沙门氏菌监测数据,通过构建偏离-份额分析法模型,有效获取鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌的区域增长份额、沙门氏菌构成偏离份额和区位偏离份额的数值。结果南宁市鼠伤寒沙门氏菌的总偏离量为2.47株,贵港市肠炎沙门氏菌的总偏离量为6.96株;南宁市鼠伤寒沙门氏菌的区位偏离份额为-6.54株,贵港市肠炎沙门氏菌的区位偏离份额为6.88株。结论在2016～2018年间,南宁市鼠伤寒沙门氏菌、贵港市肠炎沙门氏菌增长迅速,均超过广西沙门氏菌的增长速度;南宁市鼠伤寒沙门氏菌和贵港市肠炎沙门氏菌具备种类优势。

十字花科黑腐病菌hrpW基因的功能鉴定

十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)8004菌株基因组中XC_3023注释为Hrp W蛋白基因。本研究利用生物信息学和分子生物学技术,对hrp W基因进行功能鉴定。生物信息学分析发现Hrp W蛋白具有Harpin特征:含有果胶裂解酶结构域,为酸性蛋白,富含甘氨酸和丝氨酸。转录分析结果发现hrp W基因自身有一较弱的启动子,受MMX基本培养基诱导表达。共转录分析结果表明hrp W基因与上游hrp E、hpa B基因共同转录。Western blotting和转运分析结果显示,Hrp W蛋白受Ⅲ型分泌系统(typeⅢsecretion system,T3SS)依赖分泌,但不转运。植株试验结果发现纯化的Hrp W蛋白能在烟草上诱发过敏反应(hypersensitive reaction,HR)。这些结果揭示XC_3023编码蛋白Hrp W为Ⅲ型分泌系统分泌的Harpin蛋白。

2014-2019年南宁市人源性沙门菌监测数据的S-SSM和D-SSM模型分析

目的通过分析2014-2019年广西壮族自治区南宁市人源性沙门菌监测数据,了解鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌的增长趋势,为公共卫生动态监管提供技术参考。方法以南宁市为研究区域,通过建立静态偏离-份额分析法和动态偏离-份额分析法模型,计算得出鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌的区域增长份额、构成偏离份额和区位偏离份额。结果根据静态偏离-份额分析法模型,南宁市鼠伤寒沙门菌的总偏离量为-9.14株,其增长速度慢于广西壮族自治区沙门菌总体的增长速度;肠炎沙门菌的总偏离量为+6.93株,其增长速度快于广西壮族自治区沙门菌总体的增长速度。根据动态偏离-份额分析法模型,南宁市鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌各年份的区域增长份额均为正值,均经历先下降最后再上升的过程;在2016年、2017年、 2019年南宁市鼠伤寒沙门菌总偏离量为负值,在2015年、2018年、2019年南宁市肠炎沙门菌总偏离量为正值。结论南宁市肠炎沙门菌具有增长优势,而鼠伤寒沙门菌没有增长优势。

广西西江经济带人源性沙门菌数据的动态偏离-份额分析

目的通过动态分析2015-2019年的广西西江经济带人源性沙门菌的增长情况,为预防和控制沙门菌引起的疾病提供科学参考。方法以西江经济带为研究区域,通过构建动态偏离-份额分析法模型,获取人源性沙门菌的区域增长份额、构成偏离份额和区位偏离份额。结果从2015-2019年的合计数看,西江经济带的肠炎沙门菌的总偏离量(+6.943株)、伦敦沙门菌的总偏离量(+0.725株)、火鸡沙门菌的总偏离量(+0.575)均为正值,总偏离量符号为“+”表明该沙门菌属血清型的增长速度快于广西沙门菌总体的增长速度;西江经济带的鼠伤寒沙门菌的总偏离量(-42.794株)、斯坦利沙门菌的总偏离量(-3.401株)、德尔卑沙门菌的总偏离量(-7.552株)、阿贡纳沙门菌的总偏离量(-6.127株)、韦太夫雷登沙门菌的总偏离量(-0.425株)、科特布斯沙门菌的总偏离量(-6.275株)均为负值,总偏离量符号为“-”表明该沙门菌属血清型的增长速度慢于广西沙门菌总体的增长速度。从时间序列看,西江经济带的鼠伤寒沙门菌、斯坦利沙门菌、德尔卑沙门菌、阿贡纳沙门菌的总偏离量经历先下降然后上升最后再下降的过程,西江经济带的肠炎沙门菌、韦太夫雷登沙门菌、科特布斯沙门菌的总偏离量经历先上升然后下降最后再上升的过程,西江经济带的伦敦沙门菌、火鸡沙门菌的总偏离量经历先连续上升最后下降的过程。结论西江经济带的肠炎沙门菌、伦敦沙门菌、火鸡沙门菌是具有增长优势的沙门菌属血清型。