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来源于猕猴桃的柑橘叶斑驳病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析
被引量:
19
1
作者
朱晨熹
王国平
+4 位作者
郑亚洲
杨作坤
王利平
徐文兴
洪霓
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期11-16,共6页
柑橘叶斑驳病毒(Citrus leaf blotch virus,CLBV)为柑橘病毒属(Citrivirus)代表种。本研究采用RT-PCR技术从我国栽培猕猴桃上首次检测到CLBV.总检出率为13.3%。测定了5个CLBV分离物的外壳蛋白基因(coat protein gene,cp)序...
柑橘叶斑驳病毒(Citrus leaf blotch virus,CLBV)为柑橘病毒属(Citrivirus)代表种。本研究采用RT-PCR技术从我国栽培猕猴桃上首次检测到CLBV.总检出率为13.3%。测定了5个CLBV分离物的外壳蛋白基因(coat protein gene,cp)序列,全长均为1092核苷酸(nt),分离物间印基因核苷酸和编码氨基酸序列相似性分别为83.2%~99.7%和91.9%~98.9%,这些分离物与新西兰报道的CLBV猕猴桃分离物M3.A核苷酸序列相似性仅为83%左右,与来源于柑橘及近缘种的CLBV分离物印基因核苷酸序列相似性为84%-86%。在基于该病毒印基因核苷酸序列的系统进化树中,本研究所测定的CLBV猕猴桃分离物与新西兰报道的除M3-A外的猕猴桃分离物聚在同一组群。研究结果为进一步明确CLBV在我国猕猴桃上的侵染和危害特点及建立该病毒的分子检测技术提供了重要信息。
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关键词
猕猴桃
柑橘叶斑驳病毒
检测
序列分析
原文传递
猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究
被引量:
8
2
作者
郑亚洲
王国平
+4 位作者
周菊芳
朱晨熹
王利平
徐文兴
洪霓
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期665-671,共7页
为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的...
为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的6种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。发现Ac VA的ORF1、ORF4和ORF5扩增片段序列存在较大分子变异,不同分离物的269 bp片段(ORF1)核苷酸序列相似性为77.3%~99.3%。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中,Ac VA分离物聚为2~3组。采用引物Ac VB5F/5R扩增获得20个Ac VB分离物的342 bp或338 bp的ORF5片段,核苷酸序列相似性为81%~100%,与新西兰Ac VB分离物TP7-93B相应片段的核苷酸序列相似性为83.9%~99.7%,在系统进化树中聚为3组。
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关键词
猕猴桃
猕猴桃病毒A
猕猴桃病毒B
RT-PCR
序列分析
原文传递
题名
来源于猕猴桃的柑橘叶斑驳病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析
被引量:
19
1
作者
朱晨熹
王国平
郑亚洲
杨作坤
王利平
徐文兴
洪霓
机构
华中农业大学植物科技学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室
华中农业大学农业微生物学国家重点实验室
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期11-16,共6页
基金
国家农业行业专项计划项目(nyhyzx200903017-08)
文摘
柑橘叶斑驳病毒(Citrus leaf blotch virus,CLBV)为柑橘病毒属(Citrivirus)代表种。本研究采用RT-PCR技术从我国栽培猕猴桃上首次检测到CLBV.总检出率为13.3%。测定了5个CLBV分离物的外壳蛋白基因(coat protein gene,cp)序列,全长均为1092核苷酸(nt),分离物间印基因核苷酸和编码氨基酸序列相似性分别为83.2%~99.7%和91.9%~98.9%,这些分离物与新西兰报道的CLBV猕猴桃分离物M3.A核苷酸序列相似性仅为83%左右,与来源于柑橘及近缘种的CLBV分离物印基因核苷酸序列相似性为84%-86%。在基于该病毒印基因核苷酸序列的系统进化树中,本研究所测定的CLBV猕猴桃分离物与新西兰报道的除M3-A外的猕猴桃分离物聚在同一组群。研究结果为进一步明确CLBV在我国猕猴桃上的侵染和危害特点及建立该病毒的分子检测技术提供了重要信息。
关键词
猕猴桃
柑橘叶斑驳病毒
检测
序列分析
Keywords
Actinidia spp.
Citrus leaf blotch virus
RT-PCR
sequence analysis
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究
被引量:
8
2
作者
郑亚洲
王国平
周菊芳
朱晨熹
王利平
徐文兴
洪霓
机构
华中农业大学植物科技学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室
农业微生物学国家重点实验室
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期665-671,共7页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项项目(nyhyzx200903017-08)
文摘
为明确猕猴桃病毒A(Actinidia virus A,Ac VA)和猕猴桃病毒B(Actinidia virus B,Ac VB)在中国猕猴桃(Actinidia sp.)上的侵染状况和分子特性,采用RT-PCR技术对151份猕猴桃样品的Ac VA和Ac VB进行检测,检出率分别为15.2%和17.9%,所收集的6种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。发现Ac VA的ORF1、ORF4和ORF5扩增片段序列存在较大分子变异,不同分离物的269 bp片段(ORF1)核苷酸序列相似性为77.3%~99.3%。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中,Ac VA分离物聚为2~3组。采用引物Ac VB5F/5R扩增获得20个Ac VB分离物的342 bp或338 bp的ORF5片段,核苷酸序列相似性为81%~100%,与新西兰Ac VB分离物TP7-93B相应片段的核苷酸序列相似性为83.9%~99.7%,在系统进化树中聚为3组。
关键词
猕猴桃
猕猴桃病毒A
猕猴桃病毒B
RT-PCR
序列分析
Keywords
Actinidia
Actinidia virus A
Actinidia virus B
RT-PCR
sequence analysis
分类号
S436.634.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
来源于猕猴桃的柑橘叶斑驳病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析
朱晨熹
王国平
郑亚洲
杨作坤
王利平
徐文兴
洪霓
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
19
原文传递
2
猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究
郑亚洲
王国平
周菊芳
朱晨熹
王利平
徐文兴
洪霓
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
8
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