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冬虫夏草菌(Ophiocordyceps sinensis)基因组测序及高含量重复序列功能探讨
1
作者
朱佳馨
刘彤瑶
+5 位作者
杜明昊
朱桔颖
李全平
李文佳
杨恩策
刘杏忠
《今日药学》
CAS
2023年第7期499-503,共5页
目的本研究旨在获取高质量的冬虫夏草菌基因组,为研究冬虫夏草菌生物学及与宿主互作等提供重要支撑。方法利用PacBio SequelⅡ平台的HiFi测序技术对冬虫夏草菌基因组进行测序,完成组装及注释。结果本研究获得的冬虫夏草菌基因组质量目...
目的本研究旨在获取高质量的冬虫夏草菌基因组,为研究冬虫夏草菌生物学及与宿主互作等提供重要支撑。方法利用PacBio SequelⅡ平台的HiFi测序技术对冬虫夏草菌基因组进行测序,完成组装及注释。结果本研究获得的冬虫夏草菌基因组质量目前处于最优水平,基因组完整度为97.7%、准确度高于99.9%,基因组大小为111.24 Mb,重复序列含量达到了81.3%,其中长末端重复序列反转录转座子占基因组总长度的62.2%,同时,根据其他生物中的研究对冬虫夏草菌反转录转座子长末端重复序列的潜在功能进行了讨论。结论本研究获得了高质量的冬虫夏草菌基因组,为研究冬虫夏草菌生物学及与宿主互作奠定了基础。
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关键词
冬虫夏草菌
基因组
长末端重复序列
原文传递
题名
冬虫夏草菌(Ophiocordyceps sinensis)基因组测序及高含量重复序列功能探讨
1
作者
朱佳馨
刘彤瑶
杜明昊
朱桔颖
李全平
李文佳
杨恩策
刘杏忠
机构
北京大学基础医学院
南开大学生命科学学院
中国科学院微生物所真菌学国家重点实验室
东莞市东阳光冬虫夏草研发有限公司
出处
《今日药学》
CAS
2023年第7期499-503,共5页
基金
中央高校基本科研业务费专项资金资助(030/C02922104)。
文摘
目的本研究旨在获取高质量的冬虫夏草菌基因组,为研究冬虫夏草菌生物学及与宿主互作等提供重要支撑。方法利用PacBio SequelⅡ平台的HiFi测序技术对冬虫夏草菌基因组进行测序,完成组装及注释。结果本研究获得的冬虫夏草菌基因组质量目前处于最优水平,基因组完整度为97.7%、准确度高于99.9%,基因组大小为111.24 Mb,重复序列含量达到了81.3%,其中长末端重复序列反转录转座子占基因组总长度的62.2%,同时,根据其他生物中的研究对冬虫夏草菌反转录转座子长末端重复序列的潜在功能进行了讨论。结论本研究获得了高质量的冬虫夏草菌基因组,为研究冬虫夏草菌生物学及与宿主互作奠定了基础。
关键词
冬虫夏草菌
基因组
长末端重复序列
Keywords
Ophiocordyceps sinensis
genome
long terminal repeats
分类号
R931 [医药卫生—生药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
冬虫夏草菌(Ophiocordyceps sinensis)基因组测序及高含量重复序列功能探讨
朱佳馨
刘彤瑶
杜明昊
朱桔颖
李全平
李文佳
杨恩策
刘杏忠
《今日药学》
CAS
2023
0
原文传递
已选择
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